| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009974 | = 1156366 | 0 (0.000) | coding (453/564 nt) | RPPX_05120 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
GACAGTGCCAGTCGCAAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCGGGGCGGTGGTGTCGCCATCGGTGATGGCCGGGTTCAAGGTGATGGCGAAGGTACCATCCGGATTGACCGTGCCCGTGGCAATTACGGTGCCTGCGTCATCGCGCACCTGAACGCTGGTACCGGCTTCGCCTCGACCGCTGAGCTGGCT > CP009974/1156216‑1156515 | gacggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTcc < 1:4249979/147‑1 (MQ=255) acggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCg > 2:819541/4‑151 (MQ=255) ggTGCCGGTCGCGAGGATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggg > 1:4575253/2‑151 (MQ=255) 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ggATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagct < 1:623910‑M2/151‑18 (MQ=255) gATGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctg > 2:2798964‑M2/1‑133 (MQ=255) aTGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctgg > 2:3838470‑M2/1‑132 (MQ=255) aTGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctgg > 2:1091376‑M2/1‑132 (MQ=255) tGTTGCCGGCCGCGTCACGCACCTGCACGGTGGTGCCCACTTCGCCACGACCACTGAGTTGGCTGCCGGCAAGGCCGATCACCAGATTGGTCGGTGCTTCAGGCGGGGTGGTATCGCCGCCATCGATGTCCggggcggtgaccgagctggt < 1:2969745‑M2/151‑21 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |