| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 720 total aligned reads displayed.
ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCA > CP009974/1155153‑1155452 | cGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCa < 2:5186308/151‑1 (MQ=255) gCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGa > 1:45300/1‑151 (MQ=255) ccacTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGGCGGCGCTCCCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACAt < 1:1303947/151‑1 (MQ=255) gtgCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGCAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACACCGCCAACCAGCCCGGTCACCGCCCCggacaccgacg > 2:4973220‑M1/1‑140 (MQ=255) gggTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggc > 1:353217‑M1/1‑135 (MQ=255) tAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgat < 1:588490‑M1/151‑20 (MQ=255) tAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcacc > 2:121473/1‑151 (MQ=255) ggCGTGGTAGGTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCTACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcacca < 2:4799451/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgctc > 2:3245882‑M1/1‑131 (MQ=255) gggTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGAcaccac < 2:1400591/149‑1 (MQ=255) gTGGTAGTTGGCGCTACCGGCGGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAccc > 2:3869161/1‑151 (MQ=255) tGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccac < 2:3474029‑M1/151‑25 (MQ=255) tGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc > 1:3641840/1‑151 (MQ=255) tGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccc > 1:689962/1‑151 (MQ=255) ggTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCCGACATCGAT‑‑‑GCCGACACCAccccc > 1:4488908/1‑150 (MQ=255) ggTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCAcccct > 1:4415447/1‑150 (MQ=255) tAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑AGCGCCACCACCCCGcc > 2:313487/1‑151 (MQ=255) aGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccg < 2:4527924‑M1/151‑29 (MQ=255) 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gACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGtt < 1:4908178/151‑1 (MQ=255) ccGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGtgcg > 1:2791183/1‑148 (MQ=21) cGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtg > 1:3345814‑M1/1‑45 (MQ=255) cGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcacc > 2:4266010‑M1/1‑45 (MQ=255) gATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAgg > 1:1419801/1‑151 (MQ=18) gATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCAGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAgg > 2:5026346/1‑151 (MQ=18) aTGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgca > 1:3600451‑M1/1‑43 (MQ=255) ccGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggt > 2:5067259‑M1/1‑40 (MQ=255) cGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCCCCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTgcgt < 2:2765625/151‑2 (MQ=18) cTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcg < 1:1005542‑M1/151‑115 (MQ=255) cTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGa > 1:371679/1‑151 (MQ=18) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgt < 2:2013386‑M1/151‑116 (MQ=255) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgg > 2:1087959‑M1/1‑36 (MQ=255) tGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAACTCAGTGGTCGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGac > 2:157002/1‑150 (MQ=17) aaCACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCCGACATCGAT‑‑‑GCCGACACCACACCGCCTGACGCACCGCCCACCCGGGTGATCAGCGCTCCCGGCAGCCAACTCAGTGGACGTGGCGAAGTGGGCACCACCGTGCAGGTGCGTGacgcgg > 2:3379574/1‑146 (MQ=14) aTCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggcc < 1:848966‑M1/151‑125 (MQ=255) cGCCGACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCAc > 2:4316406/1‑151 (MQ=255) gCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggc < 1:4218393‑M1/151‑128 (MQ=255) cAACCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaa < 1:2702058‑M1/151‑130 (MQ=255) agcagCTCGGGCACCGCCCCtgacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaggcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaaca < 2:4754066‑M1/149‑132 (MQ=255) aCCAGCTCGGTCACCGCCCCggacatcgatggcggcgataccaccccgcctgaagcaccgaccaatctggtgatcggccttgccggcagccaactcagtggtcgtggcgaagtgggcaccaccgtgcaggtgcgtgacgcggccggcaaca < 1:2969745‑M1/151‑132 (MQ=255) cAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAAtt < 1:3192840/151‑1 (MQ=255) aGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTg > 2:1448856/1‑151 (MQ=255) gggTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCAc < 1:4019715/150‑1 (MQ=255) ggTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACg < 1:5066093/151‑1 (MQ=255) gTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCCCCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACgg < 2:1953963/151‑1 (MQ=255) cACCGCCCGCGACATCGAT‑‑‑GCCGACACCACCCCGCCTGACGCACCGACCAACCTGGTGATCGGCGCTGCCGGCAGCCAGCGCAGCGGTCGTGGCGAAGCCCGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGc < 2:181036/151‑1 (MQ=21) | ACGGCACCACTGTGCTGGGTAGCGTGGTAGTTGGCGCTACCGGCAGCTTCAGCATCACCCTCGACCCGCCACAAGTTGACGGCGAAGTGCTACAGGCCACCGCGACCGATGCCGCTGGCAACACATCGCCAACCAGCTCGGTCACCGCCCCAGACATCGAT‑‑‑GGCGACACCACCCCGCCTGAAGCACCGACCAACCTGGTGATCAGCGCTGCCGGCAGCCAGCTCAGCGGTCGTGGCGAAGCCGGTACCAGCGTTCAGGTGCGCGATGACGCAGGCACCGTAATTGCCACGGGCACGGTCA > CP009974/1155153‑1155452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |