| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 428 total aligned reads displayed.
GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTC > 1:3984747/1‑151GGCCGCCGACGGCACCACTGGGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTC < 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< 2:3039413/151‑1 CCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGC < 1:2591178/151‑1 CGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGACGCACCGACCAATCTCGTGATCGCCCTT > 2:6418099/1‑151 CGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTT > 1:5183398/1‑151 GACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACGCCGCCCGAAGCACCGACCAATTTGGTGACCTGCCTTG > 2:1062067/1‑151 GACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTG > 1:3686585/1‑151 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GATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGC > 2:4481198/1‑151 GCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGG < 2:3057058/151‑1 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG < 1:742882/151‑1 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG > 2:2506969/1‑151 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGAGCG > 1:947442/1‑151 TGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATTGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGT < 2:6352315/151‑1 GGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTG > 1:4225371/1‑151 GCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCACCTCAGTGGTCGTGGCGACGTGGGCCCCCCCGTGCAGGTGCGTGA > 2:3892818/1‑151 GCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGA > 1:623245/1‑151 AACACGTCCCCAACCAGCAGGGTTATCGCCCCGGGCATGGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCTATCTGGGGATCGGCCTTGCCGGCGGCCAACTCAGTGGTCGGGGCGAAGTGGGCACCGCCGTGCAGGTGCGTGACG < 2:1971936/151‑1 ACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGC > 1:7105074/1‑151 CACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCG < 2:1474861/151‑1 CAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAA < 1:3053521/151‑1 AGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACCTCC > 2:1403254/1‑151 GCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGC < 2:7049154/151‑1 GCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGC > 2:2535371/1‑151 CTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTc > 2:2794277/1‑150 CTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTc > 1:2444788/1‑150 GGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTCGCG > 1:4280960/1‑151 GGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACT < 1:360569/151‑1 GTCCCCGGCCCGGACATCGCTGGCGGCGATACCGACCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCCACATCCTCGCGA < 2:1361357/151‑1 TCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGG < 1:3774880/151‑1 CACCGCCCCAGACATCGATGGCGAC‑‑‑ACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGC > 2:6915030/1‑151 CGCCCCAGACATCGATGGCGAC‑‑‑ACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACT > 1:1426514/1‑151 GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |