| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
GAGGAGTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCAGCTTCAGCTTTTGAACTTCTCCACATTGGATGACATCAACTAAGCGAGTGCGGACATACTGCAGAAACAAATGGTTTCCTCACTTCCTTCTATGAAATCCAGCTAGGTGCAGCCTCTGAGCTCCCTACTAGAAAATCGCGCATAAGTTCCAGTACACCGATCACGAATGGCGTTGCTTGACATCCTCCCCGCCCTCGACGTGCGGGGCTGGCGCGTATACCGAGAGGTCACTTCTGCATCAACAACGCAAAATACTGGATAACCACCAACATCAATGCCTGTATTAATAGTGCTGACA > BA000036/1826704‑1827302 | gaggagTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTcc < 1:423414/300‑1 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tCCAGCTTCAGCTTTTGAACTTCTCCACATTGGATGACATCAACTAAGCGAGTGCGGACATACTGCAGAAACAAATGGTTTCCTCACTTCCTTCTATGAAATCCAGCTAGGTGCAGCCTCTGAGCTCCCTACTAGAAAATCGCGCATAAGTTCCAGTACACCGATCACGAATGGCGTTGCTTGACATCCTCCCCGCCCTCGACGTGCGGGGCTGGCGCGTATACCGAGAGGTCACTTCTGCATCAACAACGCAAAATACTGGATAACCACCAACATCAATGCCTGTATTAATAGTGCTGa > 1:499886/1‑300 (MQ=40) cccgttctttaatagccttttaaaagccagtaacaaggcaattcaattgacacttaatagccttttaaaagtcactgaatgcgttggcttttaaaaggcttttaggtcaatattaaaggtcgattaaatatttattcataatgcgatagataaaggctttttaaggatcaattcaatcgttagttaatcaaccttttaatatgcagcagagtgagttgtttcaaaggctcaatataattgttatgtaattgaccattaagagccaatagagtactgccgtttcaaagtcactaaaggttc < 1:393135‑M1/299‑298 (MQ=255) cgttctttaatagcctgttaaaagccagtaacaaggcaattcaattgacacttaatagccttttaaaagtcactgaatgcgttggcttttaaaaggcttttaggtcactattaaaggtcgattaaatatttattcataatgcgatagataaaggcttgttaaggatcaattcaatcgttagttaatcgaccttttaatatgcagcagagtgagttgtttcaaaggctcaatataattgttatgtaattgaccattaagagccaatagagtactgccgtttcaaagtcactaaaggttcta < 2:178316‑M1/300‑300 (MQ=255) | GAGGAGTGCATTTTCCTTTTCAAGTTGGCGGATCCGTTCAGCTTCGGACAGCGCGGTGGCCGTGTTAGCGCCATGTGGAGTTGAGTTGGCCCCGTATTTAGTAATCCAGTTTTTAAGGGTCATTCGGTTGATTCCGAGATCATTGGCGATCTTCTGGATCGAGGTGCCGGCGGAGTTCTCGTAGAGCGCGACAGCGTCGCGCTTGAACTCCTCTGTGTAGGTCTTGCGTGGCATGGTGGCAGATTACCTTTCCCAGCATCATGCTTGTTTCAAGGTGTCCACCATCCGGGGGTCAGGTCCAGCTTCAGCTTTTGAACTTCTCCACATTGGATGACATCAACTAAGCGAGTGCGGACATACTGCAGAAACAAATGGTTTCCTCACTTCCTTCTATGAAATCCAGCTAGGTGCAGCCTCTGAGCTCCCTACTAGAAAATCGCGCATAAGTTCCAGTACACCGATCACGAATGGCGTTGCTTGACATCCTCCCCGCCCTCGACGTGCGGGGCTGGCGCGTATACCGAGAGGTCACTTCTGCATCAACAACGCAAAATACTGGATAACCACCAACATCAATGCCTGTATTAATAGTGCTGACA > BA000036/1826704‑1827302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |