| Predicted mutation | ||||||
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| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP009974 | 2915703 = | 0 (0.000) | coding (34/267 nt) | RPPX_12980 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
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AGATATGGATGAGATGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTT < 1:5046180/151‑1 ATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGC < 1:1982679/151‑1 gTGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGG < 2:1495051/150‑1 acGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCG < 2:4099257/113‑1 ATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGG < 2:1787030/151‑1 TGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGT < 1:2184855/151‑1 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CTATCACTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCT < 2:693362/151‑1 CTACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGCTGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTTATTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGACTGGGCGTCCATAGCCCTGCTGCCCTTTGTTGCTGTTCTCGCGATTTGGCTGGctgc > 2:3775183/1‑147 TACGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACT > 2:295766/1‑151 CGTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCA < 1:2629039/151‑1 GTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAA < 1:1750216/151‑1 GTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAA < 1:3119982/151‑1 GTCATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAA < 2:2529166/151‑1 CATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAAAC < 2:1548250/151‑1 ATGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAAACC > 1:3300398/1‑151 TGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAAACCA > 1:1516794/1‑151 TGGGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTCGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAAACCA > 2:3070874/1‑151 CAAAGGCTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009974/2912943‑2913099‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcatggGGCAGCGGTGCAGGGCAGGACGTGGATGTTCGCGCGCTGCGACGCTACAACCGCTTGCTTGGCGTGTTGCTGAATGTTGGCGAGTGGGCGTGCATAGGCCTGCTGCCGTTTGTTGCGGTTGCTGCCATCTGGCTGGTGACTCAAACCAAC > CP009974/2915703‑2915852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |