Predicted mutation | ||||||
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MC JC | CP009974 | 5,273,059 | Δ2,603 bp | RPPX_23450–[RPPX_23460] | RPPX_23450, RPPX_23455, [RPPX_23460] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | CP009974 | 5273059–5275656 | 5275661 | 6–2603 | 369 [0] | [0] 369 | RPPX_23450–[RPPX_23460] | RPPX_23450,RPPX_23455,[RPPX_23460] |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP009974 | = 5273058 | 0 (0.000) | 354 (1.020) | 189/286 | 0.2 | 100% | intergenic (‑275/+106) | RPPX_23445/RPPX_23450 | transporter/ATPase AAA |
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Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
GCGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/5272902‑5273058 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctatgAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGACA > CP009974/5275662‑5275811 CGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGC < 1:5000052/151‑1 CGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGC < 2:1874609/151‑1 GATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCC > 2:5209564/1‑151 GATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCC > 1:2844178/1‑151 ACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAA > 1:6660520/1‑151 ACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAA < 1:3610126/151‑1 CGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAA < 1:6416338/151‑1 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> 2:1082953/1‑151 GTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGA > 1:5697310/1‑151 ATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAACAATTCCCTCGGTGCGCGCGAGGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCGATGAAAGGCTGATGGCTGAGG > 2:760322/1‑151 TCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGg > 1:7153231/1‑150 TCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGT > 2:2053030/1‑151 AACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTA > 2:3585314/1‑151 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GGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGG > 1:5817051/1‑108 TCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGAT > 1:5414808/1‑151 AGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCG < 1:4623518/151‑1 GACCATGCAGGAGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGCTACTCCCCGAACTCGGCCCAAAGCTTGATCGT > 2:422551/1‑151 ACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTG > 2:6157792/1‑151 CCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCCAGGCTTGATCGTGA > 2:4295771/1‑151 CCATGCAGGTGGCGGTTGCTGCGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCACCTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGA < 2:4762396/151‑1 ATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAG > 2:2264445/1‑151 catGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGCAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGG < 2:6240995/148‑1 AGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGA < 1:1105406/151‑1 GTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACC < 2:3040296/151‑1 TCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGT < 1:1165924/151‑1 TTCTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGG > 1:3067993/1‑151 TCTACGGTGCTTGAGGCATATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTCTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGATACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGA < 1:3490137/151‑1 CTACGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGAT > 2:3239879/1‑151 CGGTGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTC > 1:2120412/1‑151 TGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCG < 2:5322381/151‑1 TGCTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCG > 1:1996478/1‑151 CTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTGCGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCC < 2:5520417/151‑1 CTTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGCACCCGCTGTGGATCTCGCGCC > 2:5062561/1‑151 TTGAGGCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCA < 1:4798516/151‑1 GCCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTC > 2:7244872/1‑151 CCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCT < 1:3237770/151‑1 CCTATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCT < 1:6819940/151‑1 ATGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGA > 1:5645936/1‑151 TGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGAC < 1:4223589/151‑1 TGAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGCTCTGGATCTCGCGCCAGCCTCTTGAC > 2:4390741/1‑151 GCGATGAAACGGGACGGAACGCGTATTCGAACTGTCATGGGTGAAATCCAGTCGCGGATAGCCTCTCGAACCTACACACCAGGCGCAAGAATTCCCTCGGTGCGTGCGATGGCTCAGACCATGCAGGTGTCGGTTTCTACGGTGCTTGAGGCCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/5272902‑5273058 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctatgAAAGGTTGATGGCTGAGGGTGTACTCAACTCTCGTCCTGGCTCCGGCTTTTACGTAGCCGGGCCAGTGGCGCCCTTGGTACTCACCGAACTCGGCCCAAGGCTTGATCGTGAAGTGGACCCGTTGTGGATCTCGCGCCAGTCTCTTGACA > CP009974/5275662‑5275811 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |