| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP009974 | = 1155303 | 505 (1.850) | 271 (1.060) | 162/282 | 0.2 | 53.3% | coding (2003/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | = 1156366 | 1 (0.000) | coding (453/564 nt) | RPPX_05120 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
GACAGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCGGGGCGGTGGTGTCGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATTGACCGTGCCCGTGGCAATTACGGTGCCTGCGTCATCGCGCACCTGAACGCTGGTACCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCTG > CP009974/1156216‑1156516 | gACGGTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTcc > 1:4815963/1‑151 (MQ=255) ggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggg < 1:4304030/150‑1 (MQ=255) aGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTggggcg > 2:3118360‑M2/1‑145 (MQ=255) aGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTggggcg > 1:2310144‑M2/1‑145 (MQ=255) gTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCgggg > 2:929805/1‑151 (MQ=255) gTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCGCGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTggggcgg > 2:3858533‑M2/1‑144 (MQ=255) ccAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTggggcggtga < 2:5067691‑M2/151‑11 (MQ=255) ccAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGCGGT‑‑‑GTCGCCATCGATGTCTGGGGCggtgg > 2:3262920/1‑151 (MQ=17) ccAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGATCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTGTCGCC‑‑‑ATCGATGTCTggggcggcga < 2:899277‑M2/151‑11 (MQ=255) ggTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCGGGGCggtg > 2:1556762/2‑151 (MQ=255) aGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGT‑‑‑GTCGCCATCGATGTCTGGGGCggtgacc < 1:3933631/151‑4 (MQ=14) aGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGGGCTTCAGGCGGGGTGGT‑‑‑GTCGCCATCGATGTCTGGGGCggtgacc > 2:1392973/1‑148 (MQ=14) gTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtga > 2:1822350‑M2/1‑141 (MQ=255) tCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgac < 2:1193949‑M2/151‑12 (MQ=255) tCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGT‑‑‑GTCGCCATCGATGTCTGGGGCggtgaccga < 1:3401061/151‑6 (MQ=11) cgcgAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgacc > 2:1208737‑M2/1‑139 (MQ=255) cGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAGCGCTGATCACCAGGTTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGT‑‑‑GTCGCCATCGATGTCTGGGGCggtgaccgag > 1:494908/1‑145 (MQ=14) gcgaGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCGGGGCggtgaccg > 2:3750183/4‑147 (MQ=255) cgaggATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccga > 1:3333076‑M2/3‑137 (MQ=255) cgaggATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccga < 2:4741193‑M2/149‑15 (MQ=255) gATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctg < 1:4396491‑M2/151‑19 (MQ=255) gATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGGGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctg > 1:4221808‑M2/1‑133 (MQ=255) ttGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttg > 1:994977‑M2/1‑129 (MQ=255) 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cACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatcg > 1:2114733‑M2/1‑106 (MQ=255) cGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatcggt < 1:1366592‑M2/151‑48 (MQ=255) ggtggtGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggagcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatcggtc < 2:4182427‑M2/151‑49 (MQ=255) tggtgCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatcggtcgc > 1:1149653‑M2/1‑101 (MQ=255) tgCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggttggcgatgtgttgccagcggcatcggtcgcggt < 2:4959450‑M2/151‑54 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |