| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP034943 | = 3376760 | 644 (1.420) | 8 (0.020) | 3/250 | NT | 1.3% | intergenic (‑125/+94) | trxB/cwlO | thioredoxin‑disulfide reductase/peptidoglycan DL‑endopeptidase CwlO |
| ? | NZ_CP034943 | 3376771 = | 607 (1.340) | intergenic (‑136/+83) | trxB/cwlO | thioredoxin‑disulfide reductase/peptidoglycan DL‑endopeptidase CwlO | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 666 total aligned reads displayed.
CACACTATTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTCCAGTAAACGTTGCT > NZ_CP034943/3376633‑3376910 | cacacTATTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCtcat < 1:101187/140‑1 (MQ=255) acacTATTCACTCCTTCAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCtcatc < 2:1154039/140‑1 (MQ=255) acacTATTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCtcatc < 2:306127/140‑1 (MQ=255) cacTATTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCtcatca < 2:2918808/140‑1 (MQ=255) cacTATTCACTCCTTAAACCACCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCtcatca < 2:5063969/140‑1 (MQ=255) aTTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGAt < 1:6530901/140‑1 (MQ=255) aTTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGAt > 2:2402477/1‑140 (MQ=255) ttCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGAtt > 2:7756153/1‑140 (MQ=255) ttCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGAtt > 1:2406592/1‑140 (MQ=255) tCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGACTCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATg < 2:6912696/140‑1 (MQ=255) cTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTa < 1:7308037/140‑1 (MQ=255) cTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTa < 1:2150420/140‑1 (MQ=255) cTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTa < 2:7227651/140‑1 (MQ=255) ttAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTAt > 1:2060805/1‑140 (MQ=255) ttAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTAt > 1:6049434/1‑140 (MQ=255) ttAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTAt > 1:1646282/1‑140 (MQ=255) ttAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTAt > 1:32171/1‑140 (MQ=255) ttAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCGATTTTTTTGATCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTAt > 1:2788391/1‑140 (MQ=255) aaaCCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTg > 2:2076720/1‑140 (MQ=255) aCCCTCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTa < 1:6718461/140‑1 (MQ=255) ccATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTaa < 1:3693152/140‑1 (MQ=255) ccATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTaa < 2:4566866/140‑1 (MQ=255) aTCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTaaaa > 2:4838486/1‑140 (MQ=255) cTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAATCGTATTCCTTACCCATTGCCTCTAAAATCTGATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAATTGTATTGTAAATgg > 2:2582534/1‑140 (MQ=255) cTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTaaaa > 2:4176582/1‑138 (MQ=255) cTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAgg > 1:3270181/1‑140 (MQ=255) cTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAgg < 1:170727/140‑1 (MQ=255) cTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAgg > 2:1689216/1‑140 (MQ=255) aaaccatcttttcaagtttgggctctttcttataagataagaatcgccatcaaacgtattccttacccatatcctataaaatctcatggtgatacgctcttttattgctcaA‑CACGAGTAAATGTATTCGAAAAGGgtag > 1:2733694‑M2/112‑139 (MQ=255) tttGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAACCGTATTCCTTACCGATATCCTATAACATCTCAGGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCCTCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACagg < 2:5932796/140‑3 (MQ=255) ctctTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTtaata < 1:6870045/140‑1 (MQ=255) ctctTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTtaata < 1:29525/140‑1 (MQ=255) tttcttATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATaaag > 1:5865971/1‑140 (MQ=255) ttcttATATGATAAGAATCCCCAGCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATaaata > 1:1391288/1‑138 (MQ=255) ttATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATaaagaaag < 1:5133496/140‑1 (MQ=255) tataTGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAaagaaaga > 1:4725827/1‑140 (MQ=255) tataTGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAaagaaaga < 2:6049434/140‑1 (MQ=255) tatGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGc < 1:5694842/140‑1 (MQ=255) tatGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGc < 1:5441100/140‑1 (MQ=255) tatGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGc < 1:4286572/140‑1 (MQ=255) ctctttcttataagataagaatccccatcaaacgtattccttacccatatcctataaaatctcatggtgatacgctatttttttgctcaA‑CACGATTAAATGTATTCGAAAAGGGTAT‑‑ATGTTAATAAAGAAAGAGCCtt < 2:1940407‑M2/51‑1 (MQ=255) gagactaaTCCCCATCAAAAGTATTCCTGACCCATATGCTATACAATCTCCTGGTGATACGCTATTTTTATGCTCATTCTTTTCTCATCACGATTACATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTCAGAAAGAAAGAGCAtt < 1:4392555/134‑1 (MQ=255) gATAAGAATCCCCATCACACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCCTGGTGATACGCTATTATTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCtt < 1:3873926/140‑1 (MQ=255) gATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGc > 1:698982/1‑137 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tAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCt > 2:3321362/1‑140 (MQ=255) tAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCACATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCt < 2:5295696/140‑1 (MQ=255) gacgAATCCCCATCCAACGTAGCCCTTACCCACAGACTCTAAAAACTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCAGTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCt < 2:4338717/137‑1 (MQ=255) aGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCtgt < 2:7420481/140‑1 (MQ=255) aGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCtgt < 2:2500195/140‑1 (MQ=255) aTCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGta > 1:1060684/1‑140 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aTTCCTGACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTc < 1:3387950/140‑1 (MQ=255) ttCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCt > 2:75217/1‑140 (MQ=255) tACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCttattt > 2:1541764/1‑140 (MQ=255) tACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGACTTCTGTGTATAGAAGGCGCTTGTGttattt > 2:4443087/1‑140 (MQ=255) aCCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCttattta > 2:6219329/1‑140 (MQ=255) aCCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCttattta > 1:2534777/1‑140 (MQ=255) cATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATttatta < 1:6640713/140‑1 (MQ=255) tatCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTattatt > 2:1406387/1‑140 (MQ=255) atCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAATGACCTTGTCTTATTTATTATTg > 2:6619881/1‑140 (MQ=255) atCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATGTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCGGGTCTTATTTCTTATTg > 2:6574540/1‑140 (MQ=255) taAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGTGTATACATGTTAATAAAGAAAGTGCCTTCTGTGTATAGAATGCACTTGTCTTATTTATTATTGaaaaac > 2:5245844/1‑140 (MQ=255) taAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGaacaac > 1:5042856/1‑140 (MQ=255) taAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGaacaac > 2:3639934/1‑140 (MQ=255) taAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGaacaac > 1:5256327/1‑140 (MQ=255) aaaTCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGAATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAacac > 2:2325957/1‑140 (MQ=255) tcATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCtt > 1:4053095/1‑140 (MQ=255) cATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATATAAGGCCCTTGGCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTa > 1:1293124/1‑140 (MQ=255) cATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTa > 1:3470913/1‑140 (MQ=255) cATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTa > 2:6760224/1‑140 (MQ=255) cATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTa > 2:2701543/1‑140 (MQ=255) cATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTa > 1:7486562/1‑140 (MQ=255) tgTGATACGATAAATGTGTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATTTTAATAAAGAAAGAGCCTTATGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACaa < 2:3250833/139‑1 (MQ=255) ggTGATACGCTATTGTTTTGCACATTTTTGTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAACAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACaa < 2:7110771/140‑1 (MQ=255) tttttttGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATg > 2:3457308/1‑140 (MQ=255) cTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACGCGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTc > 1:6214487/1‑140 (MQ=255) ttCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTCCAGTAAACg < 1:7583982/140‑1 (MQ=255) tctcATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTCCAGTAAACGt < 1:859123/140‑1 (MQ=255) catcaCGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTCCAGTAAAATTTGc > 2:7023495/1‑140 (MQ=255) | CACACTATTCACTCCTTAAACCATCTTTTCAAGTTTGGGCTCTTTCTTATATGATAAGAATCCCCATCAAACGTATTCCTTACCCATATCCTATAAAATCTCATGGTGATACGCTATTTTTTTGCTCATTTTTTTCTCATCACGATTAAATGTATTGTAAAAGGGTATACATGTTAATAAAGAAAGAGCCTTCTGTGTATAGAAGGCCCTTGTCTTATTTATTATTGAACAACACGTCTTACAACGCCTTTAAATGCTTTTTTCCAGTAAACGTTGCT > NZ_CP034943/3376633‑3376910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |