| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | = 2071634 | 216 (0.780) | 11 (0.040) +G |
5/266 | 10.3 | 4.8% | coding (2659/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain |
| ? | NZ_CP034943 | 2071645 = | 226 (0.820) | coding (2648/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCCC > NZ_CP034943/2071524‑2071779 | tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGttgatcctgttgatcctgttgatcctg > 2:2874295/1‑140 (MQ=35)tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGttgatcctgttgatcctgttgatcctg > 1:2017685/1‑140 (MQ=35) cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatcctgttgatcctgt > 1:3403463/1‑140 (MQ=37) cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatcctgttgatcctgt > 1:3513411/1‑140 (MQ=37) ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtct > 1:1929369/1‑140 (MQ=40) tactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGGCCTGTAGCTCCTGTGTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtctc < 1:3165094/140‑1 (MQ=255) tcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 2:4156934/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 1:254030/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:3549262/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:154983/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:4187072/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCACTTGCCCCGGTTCCTCCATTTGATGCCCTTGCTCCTGTTGGTCATGTTGCTCCTGTTTCTCCGGTTGCTCCAGTTACTCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 1:1791610/140‑1 (MQ=14) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:516945/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:146712/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:2293426/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 2:1242753/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:2785653/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 2:1675663/1‑140 (MQ=255) cgcCCGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:3117206/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 1:1037825/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:1984792/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGGTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:10446/140‑1 (MQ=255) gcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAg > 2:2253231/1‑140 (MQ=255) gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGc > 2:715083/1‑140 (MQ=255) gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGGTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGc < 1:55704/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTTCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGc < 1:2387076/140‑1 (MQ=255) tttCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt < 1:2253231/140‑1 (MQ=255) cccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt < 1:2496748/136‑1 (MQ=255) cccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCt > 2:2496748/1‑136 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCTGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 2:1327095/140‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 1:3834543/140‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 1:869504/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt < 1:1533623/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt < 1:349691/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt > 1:1332902/1‑140 (MQ=255) cACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCt > 1:2702910/1‑140 (MQ=37) aCCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTg < 2:2335773/140‑1 (MQ=255) gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCTCCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTGGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGa > 1:3532804/1‑140 (MQ=255) gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGtt < 2:1879927/138‑1 (MQ=255) ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt < 1:1895916/140‑1 (MQ=255) ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt < 2:1626965/140‑1 (MQ=255) cccGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa > 2:252957/1‑140 (MQ=40) cccGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTATCCAGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCATGTTGATCCCGa > 2:4128724/1‑140 (MQ=255) cGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATg < 2:3481025/140‑1 (MQ=40) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt < 1:2587109/131‑1 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa < 1:3548534/140‑1 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 2:2710286/1‑140 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 1:3459518/1‑140 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 1:2517589/1‑140 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 2:367073/1‑140 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa < 1:2892652/140‑1 (MQ=39) tGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCGGTTGATCCCGATgtag > 2:3529350/1‑137 (MQ=255) gCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCATGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATGCTGTTTATCACGTCGCTCCAGTGGATCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGagc < 1:3952043/140‑3 (MQ=11) ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt < 2:1803847/140‑1 (MQ=34) gTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGa > 1:3284285/1‑140 (MQ=34) ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAt < 2:1929369/140‑1 (MQ=34) ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAt < 1:2082538/140‑1 (MQ=34) tAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGCTCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtct > 2:1363358/1‑140 (MQ=21) tAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtct > 1:2341676/1‑140 (MQ=34) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGCTCCTGTTGATCCCGa > 1:1293409/1‑117 (MQ=25) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa < 2:2059362/117‑1 (MQ=35) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa < 2:1293410/117‑1 (MQ=35) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACACCAGTGGCTCGTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtctc > 1:2984950/1‑140 (MQ=21) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 1:1106719/140‑1 (MQ=34) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 1:1132888/140‑1 (MQ=34) gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGc < 1:265107/140‑1 (MQ=32) tttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt < 2:605006/140‑1 (MQ=32) gttgcccGGGTGGACCAGTTACTCCCGGTGCTCCTGTTGATACTGTTGATCCTGTTGATCGTGTTTCTCCCGTCGCTCCATTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt < 2:1604888/136‑1 (MQ=11) tCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:1120623/78‑1 (MQ=34) cccgTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCTGTTGCTCCGGTTGGTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGt < 2:2000571/137‑1 (MQ=11) ccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGAACCTGTTGATCCTGTTTATCCCGTCGCTCCAGTGGCACCGGTTGATCCTGTTGATCCCGAAGGACATGGTCATCCTGTTTCTCCAGATGGTCCAGt > 2:3102943/1‑140 (MQ=11) ggTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTa > 2:914357/1‑140 (MQ=32) ggTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTa > 2:2599881/1‑140 (MQ=32) gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCGGTTTATACCGATGGACCTGGAGATGCTGTTTATCCAGTAGATCCCGTTAc > 2:324040/1‑140 (MQ=11) gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc > 2:888456/1‑140 (MQ=32) gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc < 2:3778841/140‑1 (MQ=32) ttGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACt > 1:3103431/1‑140 (MQ=32) aCCAGTTCCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAg < 2:393829/140‑1 (MQ=17) ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCt > 2:637304/1‑140 (MQ=34) ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCt > 2:2286362/1‑140 (MQ=34) ccAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt < 1:630797/140‑1 (MQ=21) ccAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt < 2:2555830/140‑1 (MQ=34) cAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGGTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGtt > 1:4082259/1‑140 (MQ=21) aGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 2:797281/110‑1 (MQ=32) aGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg > 1:797281/1‑110 (MQ=32) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGa < 2:2319258/94‑1 (MQ=33) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt < 2:967794/113‑1 (MQ=32) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt > 1:967794/1‑113 (MQ=32) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:1410671/1‑140 (MQ=34) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:741707/1‑140 (MQ=34) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:1699140/1‑140 (MQ=34) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:2744475/1‑140 (MQ=34) cTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCt > 2:2747730/1‑140 (MQ=34) tcctgttgatcctgttgatcctgttgaTCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTg > 2:3981616/1‑140 (MQ=34) cctgttgatcctgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt > 1:688454/1‑59 (MQ=35) cctgttgatcccgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGt > 2:2957626/1‑140 (MQ=21) ccggttgatcctgttgatcctgttgatcctGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTGTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGGTGCTCCGGTGGATccggg > 2:1817956/4‑137 (MQ=1) gatcctgttgatcctgttgatcctgttTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTcc < 1:1629432/140‑1 (MQ=31) gatcctgttgatcctggtgcgcctgtgTCTCCCGTCGCTCCTGTGGCTCCGGTTGCTCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGCTCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTCCTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTcc < 2:461618/140‑1 (MQ=11) atcctgttgatcctgttgatcctgttTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTccc > 1:57188/1‑140 (MQ=11) | TCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTTCTCCC > NZ_CP034943/2071524‑2071779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |