| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NZ_CP034943 | = 1328839 | 323 (1.240) | 7 (0.030) | 5/252 | NT | 2.1% | coding (315/1359 nt) | htrA | serine protease HtrA |
| ? | NZ_CP034943 | 1328847 = | 326 (1.250) | coding (307/1359 nt) | htrA | serine protease HtrA | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
AGCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATACTGCCGCC > NZ_CP034943/1328709‑1328985 | agCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCtt > 1:3553664/1‑140 (MQ=255) gAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGc < 2:3925896/140‑1 (MQ=255) gAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGc > 2:1019033/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:4263994/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt > 2:2512438/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCt < 1:1416424/140‑1 (MQ=255) cAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAg < 2:1119468/140‑1 (MQ=255) aacaaagagctgtttgattgtgcctgaagatttgtaataccgacaatcgctggtgaaaggtcttctaccatatctgagattttagaagagtcctcgctcttgaatgcagatgagctgcttgagcttTTTT‑‑TAGATTCaga > 2:3191931‑M2/127‑140 (MQ=255) tGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCagag > 2:3233587/1‑140 (MQ=255) tGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCagag > 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ttGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGAc < 2:3699703/140‑1 (MQ=255) ttGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGAc < 2:3108242/140‑1 (MQ=255) ttGACTGAGCCTGAAGATTGGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGAc < 2:3454105/140‑1 (MQ=255) gACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGt < 1:2072818/140‑1 (MQ=255) gACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGt < 1:742141/140‑1 (MQ=255) gAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCtt < 2:1977659/140‑1 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tGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGACTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCg > 2:8503/1‑140 (MQ=255) tcaTGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGAt < 2:239823/138‑1 (MQ=255) ccGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTgtgt > 2:653572/1‑140 (MQ=255) aTCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGTTTGTGTTtgctg < 2:3965608/140‑1 (MQ=255) aTCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTtgctg < 1:1595601/140‑1 (MQ=255) ccGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGACCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTgctgg < 1:3032541/140‑1 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ccaTATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGaa < 1:2695378/140‑1 (MQ=255) tatCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTTCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAgtg > 1:3633560/1‑140 (MQ=255) tatCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGaa > 2:1395318/1‑137 (MQ=255) tatCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAgtg > 1:928157/1‑140 (MQ=255) atgtGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAgtgt > 2:4006561/4‑140 (MQ=255) tGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCt < 1:957507/140‑1 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(MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:181099/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTGAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:1018975/140‑1 (MQ=255) tCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCGTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg < 1:2342363/140‑1 (MQ=255) tCGCTCATGCATGCAGATGAGCTGCTTGACCTTGACGAGCTTTGCCTAGAGTCAGAGGACGTTCTTTTAGCTGTACCCGATTGTGATAGCGGCTGGCTCGATGAGAGTTATCAACGGTCCAGAGCATCATGCCCGCCAAg < 2:2367211/140‑1 (MQ=255) cAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACgtg > 2:2538574/1‑140 (MQ=255) cAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACgtg > 2:2727972/1‑140 (MQ=255) gATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTa < 1:2401561/140‑1 (MQ=255) aTGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAg > 1:1065119/1‑124 (MQ=255) aGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATg > 2:3839781/1‑140 (MQ=255) ctggtTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGcc < 2:3651958/140‑1 (MQ=255) cttgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAg > 2:743628/1‑140 (MQ=255) cttgagcttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAg < 2:2893458/140‑1 (MQ=255) cttgaCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGAt > 1:398784/1‑140 (MQ=255) aCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATACTg > 1:2027092/1‑140 (MQ=255) aCGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATACTg > 2:1811267/1‑140 (MQ=255) gAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATACTgcc < 2:2209704/140‑1 (MQ=255) | AGCCGAACAAAGAGCTGTTTGACTGAGCCTGAAGATTTGTAATGCCGACAATCGCCGGTGAAATGTCTTCCACCATATCTGAGATTTTAGAAGCATCCTCGCTCTTGAATGCAGATGAGCTGCTTGAGCTTGACGAGCTTTTGCTAGATTCAGAGGACGTGCTTTTAGCTGTAACCGATTGTGTTTGCTGCTGGCTGGATGATTGTTTTGAAGTGTCCTGAGCATCATGGTCGCCAAGCGGTGTAAACGTGTAAATGCCAAGGGCGATACTGCCGCC > NZ_CP034943/1328709‑1328985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |