| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1485085 | 57 (0.890) | 38 (0.960) +GTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC |
32/170 | NT | 68.4% | intergenic (‑115/‑74) | gapC/cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
| ? | CP009273 | = 1857027 | 0 (0.000) | intergenic (‑341/‑1) | msrB/gapA | methionine sulfoxide reductase B/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A | |||||
GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1484940‑1485085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCT < CP009273/1857027‑1856881 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGA < 1:276037/150‑1 CCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATG > 2:649675/1‑150 AAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTG > 2:266705/1‑150 ACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCC < 1:516850/150‑1 CGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAA > 2:267643/1‑150 CGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAA > 1:37633/1‑150 GTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAAC < 1:113126/150‑1 AATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:810657/1‑150 CAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:923411/1‑150 ACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 2:743945/150‑1 CTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:932843/150‑1 ATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 2:138765/150‑1 ATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:566215/150‑1 TGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 2:759829/1‑150 TTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 2:140903/150‑1 TTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:142518/1‑150 CCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 2:11816/1‑150 CTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:959239/148‑1 CTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:41217/147‑1 CTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:920662/147‑1 CTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:1045878/147‑1 AGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 2:879961/1‑150 AGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 2:425198/1‑150 AGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:797256/150‑1 GAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT < 2:773267/150‑1 TTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATA < 1:641188/150‑1 CGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATT > 1:186502/1‑150 CGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATT > 1:470738/1‑150 GGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATT < 2:838676/149‑1 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1:649675/149‑1 ATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATT < 2:875608/149‑1 CTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGT < 1:657386/149‑1 TCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGT > 2:1040664/1‑150 TCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTA < 2:717846/148‑1 CCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCTATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGATGATGCTGCCATCTTCCTGATTTATTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGT < 2:405382/149‑1 agGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAA < 1:496333/148‑1 agGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTT > 1:4152/3‑144 agGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGAGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTGCTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATAGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGGGAA < 2:458980/148‑1 gGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTA < 2:4152/143‑1 AGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAG > 1:829530/1‑150 GACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAG < 1:665052/149‑1 GACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCCCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGG > 2:887197/1‑150 ATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTG < 1:759829/150‑1 ATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTG < 1:186674/150‑1 ATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTG > 1:985080/1‑150 GGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAA > 1:735231/1‑150 GGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTAC > 2:1023087/1‑149 GGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACA > 1:638145/1‑149 ATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAAC < 1:267643/150‑1 CCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTA > 2:959510/1‑150 CATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCT < 1:266705/147‑1 CATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACC < 2:142518/146‑1 CATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACC < 1:810657/146‑1 TGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCATCTTGCTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGGGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAAGTACAAAAACCTTCCGAAGCATCAAG < 2:921775/150‑1 AAACGTAACGTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGC < 2:1043846/149‑1 GTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGT > 1:894471/1‑150 GTACTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGT < 2:735231/150‑1 CTGAAAACGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAA > 2:13279/1‑150 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ATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGA > 2:143985/1‑150 TGGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGA > 2:424676/1‑150 GGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGAC > 2:389939/1‑150 GGTGTTTTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGAC > 2:129174/1‑150 TTTGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCC < 1:425198/149‑1 TGAGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCA > 2:187357/1‑150 AGGTGCTCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACT > 1:16072/1‑150 TCCATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCT > 1:958999/1‑150 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1484940‑1485085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATATTCCACCAGCTATTTGTTAGTGAATAAAAGGTTGCCTGTAAAATTACAAAAACCTTACGCAGCGTCAAGCGGAATCGTGTCAATCATTGCGACAAATCAATCCTGTGCCTAAGCATTACGCGACTGACTCGCCTCACTCTTCCT < CP009273/1857027‑1856881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |