| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | = 2071634 | 216 (0.780) | 11 (0.040) +G |
5/266 | 10.3 | 4.8% | coding (2659/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain |
| ? | NZ_CP034943 | 2071645 = | 226 (0.820) | coding (2648/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP034943/2071529‑2071634‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCC > NZ_CP034943/2071645‑2071778 | TTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGCTCCCGTTGGGCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCCGTGGCT > 1:191582/1‑140 TCCCGTTGCGCCAGTTTCCCAGGTTGCACCAGTTGAACCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGCTTGCACCAGTTACTCCACTGGCTCCAGTTGATCCTGTTGAGCCTGTTAATCCCGTCTCTCCAG > 2:3295608/1‑140 tttCACCATTTTCTCCCGTTGCGCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCCGTTGCACCAGTTCCTCCCGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAT < 1:5667/137‑1 TTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCCGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAGCCTGTTGAg > 2:3548902/1‑139 gcGCTCCTGGGGGTCCTGTAGCTCCTGGTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAT < 1:3819326/138‑1 TTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAT > 1:1774152/1‑140 TTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGA < 2:2054996/48‑1 GTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGT < 1:2559248/38‑1 GTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGT < 1:776670/38‑1 gagCCGGTGGCTCCTGTTGATCCAGGTTCTCCCGTCGCTCCCGTGGCTCCGGGTGATCCTGTTGATCCCGATGCACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGGAGCTCCAGTTTCTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCC < 2:721210/137‑1 GCTCCGGTCGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCC < 2:2189572/140‑1 | TTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP034943/2071529‑2071634‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCC > NZ_CP034943/2071645‑2071778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |