| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTATAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGTAACACATCGCCCACCAGCTCGGTC > 1:1931189/1‑151 GCCGCCGCCGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCA < 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< 1:4895969/151‑1 CGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTG < 2:1154542/151‑1 CGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTG > 1:4477691/1‑151 GCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGC > 1:2918626/1‑151 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG < 1:1005542/151‑1 CTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCG < 2:3863349/151‑1 GCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGA > 2:1851586/1‑151 GCAACACAGCGCCAACGAGCGCGGGCACCGCCCCGGGCATCGACGGCGGCGATAGCACCTCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGACGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGA < 2:477811/151‑1 ACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGC < 1:4263161/151‑1 ACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGGGAGCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGCAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGGGACGC > 2:277509/1‑151 ATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCC > 2:3222758/1‑151 GCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGC > 2:571623/1‑151 GCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGC < 1:4218393/151‑1 CCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCA < 1:508095/151‑1 CAACCAGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAA < 1:4624150/151‑1 AGCTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCCCCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCC < 2:3345814/151‑1 CTCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTc < 1:4167893/151‑2 TCGGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTcg > 1:2663272/1‑149 GGTCACCGCCCCGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTCGCG < 1:2774428/151‑1 TCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGG > 2:1022587/1‑151 CACCGCCCCGGAGATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGC < 2:1401725/151‑1 CCGCCCCAGACATCGATGGCGCC‑‑‑ACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCACCCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCACCTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCAC < 1:3740129/151‑1 GCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTG > 2:3286041/1‑151 GGCCGCCGACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/1155145‑1155303‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caccgccccGGACATCGATGGCGGCGATACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAATCTGGTGATCGGCCTTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGACGCGGCCGGCAACATCCTTGCGACTGGCACTGT < CP009974/1156366‑1156217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |