| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | = 2071634 | 216 (0.780) | 11 (0.040) +G |
5/266 | 10.3 | 4.8% | coding (2659/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain |
| ? | NZ_CP034943 | 2071645 = | 226 (0.820) | coding (2648/7377 nt) | EO946_RS10385 | NTTRR‑F1 domain | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGT > NZ_CP034943/2071524‑2071772 | tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGttgatcctgttgatcctgttgatcctg > 1:1319320/1‑140 (MQ=35)tcccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGttgatcctgttgatcctgttgatcctg > 1:2017685/1‑140 (MQ=35) cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatcctgttgatcctgt > 2:1106719/1‑140 (MQ=37) cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatcctgttgatcctgt > 1:3404206/1‑140 (MQ=37) cccgttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTtgatcctgttgatccggttgatcctgt > 2:3750845/1‑140 (MQ=37) gttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtc > 1:3523985/1‑140 (MQ=39) ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtct > 2:2892652/1‑140 (MQ=40) ttactcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTtct > 1:1929369/1‑140 (MQ=40) tcccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 2:4156934/140‑1 (MQ=255) cgcggtGCGACAGGTTCCCCCGTTTCACCAGGTGATCCAGTTGGTCCTGTTGGTCCTGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGGTTCTCCAGTGGCTCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:1135779/135‑1 (MQ=11) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:4187072/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 2:3549262/140‑1 (MQ=255) cccgttGCGCCACTTGCCCCGGTTCCTCCATTTGATGCCCTTGCTCCTGTTGGTCATGTTGCTCCTGTTTCTCCGGTTGCTCCAGTTACTCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt < 1:1791610/140‑1 (MQ=14) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 2:2082538/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:2785653/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 2:1675663/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 2:731286/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:1626965/1‑140 (MQ=255) ttGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCt > 1:146712/1‑140 (MQ=255) cgcCCGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:3117206/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 1:664682/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 2:1984792/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 1:1037825/140‑1 (MQ=255) cgcCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCa < 1:2782683/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTTCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGc < 1:2387076/140‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 1:869504/140‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 1:3834543/140‑1 (MQ=255) ccGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGGTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 1:3136305/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCACCCGTTGCTCCGGTTGCGCCGCGTGGTCCGGTAGCTCCTGTTTCACCGGTTGCACCAGTTCCTCCTGTTGCTCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 2:1327214/140‑1 (MQ=11) ccGGATGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTGCTGTTTCCCTGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGt < 2:3422840/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt < 1:1533623/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt < 2:1862282/140‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGAt < 1:349691/140‑1 (MQ=255) tGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATc < 1:2543260/140‑1 (MQ=255) tGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATc < 2:157305/140‑1 (MQ=255) gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGtt < 2:2538909/138‑1 (MQ=255) gTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGtt > 1:2538909/1‑138 (MQ=255) ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt < 1:1895916/140‑1 (MQ=255) ttGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt < 2:2293426/140‑1 (MQ=255) aTCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATccc > 1:3467691/1‑140 (MQ=40) cccGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTATCCAGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCATGTTGATCCCGa > 2:4128724/1‑140 (MQ=255) cccGGTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa < 1:3533123/140‑1 (MQ=255) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAt > 2:2587109/1‑131 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 2:2710286/1‑140 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa < 1:2892652/140‑1 (MQ=39) ttGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGa > 2:367073/1‑140 (MQ=39) tGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATc > 1:562622/1‑122 (MQ=39) tGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGAc > 1:1398582/1‑140 (MQ=38) tGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCGGTTGATCCCGATgtag > 2:3529350/1‑137 (MQ=255) gCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCATGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATGCTGTTTATCACGTCGCTCCAGTGGATCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGagc < 1:3952043/140‑3 (MQ=11) ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt < 1:2710286/140‑1 (MQ=34) ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt < 2:1803847/140‑1 (MQ=34) ccTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGt < 2:2017685/140‑1 (MQ=34) ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAt < 2:1929369/140‑1 (MQ=34) ttGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAt < 1:2082538/140‑1 (MQ=34) ctGGTCCCGTAGCTCCTGTGTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGGTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGAt < 1:2500961/139‑1 (MQ=255) tGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATc < 1:2695792/140‑1 (MQ=34) ccTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGt > 1:2607537/1‑140 (MQ=34) tGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGttt > 2:2615517/1‑140 (MQ=34) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGCTCCTGTTGATCCCGa > 1:1293409/1‑117 (MQ=25) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGa < 2:1293409/117‑1 (MQ=35) aGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACACCAGTGGCTCGTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTtctc > 1:2984950/1‑140 (MQ=21) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 1:1106719/140‑1 (MQ=34) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 2:146712/140‑1 (MQ=34) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 1:1132888/140‑1 (MQ=34) tCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCg < 1:952763/140‑1 (MQ=34) ccTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGt > 1:2264604/1‑140 (MQ=34) gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGc < 2:1319320/140‑1 (MQ=32) gTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGc > 2:3949483/1‑140 (MQ=32) tttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt < 2:605006/140‑1 (MQ=32) tttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt > 1:691232/1‑140 (MQ=32) ttCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTc > 2:1009279/1‑140 (MQ=32) ccccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCa < 1:4128724/140‑1 (MQ=32) ccGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGAACCTGTTGATCCTGTTTATCCCGTCGCTCCAGTGGCACCGGTTGATCCTGTTGATCCCGAAGGACATGGTCATCCTGTTTCTCCAGATGGTCCAGt > 2:3102943/1‑140 (MQ=11) ggTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTa > 2:914357/1‑140 (MQ=32) ggTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGGTGCTCCAGTTa > 2:517861/1‑140 (MQ=17) ggtGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTGTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc < 1:3369529/138‑1 (MQ=17) gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCGGTTTATACCGATGGACCTGGAGATGCTGTTTATCCAGTAGATCCCGTTAc > 2:324040/1‑140 (MQ=11) gTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTAc > 2:888456/1‑140 (MQ=32) tGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGGTACTc > 2:1890051/1‑140 (MQ=17) cACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCa < 2:161418/140‑1 (MQ=32) aCCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAg < 2:2517589/140‑1 (MQ=32) ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTGCAGTTACTCCAGTTGCt > 2:2331110/1‑140 (MQ=21) ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCt > 2:637304/1‑140 (MQ=34) ttACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCt < 1:3730869/140‑1 (MQ=34) ccAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGCTCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt < 1:630797/140‑1 (MQ=21) ccAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGt < 2:2338231/140‑1 (MQ=34) cAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTATCCCCTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCCATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCCGtt > 1:2484533/1‑140 (MQ=255) tGGCTCCTGTTTATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGAACCCGATTGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTACAGTTGCTCCTGTTGAt > 1:3166868/1‑140 (MQ=11) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGa > 1:2319258/1‑94 (MQ=33) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCt < 2:81896/98‑1 (MQ=33) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCt < 2:967794/113‑1 (MQ=32) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:782020/1‑140 (MQ=34) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 1:1699140/1‑140 (MQ=34) tGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGAt > 2:2276953/1‑140 (MQ=34) ggCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGCTCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATc > 1:2231086/1‑140 (MQ=21) ggCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATc > 1:55215/1‑140 (MQ=34) cTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCt > 2:2747730/1‑140 (MQ=34) cctgttgatcctgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGt > 2:3802777/1‑140 (MQ=34) cctgttgatcccgttgatcctgttgatCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGt > 2:2957626/1‑140 (MQ=21) | TCCCGTTACTCCCGTTGCGCCAGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTGATCCCGTTGCTCCTGTTGGTCCTGTAGCTCCTGTTTCCCCGGTTGCACCAGTTACTCCAGTGGCTCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTCGCTCCAGTGGCTCCGGTTGATCCTGTTGATCCCGATGGACCTGTTGATCCTGTTTCTCCCGTTGCTCCAGTTACTCCAGTTGCTCCGGTTGATCCTGT > NZ_CP034943/2071524‑2071772 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |