| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 841 total aligned reads displayed.
CCCGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCACTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAT > CP009974/1154704‑1155004 | cccggccgctcaggcaggcgagcagttgagcctggagcagaccggcccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgccagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacc > 2:2402779‑M1/151‑151 (MQ=255) cgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcgggggctaccgagtacgacgtaccattgaccgccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTAcc > 2:3604215‑M1/145‑151 (MQ=255) cgctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtccgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagccatctagccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTAcc < 1:4017213‑M1/7‑1 (MQ=255) ctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACcgc > 2:548690‑M1/143‑151 (MQ=255) ctcagccaggcgagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACcgc > 1:3070095‑M1/143‑151 (MQ=255) acAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACcgcg < 1:1666933/150‑1 (MQ=2) aGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCgcc > 2:1628024/1‑151 (MQ=9) ccAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCgccgg < 1:2064666/151‑1 (MQ=16) 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gagcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCa > 2:4965136‑M1/132‑151 (MQ=255) agcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGcag < 2:2309871‑M1/21‑2 (MQ=255) gcagttgagcctggtgcagaccgacccaagcggtaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGgcagt < 2:1421893‑M1/22‑3 (MQ=255) gTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCGGTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCgt < 2:1293462/151‑1 (MQ=255) agcctggtgcagaccgacccaagcggcaatgcttcggtggctaccgagtacgacgtaccattgaccaccgcgcccgacagcccgagcaatctggccatcgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTgg > 1:4507927‑M1/123‑151 (MQ=255) 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tcgatgcagatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGa < 1:266310‑M1/126‑1 (MQ=255) cgatgcagatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAg < 1:1515941‑M1/127‑1 (MQ=255) cgatcctgatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCgaa < 2:5165328‑M1/127‑2 (MQ=255) atgcagatggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAgct < 2:5097133‑M1/129‑1 (MQ=255) aaGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAgctgct > 1:3149649/1‑151 (MQ=255) aCGGCGGCAGCAGCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGa < 2:3550046/151‑1 (MQ=255) ggcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACg < 2:333258‑M1/137‑1 (MQ=255) gcaccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGt < 1:1086547‑M1/138‑1 (MQ=255) caccaccctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTg > 1:4788634‑M1/13‑151 (MQ=255) gcagcaTCAGCGGTGCCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGt < 2:4795476/151‑1 (MQ=255) caccctcacCGGTACCGCGCCGGCTGGCAGTCGTGTTGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTc > 2:4362979‑M1/10‑151 (MQ=255) agcaTCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCg < 2:3992035/151‑1 (MQ=255) ctcacCGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCa > 1:4927926‑M1/6‑151 (MQ=255) aGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCAGCCTCAGGCCCACGGCGAGCTGCTGGACGGGGTCGCCATCg > 2:2696189/1‑151 (MQ=255) cGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGGAGTGCATGATGCCAACGGCACGTTGATTGGCAGTGCCATTGCCAACGCCGATGGCAGCTTCAGCATCGAACTGAATCCCGCACAAGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAt < 2:261579/151‑1 (MQ=2) cGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGTTGATTGGCAGTGCCATTGCCAACGCCGATGGCAGCTTCAGCATCGAACTGAATCCCGCACAAGCCAACGGCGAACTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAt < 1:4631341/151‑1 (MQ=2) cGGTACCGCGCCTGCTGGCAGCCGTGTGGAAGTGCATGATGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCAGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTGAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAt > 2:4692635/1‑151 (MQ=11) | CCCGGCCGCTCAGCCAGGCGAGCAGTTGAGCCTGGTGCAGACCGACCCAAGCGGCAACGCTTCCTCGGCACTGCAATTCGAAGTCCCGGTCACCACTGCGCCTGCCAGCCCCAGCGACCTGGTGTTCGCCGAAGACGGCAGCAGCATCAGCGGTACCGCGCCGGCCGGCACCCGTGTGGAAGTGCATGACGCCAACGGCACGCTGATTGGCAGTGTGGTGGCTGGCCCCGACGGCAGCTTCACCGTCACCCTCGACCCGCCTCAGGCCAACGGCGAGCTGCTGGACGTGGTCGCCATCGAT > CP009974/1154704‑1155004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |