New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | 1154854 = | 263 (1.000) | 424 (2.270) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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? | CP009974 | 1155783 = | 3 (0.010) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
Only 100 of 565 total aligned reads displayed.
GTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCT > CP009974/1155633‑1155930 | ggtcgggggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggct < 2:4615379‑M2/1‑1 (MQ=255) cgagggtgagggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTc < 2:3601603‑M2/4‑1 (MQ=255) cgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTc < 1:1440252‑M2/4‑1 (MQ=255) cgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTc > 2:4941570‑M2/148‑151 (MQ=255) cgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTc < 1:3683235‑M2/4‑1 (MQ=255) gtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtgg > 2:4231553‑M2/137‑151 (MQ=255) gaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTc > 1:2702856‑M2/135‑151 (MQ=255) agctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccactcggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCaa < 2:1709848‑M2/19‑1 (MQ=255) ctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATg > 1:1368423‑M2/131‑151 (MQ=255) tgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCg > 1:5157314‑M2/130‑134 (MQ=255) gccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGt < 1:1845057‑M2/23‑1 (MQ=255) cgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGtag > 2:1852100‑M2/127‑150 (MQ=255) cgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAc > 1:1755288‑M2/127‑151 (MQ=255) 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ccaatcagcgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatctgcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAg > 1:5009753‑M2/104‑151 (MQ=255) ccaatcaacgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcagcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAg > 1:2511916‑M2/104‑151 (MQ=255) ccaatcaacgtgccgttggcatcatgcacctccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCAGCGAAg > 1:4026927‑M2/104‑151 (MQ=255) caatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGc > 2:2712613‑M2/103‑151 (MQ=255) caatcaacgtgccgttggcatcatgcacttccacacggctgccagcaggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcagcatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGc < 1:4109360‑M2/49‑1 (MQ=255) 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gtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCgg > 2:4448999‑M2/50‑151 (MQ=255) taccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGc < 1:4607322‑M2/103‑1 (MQ=255) agcggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagcttgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGcc < 2:527341‑M2/104‑1 (MQ=255) ccggtgagggtggtgctatcaggagcgatgggcggattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCg < 1:1144937‑M2/105‑1 (MQ=255) cggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGGGCGGCCgg > 1:3154686‑M2/46‑151 (MQ=255) cggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCgg > 2:249586‑M2/46‑151 (MQ=255) ggggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCga < 2:1129809‑M2/111‑1 (MQ=255) agggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCga > 1:3972828‑M2/41‑151 (MQ=255) ggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCgaga > 2:5162687‑M2/39‑151 (MQ=255) ggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAgatcg > 1:273337‑M2/36‑151 (MQ=255) 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atggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGt > 2:2210502‑M2/20‑151 (MQ=255) tggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGtt < 1:618616‑M2/133‑1 (MQ=255) ggcccgattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTg < 2:179953‑M2/134‑1 (MQ=255) ggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTg > 2:583050‑M2/18‑151 (MQ=255) agattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAc > 2:2088734‑M2/14‑151 (MQ=255) gggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCACGAAGGTGCCGTTGCCACCGaccacac > 2:1056515‑M2/5‑148 (MQ=255) ggcTGGCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGGACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCgaccacacc < 1:3196479‑M2/148‑5 (MQ=255) | GTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCT > CP009974/1155633‑1155930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |