| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | 1154854 = | 263 (1.000) | 424 (2.270) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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| ? | CP009974 | 1155783 = | 3 (0.010) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 696 total aligned reads displayed.
TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATC > CP009974/1155783‑1155929 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACCCGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGG > 2:4788300/1‑151 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TCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCTGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGT > 1:2607907/1‑151 CGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCTGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTC < 2:519365/151‑1 CGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTGGGCGTCATGCACTTGAACACGGCGGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTC < 2:1389268/151‑1 GGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCTGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTA > 2:3524649/1‑151 GGCCGGCCACCGCGCTGCCGAGCAGCGTGCCGTTGGCGGCATGCGCTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTA < 1:4927098/151‑1 GCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCTGCATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTAC > 1:1984878/1‑151 tGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCG > 1:4458032/2‑151 GCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGG > 1:3521519/1‑151 CACCGCACTGCCAATCAGCGGGCCGTTGGCGTCGTGCACTTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCTGCATCGATGGCCGGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTA < 2:1673853/151‑1 atggCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACCTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAG > 1:3688506/5‑151 tggCACTGCCAATCACCGTGCCGTTTGCATCATGCACTTCCACACGGCTGCCCGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGCAGCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCCTACTCGGTAGC > 2:311815/4‑151 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aGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGCGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCT > 2:2393074/2‑151 CGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGA > 1:3409975/1‑151 GCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAG > 1:3070095/1‑151 GCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAG > 1:2424840/1‑151 GGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGCGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCCCCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCG > 2:3604215/1‑151 CGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGG > 1:712450/1‑151 TGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGC < 2:641898/151‑1 AGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGA > 1:3972828/1‑151 GTGGTGCCAGCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGAT < 2:3866251/151‑1 GGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCG > 1:273337/1‑151 GTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGA < 2:2425288/151‑1 CCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCCGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCc > 2:3992089/1‑150 gcgGGATCGGTGGCGAGATTGCGCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGA < 2:2858617/148‑1 TCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCCACTGCTCCCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGA > 2:5121250/1‑151 ATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCACTGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCACCTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGT > 2:261419/1‑151 TGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTT > 2:4450932/1‑151 gGATTGGTGGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAC < 2:220548/150‑1 AGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAC > 2:2738930/1‑151 ATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCG < 1:46122/151‑1 tggTCGTGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAC < 2:4351650/148‑1 TCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAc > 2:4597162/1‑150 TCGAGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGGAGCATTGCCGCCTGGCTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGTTGCCGTTGGCCCCGACCAc < 1:1456354/151‑2 GGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAcac < 2:1265819/151‑4 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATC > CP009974/1155783‑1155929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |