| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP009974 | 2,913,100 | Δ2,603 bp | RPPX_12970–[RPPX_12980] | RPPX_12970, RPPX_12975, [RPPX_12980] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP009974 | 2913100–2915695 | 2915702 | 8–2603 | 259 [0] | [0] 260 | RPPX_12970–[RPPX_12980] | RPPX_12970,RPPX_12975,[RPPX_12980] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | = 2913099 | 0 (0.000) | 239 (0.950) | 158/286 | 0.2 | 100% | intergenic (+953/+106) | RPPX_12965/RPPX_12970 | GABA permease/ATPase AAA |
| ? | CP009974 | 2915703 = | 0 (0.000) | coding (34/267 nt) | RPPX_12980 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
CTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGTGCGGATTCCACGCCATTCGGACACTCAGCCCACGCTGATCCGGACACCTGTTCCACGCTCATTCGGACAGGCAGTCGGAGCGCAGCGACGCAGGGGTGGCATTGTTAGTCCGGGTTGGCTGGCGTCGTCAATTTCTGCGTCCGTTTGCG > CP009974/2912949‑2913249 | gggTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAGATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggc > 2:5048526‑M1/1‑148 (MQ=255) ggTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggca > 1:818113‑M1/1‑147 (MQ=255) gTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcag > 2:2960745‑M1/1‑146 (MQ=255) tGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagc > 2:2575993‑M1/1‑145 (MQ=255) gCTGGGGGGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATATGTCAAAATTTCGCGGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcg < 2:1369919‑M1/151‑8 (MQ=255) gCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcg > 2:1750216‑M1/1‑144 (MQ=255) cTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcgg > 1:1213098‑M1/1‑143 (MQ=255) ggCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtg < 1:1055507‑M1/151‑11 (MQ=255) ggCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtg > 1:653628‑M1/1‑141 (MQ=255) gCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgc < 1:4678864‑M1/151‑12 (MQ=255) gCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgc < 1:4061757‑M1/151‑12 (MQ=255) cGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgca < 1:2478383‑M1/151‑13 (MQ=255) gtgtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGTggcagcggtgcag > 2:2950392‑M1/1‑138 (MQ=255) gtgtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcag > 2:4429584‑M1/1‑138 (MQ=255) tgtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagg < 1:1140666‑M1/151‑15 (MQ=255) gtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcaggg < 2:851906‑M1/151‑16 (MQ=255) gtCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcaggg < 1:1409822‑M1/151‑16 (MQ=255) tCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggc < 2:4721316‑M1/151‑17 (MQ=255) aaaTGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcagg > 1:3920535‑M1/1‑132 (MQ=255) cGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtg > 1:222918‑M1/1‑127 (MQ=255) cGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtg < 2:4390650‑M1/151‑25 (MQ=255) gTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtgg > 1:2077384‑M1/1‑126 (MQ=255) gTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtgg < 1:2902977‑M1/151‑26 (MQ=255) gcgGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatg > 2:7444‑M1/1‑123 (MQ=255) cgGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGagcagcggtgcagggcaggacgtggatgt > 2:4281542‑M1/1‑122 (MQ=255) ggATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgtt > 2:1063670‑M1/1‑121 (MQ=255) ttGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgc < 2:4498752‑M1/151‑34 (MQ=255) tGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcg < 2:163592‑M1/151‑35 (MQ=255) tGCAGGGATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTGTGGATGAAAATGGCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcg < 2:3779770‑M1/151‑35 (MQ=255) cAGGTATTATCTCAATCTGTAAAACTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcg < 1:2377057‑M1/151‑37 (MQ=255) aGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgc > 1:3652149‑M1/1‑114 (MQ=255) gTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctg > 2:4913124‑M1/1‑112 (MQ=255) tatCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgac < 2:278491‑M1/151‑44 (MQ=255) tctcAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgc > 1:4585007‑M1/1‑106 (MQ=255) aaTCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctaca > 1:1225286‑M1/1‑102 (MQ=255) aTCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAAGGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaa < 1:4703654‑M1/151‑51 (MQ=255) tGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccg > 2:3824282‑M1/1‑98 (MQ=255) gTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgc > 1:3851103‑M1/1‑97 (MQ=255) cAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgctt > 2:552971‑M1/1‑95 (MQ=255) aaacTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttg < 2:2062645‑M1/151‑58 (MQ=255) aaaTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgc < 2:284870‑M1/151‑59 (MQ=255) aTTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgctt < 1:2996148‑M1/151‑61 (MQ=255) cGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcg > 1:1684546‑M1/1‑87 (MQ=255) gCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgt > 1:2690541‑M1/1‑86 (MQ=255) tGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgt > 1:5031193‑M1/1‑84 (MQ=255) gTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgtt < 2:1812480‑M1/151‑69 (MQ=255) gTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgtt < 2:3970835‑M1/151‑69 (MQ=255) ttGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttg < 2:2245077‑M1/151‑70 (MQ=255) ttGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttg > 2:4337871‑M1/1‑82 (MQ=255) tGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgc > 1:4482910‑M1/1‑81 (MQ=255) gCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgct < 2:232536‑M1/151‑72 (MQ=255) gCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgct > 1:3544174‑M1/1‑80 (MQ=255) cAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctg > 1:2262115‑M1/1‑79 (MQ=255) tttCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatg < 1:2960745‑M1/151‑77 (MQ=255) cTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttg > 1:3059231‑M1/1‑72 (MQ=255) aaGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggc > 1:1799810‑M1/1‑70 (MQ=255) gTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcga < 1:903937‑M1/151‑84 (MQ=255) tttGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagt < 2:4160406‑M1/151‑86 (MQ=255) tttGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagt < 1:1299530‑M1/151‑86 (MQ=255) ttGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgccgggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtg > 1:3623648‑M1/1‑65 (MQ=255) ttGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtg < 1:1870180‑M1/151‑87 (MQ=255) tGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgg > 2:3597200‑M1/1‑64 (MQ=255) gATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggc > 1:3759677‑M1/1‑62 (MQ=255) aaaaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgc < 1:2401484‑M1/151‑94 (MQ=255) aaaaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgc > 1:4234066‑M1/1‑58 (MQ=255) aaaaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgc > 1:4243959‑M1/1‑58 (MQ=255) aaaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgca > 2:3239856‑M1/1‑57 (MQ=255) aaTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcat < 1:4857140‑M1/151‑96 (MQ=255) aTGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcata < 2:643650‑M1/151‑97 (MQ=255) tGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcatag < 2:899049‑M1/151‑98 (MQ=255) cgccgcATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcc < 2:3522749‑M1/151‑101 (MQ=255) tGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgcc > 2:2128647‑M1/1‑44 (MQ=255) gggaGCGAGATGTGGATGAGCTGGGGTCTATCACTCCGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgcc < 2:3655405‑M1/150‑108 (MQ=255) aGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCAGGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtt < 2:3671793‑M1/151‑111 (MQ=255) agaTATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgtt < 1:1534890‑M1/151‑115 (MQ=255) gaTATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttg < 1:274322‑M1/151‑116 (MQ=255) atatGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgc < 1:1982679‑M1/151‑117 (MQ=255) tatGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcg > 1:4522949‑M1/1‑34 (MQ=255) atGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcg > 1:4099257‑M1/1‑33 (MQ=255) acggatGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcg < 2:4099257‑M1/113‑83 (MQ=255) tGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggt < 1:2184855‑M1/151‑120 (MQ=255) tGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggg > 2:200485‑M1/1‑32 (MQ=255) gATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttg < 2:1073789‑M1/151‑122 (MQ=255) tgcgctgGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgtcgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgct < 2:3117733‑M1/148‑124 (MQ=255) gCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgcc > 2:5236265‑M1/1‑25 (MQ=255) gggTCTATCACTACGTCCTGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatct < 1:575278‑M1/151‑131 (MQ=255) ggTCTATCGCTAGGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgcggcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctg < 1:4795526‑M1/151‑132 (MQ=255) ggTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctg < 1:4150993‑M1/151‑132 (MQ=255) gTCTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctgg > 1:3181779‑M1/1‑19 (MQ=255) cTATCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggct < 2:693362‑M1/151‑135 (MQ=255) aTCACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctgg > 1:2016505‑M1/1‑15 (MQ=255) cACTACGTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtg > 2:3392082‑M1/1‑13 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 1:1750216‑M1/151‑145 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 2:2529166‑M1/151‑145 (MQ=255) gTCATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaa < 1:3119982‑M1/151‑145 (MQ=255) cATGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaac < 2:1548250‑M1/151‑147 (MQ=255) aTGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaacc > 1:3300398‑M1/1‑4 (MQ=255) tGGggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaacca > 1:1516794‑M1/1‑3 (MQ=255) ggggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaaccaa > 2:3329958‑M1/1‑2 (MQ=255) gggcagcggtgcagggcaggacgtggatgttcgcgcgctgcgacgctacaaccgcttgcttggcgtgttgctgaatgttggcgagtgggcgtgcataggcctgctgccgtttgttgcggttgctgccatctggctggtgactcaaaccaac < 2:24237‑M1/151‑151 (MQ=255) | CTCGGGTGCTGGCGTGTCAAAATGCGTCGCGGATTGCAGGTATTATCTCAATCTGTCAAAATTTCGCTGTTGCAGCTTTCTAAGTTTTGGATGAAAATGCCGCCGCATGGAGCGAGATATGGATGAGCTGGGGTCTATCACTACGTCATGGTGCGGATTCCACGCCATTCGGACACTCAGCCCACGCTGATCCGGACACCTGTTCCACGCTCATTCGGACAGGCAGTCGGAGCGCAGCGACGCAGGGGTGGCATTGTTAGTCCGGGTTGGCTGGCGTCGTCAATTTCTGCGTCCGTTTGCG > CP009974/2912949‑2913249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |