| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277572 = | 274 (1.040) | 176 (0.780) | 108/258 | 2.2 | 42.8% | intergenic (+41/+197) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | = 1277722 | 236 (1.040) | intergenic (+191/+47) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS | |||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277740‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCG‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 gggTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCG < 2:3827098/148‑1 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < 1:4079346/151‑1 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCCGGGGTTGGACACCGGCCGTCGCGTAGGCGCGGG > 2:4523752/1‑151 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT > 1:3549396/1‑151 ccgGCGAACGGGCGGGCCCTGCTGCCCTCTTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTA < 1:5029333/148‑1 caCGCGAACGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTA < 2:2325979/149‑1 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AGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > 1:4048592/1‑151 GGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC < 1:3061254/142‑1 GCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTCCACCCACGTCGAGCGTTGGACACAGGCCGTCGCGTACAAGCGGGTTTACCCGCGAccac > 2:4846154/1‑147 CCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAA < 2:73922/148‑1 GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCC < 1:459076/151‑1 GCCCTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCG < 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TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTG < 2:1322983/151‑1 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTA < 1:2543442/151‑1 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTc > 2:4397917/1‑150 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG < 1:2103314/151‑1 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGAGTGGTGGTGGACACACCTCC‑GGGGTTGGACGCAGGCCGTAGTGTAG > 2:3073354/1‑151 GAGCGGGTTGACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGGTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG < 2:1539077/151‑1 CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACGGGCCGTCGTGTAGGAG > 2:2090453/1‑151 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCG > 2:1949918/1‑151 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGA > 2:2749350/1‑99 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGA < 1:2749784/99‑1 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACAC < 1:2078465/130‑1 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT > 1:2682074/1‑151 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT > 1:1307434/1‑151 CCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC < 1:670746/151‑1 CCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC > 2:2013322/1‑151 GCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGCTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < 1:1131412/151‑1 CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCG > 1:3908619/1‑151 GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCC > 2:4653380/1‑126 GAAAGGGCCGGCCCTGCTAGCCACTTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC < 1:4888535/151‑1 AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCT‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGCGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGA > 2:3217182/1‑151 AAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTGG‑AGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA > 2:4023018/1‑151 AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA‑GATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277740‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCG‑GGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |