| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009273 | 4,303,167 | Δ450 bp | 100% | coding (1‑450/450 nt) | rpiB → | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009273 | 4303167 | 4303616 | 450 | 54 [0] | [0] 54 | rpiB | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 4303166 | 0 (0.000) | 53 (0.880) | 47/270 | NT | 100% | intergenic (‑358/‑1) | alsR/rpiB | d‑allose‑inducible als operon transcriptional repressor; autorepressor; repressor of rpiR/ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase |
| ? | CP009273 | 4303617 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/‑68) | rpiB/yjdP | ribose 5‑phosphate isomerase B/allose 6‑phosphate isomerase/putative periplasmic protein | |||||
GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303016‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC > CP009273/4303617‑4303762 GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTTATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGAT > 1:1028950/1‑149GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATG < 2:156406/150‑1 ATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGAT > 2:507264/1‑148 AGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCA > 1:496639/1‑150 AGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGAGTTTTTAATTCATTAACATCACACATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCA > 2:505400/1‑150 TGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATC < 1:1029724/150‑1 TAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACT < 2:385082/148‑1 TTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATG < 1:717108/149‑1 TTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCAT < 1:605321/148‑1 CGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATG < 1:866398/150‑1 GTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGT > 2:850465/1‑149 ATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGAT > 1:123348/1‑150 TAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTA < 2:907189/149‑1 ACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAAT < 2:473606/149‑1 TCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTG > 1:845571/1‑150 CAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTT > 1:694481/1‑150 AGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTT < 1:631957/150‑1 GGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTT < 2:373622/150‑1 AGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAG < 1:895592/150‑1 AATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGC > 2:668262/1‑150 ATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAAC < 2:651826/150‑1 TTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACG < 1:396982/150‑1 GGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTC > 2:7305/1‑150 GGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTC > 2:1062062/1‑150 GTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCC < 2:166561/150‑1 TGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCG > 2:448900/1‑150 TGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCG > 1:776114/1‑150 TTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGC > 1:312174/1‑149 ATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTA > 1:51877/1‑150 ACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCA > 2:333821/1‑150 TCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGCAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCC > 1:279233/1‑150 ACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCT < 2:155841/149‑1 ACAAATGTTTTTTGATTGCGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGCGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTG > 2:92523/1‑150 AAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCT < 1:507264/150‑1 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGC > 1:743652/1‑150 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGC > 1:702931/1‑150 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACG < 2:123348/149‑1 TTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACG < 1:145026/149‑1 TTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCT > 2:594634/1‑150 TTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCT < 1:668262/149‑1 GATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCA > 2:276018/1‑150 GATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCA > 1:568352/1‑150 ATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCAC > 1:995593/1‑150 TTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTG > 2:8876/1‑135 TGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGC < 1:8876/135‑1 AAGTTTTGCGCGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTC < 1:1062062/149‑1 AAGTTTTGCAAGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCC < 1:493115/150‑1 AGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCG > 2:469207/1‑150 GTTTTGCACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGG > 1:675164/1‑150 CACGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAG < 1:59662/149‑1 CGGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCC > 1:66810/1‑150 GGACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCC > 1:544542/1‑149 GACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGA > 2:166999/1‑150 ACGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGA > 2:196614/1‑149 CGGGGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATA > 1:1025688/1‑150 GGAAGATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTA > 1:365889/1‑150 ATGAGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC < 1:198465/150‑1 GATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAACATCACAAATGTTTTTTGATTGTGAAGTTTTGCACGGACGGGGAAGATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/4303016‑4303166‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgaGATTCATCCACTACTTGCATGGATGAGTAATGATTAATGTGGATAGAGTTTCTTTTTGAGGTTGGCTAATGAAACGCTTTCCGCTATTTCTTTTATTCACCCTGCTCACGCTGTCCACCGTTCCGGCCCAGGCCGATATTATCGAC > CP009273/4303617‑4303762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |