New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BA000036 | = 1827003 | 79 (0.860) | 91 (0.990) | 72/594 | 0.3 | 68.9% | intergenic (‑66/+2682) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein |
? | BA000036 | = 1828008 | 3 (0.030) | intergenic (‑1071/+1677) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein |
GAGTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > BA000036/1826707‑1827003 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCTCAATATAATTGTTATGTAATTGACCATTAAGAGCCAATAGAGTACTGCCGTTTCAAAGTCACTAAAGGTTCTA < BA000036/1828008‑1827710 GAGTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTT < 1:442624/300‑1 GTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCT < 1:514507/300‑1 gGCATTTTCCTTTTCAAGTGGGCGGACCCGTGCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTT < 2:61508/299‑1 TCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTCATAGC > 1:281671/1‑300 aacTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGGGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCAAGCAGCATGCTTGTTTCAAGGGGTCCACCATCAGGGGGTAAGGTCCGTGCTGTAATCGCCTTTGAA > 2:211928/4‑299 GTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAG < 1:257157/300‑1 GTTGGAGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGACGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCGCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGAGACAGCGTCGCGCTTGAACTCATCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTACGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAG < 1:257163/300‑1 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CATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTCTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCATCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCCTTAATAGCACTTTAAAAGCTAGTAACTAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGTATTTTAACAGTCACTGAATGCGTTGGCTTATAAAAGGCTTTTAGGTCACTAGTAAAGGACGA > 2:319852/1‑300 ATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGAT < 2:293701/300‑1 CGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTA > 1:84067/1‑299 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gCGAGGGGCCGTCGGATTTATCGTATGGCGCGACAGGGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTGTCAAGGGGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAAAAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAAGATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTT < 2:421050/299‑1 TCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATACAGGCTTTT < 1:338397/300‑1 CGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGTCTTTT > 2:547316/1‑299 CGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTAACTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAACATCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGATTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATGAAGGaattt > 2:547304/1‑294 GAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTT < 1:83795/299‑1 cctgctgatTTCTCGTAGTGCGCGACACCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTTGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTGTTTAAGGATC < 1:150725/291‑1 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CGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCT > 1:18135/1‑300 CATGGTTGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCTCAATA < 2:366502/300‑1 TTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAATGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCCGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTACAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTACAAGGCTTTTAGGTCACTATTCAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGCCTCAATATAATTGTTATGTAATT > 1:275438/1‑299 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CCACCATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCTCAATATAATTGTTATGTAATGGACCATTAAGAGCAAATAGAGTACTGCAGTT > 1:242614/1‑300 ACCATGCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCTCAAGATAATTGTTATGTAATTGACCATTAAGAGCCAATAGAGTACTGCCGTTTC < 1:97710/300‑1 CATCCGGGGGTCAGGTCCGTTCTTTAATAGCCTTTTAAAAGCCAGTAACAAGGCAATTCAATTGACACTTAATAGCCTTTTAAAAGTCACTGAATGCGTTGGCTTTTAAAAGGCTTTTAGGTCACTATTAAAGGTCGATTAAATATTTATTCATAATGCGATAGATAAAGGCTTTTTAAGGATCAATTCAATCGTTAGTTAATCGACCTTTTAATATGCAGCAGAGTGAGTTGTTTCAAAGGCTCAATATAATTGTTATGTAATTGACCATTAAGAGCCAATAGAGTACTGCCGTTTCA > 1:348522/1‑299 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |