New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | CP009974 | = 1156366 | 0 (0.000) | coding (453/564 nt) | RPPX_05120 | hypothetical protein |
Only 100 of 392 total aligned reads displayed.
GACAGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCGGGGCGGTGGTGTCGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATTGACCGTGCCCGTGGCAATTACGGTGCCTGCGTCATCGCGCACCTGAACGCTGGTACCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGC > CP009974/1156216‑1156514 | gacggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTcc < 1:4766813/147‑1 (MQ=255) acggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGGGGTATCGCCGCCATCGACGTCCg > 2:6450778/4‑151 (MQ=14) aCAGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTgggg < 1:157459‑M2/151‑5 (MQ=255) 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tCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgc < 1:1470248‑M2/151‑35 (MQ=255) aCGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgcca < 2:2738174‑M2/151‑37 (MQ=255) aCGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgcca > 1:98798‑M2/1‑115 (MQ=255) cGCTCCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccag > 1:947442‑M2/1‑114 (MQ=255) cGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccag < 1:730346‑M2/151‑38 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |