| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NZ_CP034943 | = 1328839 | 323 (1.240) | 7 (0.030) | 5/252 | NT | 2.1% | coding (315/1359 nt) | htrA | serine protease HtrA |
| ? | NZ_CP034943 | 1328847 = | 326 (1.250) | coding (307/1359 nt) | htrA | serine protease HtrA | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
AACTAGAGCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATAC > NZ_CP034943/1328703‑1328978 | cTAGAGCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGa > 1:4311972/1‑140 (MQ=255) gAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGc > 2:1018975/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGTGCTTTTGCt < 2:1416726/140‑1 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:2777058/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:3952358/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:2512438/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:3120084/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt < 2:3154010/140‑1 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:4010807/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCGGTTTGACAGAGCCGGAAGATCTGTCATGCCGACACTCGCCGGCGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt < 2:2219946/140‑1 (MQ=255) gagCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTc < 1:3302015/140‑1 (MQ=255) gagCTGTTTGACTCAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTc < 2:3795756/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCaga > 2:2007141/1‑140 (MQ=255) cTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCaga > 2:3997718/1‑140 (MQ=255) tGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCagag > 2:2954374/1‑140 (MQ=255) gTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTGGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAgg > 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1:2579077/1‑139 (MQ=255) tGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCg > 2:3252668/1‑140 (MQ=255) tGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGACTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCg > 2:8503/1‑140 (MQ=255) aaTGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGAtt < 1:2327362/140‑1 (MQ=255) ccGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTgtgt > 2:653572/1‑140 (MQ=255) ccGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTgtgt > 1:3537138/1‑140 (MQ=255) 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tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTTAAGTTTACTTATCATCATGGTCgactag < 2:3652672/140‑6 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 2:4083613/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 2:4289851/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 2:1544932/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 2:1278947/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:4010807/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:3571149/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:2475450/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCGGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 2:1528480/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTGAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:1018975/140‑1 (MQ=255) tCGCTCATGCATGCAGATGAGCTGCTTGACCTTGACGAGCTTTGCCTAGAGTCAGAGGACGTTCTTTTAGCTGTACCCGATTGTGATAGCGGCTGGCTCGATGAGAGTTATCAACGGTCCAGAGCATCATGCCCGCCAAg < 2:2367211/140‑1 (MQ=255) gcGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:1359747/139‑1 (MQ=255) cAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACgtg > 2:2538574/1‑140 (MQ=255) gATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTa < 1:1269618/140‑1 (MQ=255) aTGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg > 1:1065119/1‑124 (MQ=255) cttattgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATACAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGGGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGcc < 1:2669995/136‑1 (MQ=255) ctgctTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGcc < 2:11489/140‑1 (MQ=255) cttgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAg < 2:2893458/140‑1 (MQ=255) cttgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAg > 2:743628/1‑140 (MQ=255) cttgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAg > 1:1919500/1‑140 (MQ=255) ttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATa < 2:3484950/140‑1 (MQ=255) | AACTAGAGCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATAC > NZ_CP034943/1328703‑1328978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |