| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | 1154854 = | 340 (0.930) | 310 (1.200) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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| ? | CP009974 | 1155783 = | 7 (0.020) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 635 total aligned reads displayed.
TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCT > CP009974/1155783‑1155930 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCTACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGG < 1:3031757/151‑1 CGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGg > 2:4857231/1‑150 CGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGT < 1:2933156/151‑1 CGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGg > 2:6248691/1‑150 GATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTG > 2:2629321/1‑151 GGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGG < 2:1569834/151‑1 GGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGG > 1:6732217/1‑151 GCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGG > 2:7082899/1‑151 GCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGG < 1:328531/151‑1 ggCCACGTGCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTG < 2:5902799/149‑1 GACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTG < 2:3958582/151‑1 gccgCGTCCAGCGGCTCGCCGTCGGCCTGAGGCGGGTCGGTGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGG 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> 1:3692778/1‑151 GCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGCGGGTGGTGCCATCAGGATCGATG > 2:3492025/1‑151 CCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGG < 1:5717073/151‑1 GGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCG < 1:1158707/151‑1 CGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGG > 2:2373076/1‑151 CGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGG < 1:1596220/151‑1 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ggtTGGTGCAATTAGGTTCGATGGCGAGATTTGTTGTGTTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTATGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAG < 2:4264793/148‑1 TGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATC < 1:6428212/151‑1 GGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGCTCG > 2:1911773/1‑151 GGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCG < 1:3629487/151‑1 TGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGAT > 1:5154303/1‑151 TGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGCTCGAT > 2:1163012/1‑151 CATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATTGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCATGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGAGCAG > 2:2559379/1‑151 CATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAG > 2:574773/1‑151 GATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGT < 1:787839/151‑1 GATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGT < 1:2191717/151‑1 ATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTG < 1:5010008/151‑1 ATCGATGGCCAGATAGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGTTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTG < 1:1971936/151‑1 CGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCC > 2:2456214/1‑151 GGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTG > 2:4725448/1‑151 GGCCAGATCGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTGGGGTCGGTCTGCACCAGGTTCAGCTGCTCGCGTGGCTCAGCGGCCGGGGCGAGATCACGCAGGAAGGTGaggtcg > 2:6974577/1‑145 GCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGG > 2:867249/1‑151 CAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCA < 2:7211376/151‑1 AGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAC < 2:3692778/151‑1 GATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACC > 1:2796074/1‑151 ATTGCTCGGGATGTCGGGGGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCG < 1:2629383/151‑1 TTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGg > 1:6209596/1‑150 TCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAc > 2:146439/1‑150 GGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAcacc > 2:2918542/1‑147 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCT > CP009974/1155783‑1155930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |