| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 CCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCAC < 1:1648751/151‑1 CCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCAC > 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GACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCTCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACC < 2:4182427/151‑1 GACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACC > 1:2457793/1‑151 ACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCCCCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCG < 2:1981633/151‑1 CCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGT < 2:3901084/151‑1 CCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGT < 2:3661286/151‑1 CGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTG > 1:2114733/1‑151 CCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCGCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGT < 2:4156422/151‑1 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG > 1:4192885/1‑151 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG < 2:1729904/151‑1 GCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGA < 1:375875/151‑1 cTCGCCAACCAGCGCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCC < 2:2669310/150‑1 ATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCTCCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCC < 1:5379419/151‑1 CGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGG < 2:1354771/151‑1 CCAGCACGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGACGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACAT < 2:1627317/151‑1 CAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATC < 1:4396491/151‑1 GCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCT < 2:1866673/151‑1 CTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTc < 2:2309279/151‑2 CTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTc > 2:778634/1‑150 TCGCTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAAGCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTcg < 2:3827421/151‑3 TCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGG > 1:2330507/1‑151 CGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACT > 2:3118360/1‑151 CCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT > 1:3307737/1‑151 GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |