| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | 1154854 = | 340 (0.930) | 310 (1.200) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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| ? | CP009974 | 1155783 = | 7 (0.020) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 821 total aligned reads displayed.
CGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCACTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAT > CP009974/1154706‑1155004 | cggccgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCgg > 2:6635751‑M1/149‑151 (MQ=255) ggccgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcgcgagcaatcgggccatcgatccggatggcaccaccctcaccggc < 1:737202‑M1/4‑2 (MQ=255) gccgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTa > 2:4672048‑M1/147‑151 (MQ=255) ccgctcagccatgcgagcagttgagccgggtgcagaccggcccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagaaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcgcCGGTAc > 2:6538813‑M1/146‑151 (MQ=255) cgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTAcc < 2:2276821‑M1/7‑1 (MQ=255) gctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACcg < 2:5119280‑M1/8‑1 (MQ=255) tcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACcgcg < 1:1443383‑M1/10‑1 (MQ=255) acAGCCAGGGGAGCAGTTGAGCATGGGGCAAACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCGCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGTCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGACGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACcgcg < 2:4801425/150‑1 (MQ=11) cagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCgcgc > 1:3451402‑M1/141‑151 (MQ=255) ccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCgcgcctg < 2:890875‑M1/14‑3 (MQ=255) caggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCgccggc > 1:248588‑M1/137‑151 (MQ=255) gcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGtaccgcgcctgctgg > 1:4830650‑M1/134‑145 (MQ=255) gCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGccggccgg < 2:4357109/151‑1 (MQ=255) 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aatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGa > 1:2858962‑M1/96‑151 (MQ=255) aaCGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGa > 1:2703955/1‑151 (MQ=255) atgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGctgct < 2:5278589‑M1/57‑3 (MQ=255) aCGCGTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGAt < 2:1821718/151‑1 (MQ=255) gcttcggtggcgaccgagtacggcgcaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgagggcaccaccctcccCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAGGTGCATGATGCCAACGGCACGTTGATTg > 2:3995092‑M1/93‑151 (MQ=255) 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cGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATCGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCCGCTCCACCGCCACCCCCGACCCGCCCCACCCCAACgcccag > 2:6291544/1‑146 (MQ=14) gatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAAGCCGACGGcgaac < 2:7164029‑M1/128‑3 (MQ=255) cctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGCCGTGTTGAAGCGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTCCCCCGTCACCCCCGACCCGCCCCCGCCCCACCGCGAcctgc < 2:309715‑M1/131‑1 (MQ=255) aGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGctgctg > 1:5630373/1‑151 (MQ=255) gatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCACCGGCGAACTGCTgg < 2:1103414‑M1/134‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCTTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGAc > 1:4592593/1‑151 (MQ=255) cGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCACCGTCACCGTCACCCTCGCCCGGCCTCCGGCCCACGGCGAGCGGCTGGAc > 2:3858900/1‑151 (MQ=14) cGGCAGCAGCAGCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGGTTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGGCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGAc < 2:1547042/151‑1 (MQ=255) ggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACg > 1:6290661‑M1/15‑151 (MQ=255) gcagcggcctgacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGCTGAGGTGCATGACGCCAGCGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGt > 2:3441443‑M1/14‑151 (MQ=255) caccgccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTg > 2:150812‑M1/13‑151 (MQ=255) accaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTgg > 1:6197575‑M1/12‑151 (MQ=255) gcagcaTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGt < 1:6588108/151‑1 (MQ=255) ccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGtggc < 1:3849162‑M1/141‑2 (MQ=255) ccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGt > 2:2936753‑M1/11‑151 (MQ=255) ccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGc < 1:3675965‑M1/144‑1 (MQ=255) aTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCa > 2:4255217/1‑151 (MQ=255) cacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATc > 2:2629321‑M1/4‑151 (MQ=255) cAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATc > 2:4441691/1‑151 (MQ=255) gCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGCCGCCATCGa > 2:1395583/1‑151 (MQ=255) cGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAt > 1:1183377/1‑151 (MQ=14) cGGTACCGCGCCGGCGGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAt < 2:6169693/151‑1 (MQ=14) | CGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCACTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAT > CP009974/1154706‑1155004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |