| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1485085 | 57 (0.890) | 38 (0.960) +GTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC |
32/170 | NT | 68.4% | intergenic (‑115/‑74) | gapC/cybB | pseudogene, GAP dehydrogenase; glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase (second fragment)/cytochrome b561 |
| ? | CP009273 | = 1857027 | 0 (0.000) | intergenic (‑341/‑1) | msrB/gapA | methionine sulfoxide reductase B/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase A | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTGCG > CP009273/1484936‑1485234 | aTACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACggg < 1:568220/150‑1 (MQ=255) cGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTg > 1:199105/1‑149 (MQ=255) aaaCCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctg > 2:266705‑M1/1‑141 (MQ=255) cGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaa > 2:267643‑M1/1‑137 (MQ=255) cGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATAttt > 1:512264/1‑149 (MQ=255) gTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaac < 1:113126‑M1/150‑15 (MQ=255) aaTACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaactta > 2:810657‑M1/1‑133 (MQ=255) ccAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAAtt < 1:32456/150‑1 (MQ=255) cAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAAttt > 1:111577/1‑150 (MQ=255) aCTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgattt < 2:743945‑M1/150‑25 (MQ=255) aCTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTg < 1:593295/150‑1 (MQ=255) cTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgattta < 1:932843‑M1/150‑26 (MQ=255) tttACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAAtttt > 1:381256/1‑147 (MQ=255) cTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGaa > 1:395859/1‑148 (MQ=255) aTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:138765‑M1/150‑34 (MQ=255) aTGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGcc > 2:165736/1‑150 (MQ=255) tGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgat > 2:759829‑M1/1‑116 (MQ=255) gTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCg < 2:346825/149‑1 (MQ=255) ttttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt < 2:140903‑M1/150‑38 (MQ=255) tttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTa > 2:525428/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt > 1:142518‑M1/1‑111 (MQ=255) ctcCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATg < 2:178174/149‑1 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:959239‑M1/148‑43 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:41217‑M1/147‑42 (MQ=255) cTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:920662‑M1/147‑42 (MQ=255) tCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAAc < 1:550226/148‑1 (MQ=255) aGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 2:879961‑M1/1‑101 (MQ=255) gAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct < 2:773267‑M1/150‑52 (MQ=255) gAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGaaaa > 1:197220/1‑150 (MQ=255) aCGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAAtt < 2:683182/150‑1 (MQ=255) ttCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccata < 1:641188‑M1/150‑57 (MQ=255) cGGATGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatatt > 1:186502‑M1/1‑92 (MQ=255) tGAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 1:1043846‑M1/1‑88 (MQ=255) gAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 2:186674‑M1/1‑87 (MQ=255) gAAAATTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccac > 2:496333‑M1/1‑87 (MQ=255) aaaTTGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccag > 1:141671‑M1/1‑85 (MQ=255) ttGATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGa > 2:735159/1‑149 (MQ=255) gATCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctat < 1:649675‑M1/149‑70 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatt < 2:875608‑M1/149‑71 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAAt < 1:56129/149‑1 (MQ=255) aTCCTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATg < 2:199105/150‑1 (MQ=255) ccTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACAGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGt > 1:462525/1‑149 (MQ=255) cTTTCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgt < 1:657386‑M1/149‑74 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagt > 2:1040664‑M1/1‑73 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgtta < 2:717846‑M1/148‑76 (MQ=255) tCCAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATg < 1:727591/149‑1 (MQ=255) tCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATg < 2:197220/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCTATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGatgatgctgccatcttcctgatttattgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagt < 2:405382‑M1/149‑78 (MQ=255) ccAGGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATgg > 1:387444/1‑149 (MQ=255) aggctTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaa < 1:496333‑M1/148‑81 (MQ=255) aggctTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgtt > 1:4152‑M1/3‑70 (MQ=255) aggctTAGACCAGGATGGCGGGATGAGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTGCTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatagtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagggaa < 2:458980‑M1/148‑81 (MQ=255) ggcTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgtta < 2:4152‑M1/143‑76 (MQ=255) gCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAaaat < 2:45533/150‑1 (MQ=255) aGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAaaataa < 2:111577/148‑1 (MQ=255) aGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAaaataa < 1:164919/148‑1 (MQ=255) gACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAaataaata < 2:461438/150‑1 (MQ=255) aCCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAatat > 2:342780/1‑150 (MQ=255) aGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATAttaa < 1:608250/150‑3 (MQ=255) aGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCa < 1:165736/150‑1 (MQ=255) gATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAg < 1:611798/150‑1 (MQ=255) gATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAg > 2:583583/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctg < 1:186674‑M1/150‑95 (MQ=255) aTGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgggatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggggtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctg > 1:985080‑M1/1‑56 (MQ=255) tGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGt < 1:301412/150‑1 (MQ=255) gCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGtt < 1:762195/149‑1 (MQ=255) gCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTa > 1:311861/1‑150 (MQ=255) gggATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaa > 1:735231‑M1/1‑51 (MQ=255) gATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACaaa < 2:849147/150‑1 (MQ=255) aTGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAAt > 1:920333/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAAt > 2:112991/1‑150 (MQ=255) gggCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattac > 2:1023087‑M1/1‑46 (MQ=255) gggCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATg > 2:825677/1‑117 (MQ=255) ggCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGt < 1:825677/117‑1 (MQ=255) ggCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAg < 1:636879/150‑1 (MQ=255) aTCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaac < 1:267643‑M1/150‑110 (MQ=255) cATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaacct < 1:266705‑M1/147‑112 (MQ=255) cATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaacc < 1:810657‑M1/146‑111 (MQ=255) aTTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCActgg > 1:152368/1‑150 (MQ=255) ttCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCActggc > 1:182095/1‑150 (MQ=255) ctcACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCAATCGctggct < 2:1049161/149‑1 (MQ=255) aGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCtt > 1:135013/1‑150 (MQ=255) aGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCtt > 1:593231/1‑150 (MQ=255) tGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccatcttgctgatttagtgtatgatggtgtttttggggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaagtacaaaaaccttccgaagcatcaag < 2:921775‑M1/150‑126 (MQ=255) aaaCGTAACGTACTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagc < 2:1043846‑M1/149‑127 (MQ=255) aacgtaacgtACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTAc < 2:152368/150‑1 (MQ=255) gtaCTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgt > 1:894471‑M1/1‑14 (MQ=255) cTGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgtcaa > 2:13279‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCg > 1:198172/1‑148 (MQ=255) tGAAAACGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgtcaat > 1:488647‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaCGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgtcaatcat > 1:11400‑M1/1‑7 (MQ=255) aaCGGGgtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgtcaatcatt < 2:923411‑M1/150‑145 (MQ=255) aaCGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTa < 1:268537/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTAtt > 2:799196/1‑150 (MQ=255) cGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTAtt > 1:519482/1‑150 (MQ=255) ggTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTgc > 1:72712/1‑150 (MQ=255) ggTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTgc > 2:25693/1‑150 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccatattccaccagctatttgttagtgaataaaaggttgcctgtaaaattacaaaaaccttacgcagcgtcaagcggaatcgtgtcaatcattgcga > 2:3220‑M1/1‑1 (MQ=255) gTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTgcg < 2:400508/150‑1 (MQ=255) gTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTgcg > 2:908290/1‑150 (MQ=255) | ATACGACCAAAACCGTTAATACCAACTTTACTCATGGTTTTCTCCTGTCAGGAACGTTCGGATGAAAATTGATCCTTTCCAAGCTTAGACCAGGATGGCGGGATGGGCAATCTCCATTCTCACAGTGAAACGTAACGTACTGAAAACGGGTGAACAATATTTAATGAAATTTTGAGAAAAGCCCGTTATGTTAACGGAAAATTATGTTAAAGCAGGAAATGTTATGGAAAATAAATATTCAAGGTTACAAATCAGCATTCACTGGCTGGTCTTTTTACTGGTTATCGCAGCGTATTGCG > CP009273/1484936‑1485234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |