| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | BA000036 | 1825711 = | 112 (1.200) | 120 (1.290) | 101/594 | 0.0 | 67.8% | intergenic (‑105/+37) | Cgl1731/Cgl1733 | Hypothetical protein/Putative transposase |
| ? | BA000036 | 1828006 = | 2 (0.020) | intergenic (‑1069/+1679) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGTAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1826008‑1825711‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTA > BA000036/1828006‑1828300 TGTAAGACACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAA > 1:63457/1‑300 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GTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCGATTGTCCTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGAC < 2:285340/300‑1 TGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACT < 1:292110/300‑1 TCCACCCTCCGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACT < 2:483459/298‑1 CGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAG < 1:514059/300‑1 CGGGGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAG > 1:5588/1‑300 GGGTCGGACCCAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTACTTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTC > 2:441997/1‑299 TGTAAGAAACTAGGGATCAGGCAGTCGATGGGATCAATTGGCACCAGTGCTGACAACGCTTTGGCGGAGTCTTTCAATGCCGCGATGAAGCGGGAAGTCCTGCAGGATTCCAAGACCTTTGAAAATCAATTGTGCTGTCGCCGGGACGTCTTCCGCTGGTGTACCCGTTACAACACGGTTCGCCGGCATTCCTGGTGTAGATATCTGGCTCCGGTCGTGTTTGAGGAGCGCGGTCCTGCTATCCTGAGATCTGCTTCCTGATCAAATCCTCCGTGTCCACCATCCGGGGGTCGGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BA000036/1826008‑1825711‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTA > BA000036/1828006‑1828300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |