| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | 1154854 = | 340 (0.930) | 310 (1.200) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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| ? | CP009974 | 1155783 = | 7 (0.020) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 507 total aligned reads displayed.
CGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCTGGT > CP009974/1155635‑1155933 | tcgagggtgacggtggagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatccgcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGt < 1:408423‑M2/3‑1 (MQ=255) cgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTc < 1:1865990‑M2/4‑1 (MQ=255) gggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCggg > 1:1486311‑M2/145‑151 (MQ=255) gggacggtgaagcggccgtcggggcctgccaccacattgcgaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggggcggtaccggtgagggtggtgccagcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGgcg < 1:5557804‑M2/9‑1 (MQ=255) acggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCgg > 2:3799023‑M2/140‑151 (MQ=255) ggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtg > 1:2196057‑M2/138‑151 (MQ=255) ggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtg < 1:5604226‑M2/14‑1 (MQ=255) tgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtggt < 1:6286590‑M2/16‑1 (MQ=255) gggagctgccggcggggcctgccaccacactgccaatcggcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtggt < 2:826962‑M2/16‑1 (MQ=255) gctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAAt < 1:4443201‑M2/20‑1 (MQ=255) gtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAcg > 2:1784199‑M2/126‑151 (MQ=255) tcggggcctgccaccacgctgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAcgt < 2:7014591‑M2/27‑1 (MQ=255) tcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAcgt < 1:198967‑M2/27‑1 (MQ=255) 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atcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAgg > 1:1624254‑M2/30‑151 (MQ=255) tcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGa > 1:5375043‑M2/29‑151 (MQ=255) tcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCga < 1:1179474‑M2/111‑1 (MQ=255) ggtgggtgCGGGAGGGGCGGTGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTg < 2:5274775/151‑1 (MQ=14) tcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGc > 2:5906395‑M2/23‑151 (MQ=255) cgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGcc < 1:2599989‑M2/130‑1 (MQ=255) gggggCGGCAGGGGCGGGGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCGTTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGATCCAGATCGATCAGGAAGGTGcca < 2:149878/147‑2 (MQ=14) ttggccagattgctctggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGt < 2:4936300‑M2/132‑1 (MQ=255) atggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGt < 2:6257008‑M2/132‑1 (MQ=255) tggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGtt > 1:1291107‑M2/19‑151 (MQ=255) ccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGCGGTCAATGGTACGTCGTACTCGTCAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGCGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGc > 2:1677156‑M2/16‑151 (MQ=255) cagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCa < 2:7211376‑M2/137‑1 (MQ=255) agattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAc < 2:2770304‑M2/138‑1 (MQ=255) ttgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGa < 1:787670‑M2/141‑1 (MQ=255) gctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCATGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAcc > 2:4524900‑M2/9‑151 (MQ=255) tcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACcac > 1:1737125‑M2/7‑150 (MQ=255) ccgggctGTCGGGCGCGGTGGTTAATGGTACGTCGTACTGGGTGGCGAAGGAAGCGTTACTGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCACCTGCTCGCCAGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAGCac < 2:5626163/145‑2 (MQ=14) ggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCgaccacacc < 2:4692405‑M2/148‑5 (MQ=255) gctGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCacaccc > 1:6114449/3‑146 (MQ=255) tGTCGGGCGCGGTGGTGAATGGTACGTCGTCCTCGGTAGCCGCCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGGTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCacccccgt < 2:3026315/151‑8 (MQ=18) tGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCacacccgt < 2:4101154/151‑8 (MQ=255) tGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCacacccgc > 2:3564317/1‑144 (MQ=255) | CGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCTGGT > CP009974/1155635‑1155933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |