| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 792 total aligned reads displayed.
ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 | aCGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC > 1:2468491‑M1/1‑151 (MQ=255)aCGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC > 2:2368645‑M1/1‑151 (MQ=255) cGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCa < 1:672124/151‑1 (MQ=255) ggCACCACTGTGCTGGGTTGCGTGGTAGTTGGCGCCGCCGGCAGCTTCCTCCTCTCTCTCGACCCGCCACGAGTTGCCGGCGAAGTGCTACTGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCgg < 2:4768097‑M1/151‑3 (MQ=255) ggCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCgg > 1:4851773‑M1/1‑149 (MQ=255) ggCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAg > 1:4724128/1‑151 (MQ=255) gCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGa > 2:178675/1‑151 (MQ=255) accacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggaca < 1:1011935‑M1/151‑6 (MQ=255) cacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATc > 2:1409445/1‑151 (MQ=255) acTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcg > 2:3363062‑M1/1‑143 (MQ=255) cTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCg < 2:370533/151‑1 (MQ=255) gggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggc > 1:2413995‑M1/1‑135 (MQ=255) tAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcacc < 1:756332/151‑1 (MQ=255) aGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GCCGAcacca > 2:1592882/1‑151 (MQ=255) gCGGGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcaccac < 2:3283776/151‑1 (MQ=255) tGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc < 1:4765846/151‑1 (MQ=255) tGGTAGTTGGAGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc < 1:588391/151‑1 (MQ=255) gggTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc < 1:866443/150‑1 (MQ=255) 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ccGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCGCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggt < 2:4156422‑M1/151‑112 (MQ=255) gCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTgcgtg < 2:40751/151‑3 (MQ=18) cTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcg < 2:1729904‑M1/151‑115 (MQ=255) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgt > 2:2054613‑M1/1‑36 (MQ=255) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGAt > 2:3943398/1‑151 (MQ=255) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGac > 1:3817274/1‑150 (MQ=17) ggCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtg > 2:3449518‑M1/1‑35 (MQ=255) cAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgac < 1:5377530‑M1/151‑119 (MQ=255) acacATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgc < 1:5131970‑M1/151‑121 (MQ=255) caTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAgg < 1:5279953/151‑1 (MQ=255) tCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCa > 1:2995626/1‑151 (MQ=255) cGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccgg < 2:1354771‑M1/151‑127 (MQ=255) cGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCAc > 2:5435616/1‑151 (MQ=255) cGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCCGCCGGCaa > 2:4659020/1‑150 (MQ=14) ccAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggca < 1:3503859‑M1/151‑129 (MQ=255) cgcTCGGTCACCGCCCCggacgtcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcc < 2:5274398‑M1/150‑135 (MQ=255) aGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTg > 1:1162109/1‑151 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcctc > 2:778634‑M1/1‑15 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGAc > 1:4003413/1‑133 (MQ=255) cTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGcc < 1:975151/151‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACg > 2:4203584/1‑151 (MQ=255) gTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatcctcgcga < 2:1193949‑M1/151‑141 (MQ=255) gTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACgg > 2:3058989/1‑151 (MQ=255) tCACCGCCCCagacatcgatggcgacaccaccccgcctgaagcaccgaccaacctggtgatcagcgctgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaacatccttgcgactgg > 1:2330507‑M1/1‑10 (MQ=255) cACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGc > 1:2880961/1‑151 (MQ=255) cACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGc < 1:3111115/151‑1 (MQ=255) ccGCCCCagacatcgatggcgacaccaccccgcctgaagcaccgaccaacctggtgatcagcgctgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgcgacgcggccggcaacatccttgcgactggcac > 2:3858533‑M1/1‑7 (MQ=255) | ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCAA > CP009974/1155153‑1155453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |