| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 1027 total aligned reads displayed.
ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 | cGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCc > 2:26274‑M1/1‑150 (MQ=255) caccacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGAc > 1:1665239/1‑151 (MQ=255) accacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACa > 1:6177313/1‑151 (MQ=255) accacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACa > 1:971583/1‑151 (MQ=255) ccacGGTGCTGGGTAGCGTGGTAGGTGGCGCTGCCGGCAGCTTCAGCATCCCCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacat < 2:3524975‑M1/151‑7 (MQ=255) cacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatc > 1:2422658‑M1/1‑144 (MQ=255) tgCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑gg > 1:1418368/1‑151 (MQ=255) gggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCCCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcgcc > 2:5992896‑M1/1‑135 (MQ=255) ggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcg > 1:1545664‑M1/1‑134 (MQ=255) ggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGaca > 1:1006002/1‑151 (MQ=255) ggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGaca < 2:1241943/151‑1 (MQ=255) ggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCCAT‑‑‑GGCGaca > 2:5655184/1‑151 (MQ=255) gTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGacac > 1:1082987/1‑151 (MQ=255) tAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcacc > 2:6427193/1‑151 (MQ=255) tAGCGGGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcacc < 1:4468678/151‑1 (MQ=255) tGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc < 1:5588703/151‑1 (MQ=255) ggTAGTTGGCGCTAGCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCg < 2:6593488/151‑1 (MQ=255) ggTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccacc < 1:348935‑M1/151‑26 (MQ=255) gTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccc < 2:1143863‑M1/151‑27 (MQ=255) tAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccacccc < 1:5902799‑M1/151‑28 (MQ=255) tAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGcc < 1:1975708/151‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTg < 1:3836923/151‑1 (MQ=255) ttGGCGCGACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGa < 2:6275969/151‑1 (MQ=255) 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aGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCgg > 2:6678485/1‑151 (MQ=255) gcgACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCg < 1:6940365/151‑1 (MQ=255) gcgACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCg < 1:777459/151‑1 (MQ=255) gACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGACGCACCGACCAACCCGGTGATCAGCCCTGCCGGCAGCCAACCCAGCGGTCAGGGCCAAGTGGGCACCACCgcg > 2:819109/1‑149 (MQ=255) cGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAg < 1:6765075/151‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAgg > 1:4708531/1‑151 (MQ=255) aTGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGACGTGGGCACCACCGTGCAGGt > 1:3917688/1‑151 (MQ=18) aTGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGACCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGt < 1:3382437/151‑1 (MQ=18) tGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTg > 2:2724782/1‑151 (MQ=18) ggCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGacg > 2:3786158/1‑149 (MQ=17) ggCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGacg < 1:5303708/151‑3 (MQ=17) gCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTgcgtgacgc < 1:2493183/151‑7 (MQ=17) aaCACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacg < 1:4916718‑M1/151‑120 (MQ=255) cacaTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCa > 1:1199338/1‑151 (MQ=255) aTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGc > 2:2021695/1‑151 (MQ=255) cAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaa > 2:1750570‑M1/1‑22 (MQ=255) cAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGt > 1:5479672/1‑151 (MQ=255) aCCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaaca > 2:5423577‑M1/1‑20 (MQ=255) cAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatc > 1:180835‑M1/1‑18 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcctc > 1:207713‑M1/1‑15 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGcc < 2:443670/151‑1 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGCGCGCGATGACGCAGGCACCGTCATCGcc > 2:6169356/1‑151 (MQ=255) cGGTCACCGCCCCagacatcgatggcgacaccaccccgcctgaagcaccgaccaacctggtgatcagcgctgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatccctgcgac > 2:3114025‑M1/1‑13 (MQ=255) ggTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcctcgcg < 2:1626312‑M1/151‑140 (MQ=255) ggTCACCGCCCCagacatcgatggcgacaccaccccgcctgaagcaccgaccaacctggtgatcagcgctgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatccttgcgact < 1:360524‑M1/151‑140 (MQ=255) cACCCCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGGTGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGc < 1:7229616/151‑1 (MQ=255) cGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACg < 1:2212921/151‑1 (MQ=255) | ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |