| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | BA000036 | = 1827003 | 79 (0.860) | 91 (0.990) | 72/594 | 0.3 | 68.9% | intergenic (‑66/+2682) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein |
| ? | BA000036 | = 1828008 | 3 (0.030) | intergenic (‑1071/+1677) | Cgl1734/Cgl1735 | Transposase/Hypothetical protein | |||||
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TAGAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATATTTAATTGACCTTTAAGTAACGATTATAAGGCAATTAATGTGACCAAATAAAGACACGTAACTGACTAATCTTTATCTGACTATTACAAGGCTTTAAAAGAGCACTTATGTGTCGATTAAGTGTCTACGCAATAACTGTGCTTTAAGAGGCTTTAAAAACTACAATTGAATCGACCACTAATCGTTACTTAAATGACTATTAACAAAAGTCACTTTTAGAGCA > BA000036/1827710‑1828305 | taagaaactagggatcaggcagtcgatgggatcacttggcaccagtgctgacaacgctttggcggcgtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtcgatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaacatccgggggtcggacccAaca > 1:292958‑M2/297‑300 (MQ=255)tAGAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAACAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAACAGGCTATTAAAGAACg < 2:178316‑M2/300‑2 (MQ=255) gAACCTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACgga < 1:184920‑M2/300‑4 (MQ=255) ccTTTAGTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacct > 2:387358‑M2/1‑294 (MQ=255) gTGACTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgaccc > 1:60070‑M2/1‑288 (MQ=255) gatcaggcagtcgatgggatcaattggcaccggtgctgacaacgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaatggtgctgtcgccggtacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGt < 1:82537‑M2/16‑1 (MQ=255) aCTTTGAAACGGCAGTACTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccg < 1:101647‑M2/299‑15 (MQ=255) 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aaCTGCAGTACTCTATTTGCTCTTAATGGTCCATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtgg > 1:242614‑M2/1‑278 (MQ=255) aCTCTATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttg < 2:8151‑M2/299‑31 (MQ=255) ctctATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaa > 1:440912‑M2/1‑268 (MQ=255) ctctATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaa > 1:349473‑M2/1‑268 (MQ=255) atctaTTGGCTCTTAATGTTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCATTGAAACAACTCACCCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaa > 2:320479‑M2/2‑268 (MQ=255) tctATTGGCTCTTAATGGTCAATTACATAACAATTATATTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaa < 2:542531‑M2/299‑33 (MQ=255) attggcaccagtgctgacaacgctttggcggattctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCACATATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGa > 2:504691‑M2/263‑300 (MQ=255) caccagtgctgacaacgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcacatcctccgtgtccaccatccgggggtcggccccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACctc > 2:186195‑M2/258‑299 (MQ=255) accagtgctgacaccgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACctct > 1:7617‑M2/257‑299 (MQ=255) ccagtgctgacaacgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTa > 1:536256‑M2/256‑299 (MQ=255) gctgacaacgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAgg > 1:352139‑M2/251‑299 (MQ=255) gctgacaacgctttggcggagtctttcaatgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAgg > 1:352151‑M2/251‑299 (MQ=255) 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tatTGAGCCTTTGAAACAACTCACTCTGCTGCATATTAAAAGGTCGATTAACTAACGATTGAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaaacaagcatgatgctgggaaaggtaatctgcaaccatg < 2:366502‑M2/300‑70 (MQ=255) tgccgcgatgaagcgggaagtcctgcaggattccaagacctttgaaaatcaattgtgctgtcgccgggacgtcttccgctggtgtacccgttacaacacggttcgccggcattcctggtgtagatatctggctccggtcgtgtttgaggagcgcggtcctgctatcctgagatctgcttcctgatcaaatcctccgtgtccaccatccgggggtcggacccAACACTCCCCTATTGTCTTTTAATCGTCACTTAATCGACCTCTAAAAGGTAACTAATTGACTCTTGAGTGACACATAtt < 1:309032‑M2/79‑1 (MQ=255) cTTTGAAACAACTCAATCGGCTGAATATGAAAAGGTCGATTAACTAACGATTTAATTGATCCTTAAAAAGCCTTTATCTATCGCATTATGAATAAATATTTAATCGACCTTTAATAGTGACCTAAAAGCCTTTTAAAAGCCAACGCATTCAGTGACTTTTAAAAGGCTATTAAGTGTCAATTGAATTGCCTTGTTACTGGCTTTTAAAAGGCTATTAAAGAACggacctgacccccggatggtggacaccttgaaacaagcatgatgctgggaaaggtaatctgccaccatgccacgcaa > 1:371700‑M2/1‑223 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |