| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | 1154854 = | 312 (0.950) | 296 (1.260) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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| ? | CP009974 | 1155783 = | 7 (0.020) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 542 total aligned reads displayed.
TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAAT > CP009974/1155783‑1155928 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGG > 1:6045023/1‑151 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< 1:5290773/151‑1 GTCGGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACG < 1:5581951/151‑1 GGGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCG > 1:402138/1‑151 GGGCCTGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGT < 1:2243219/151‑1 aatggCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACCTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTA > 1:6248301/6‑151 aatggCACTGCCAATCAACGTGCCGTTGGCATCATGCACCTCCACACGGCTGCCAGCAGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTA < 2:2723147/146‑1 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CTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCc > 2:1785908/1‑150 CTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCG > 1:2372971/1‑151 GCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAA < 1:2153092/151‑1 AATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCA > 2:4139762/1‑151 ATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCAACACGACTGCCAGCCGGCGCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCAT > 2:3852392/1‑151 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< 2:3155927/151‑1 GCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAG < 1:1233626/151‑1 GCGGTACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAG > 1:6166706/1‑151 GTACCGGTGAGGGGGGTGCCAGCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGG < 2:4886350/151‑1 ACCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCC > 2:246607/1‑151 CCGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCG > 2:4974951/1‑151 CGGTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGG > 2:2080474/1‑151 GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGG > 2:2138702/1‑151 GAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCG > 1:5787035/1‑151 AGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGA > 2:39381/1‑151 AGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTCGCTGAGCGGCCGGGGCGA > 2:1967330/1‑151 GGTGGTGACATCAGGGGCGATGGCCAGAGGGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGA < 2:3473008/151‑1 GGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCG < 1:4527682/151‑1 GCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATC < 2:163648/151‑1 CCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCA < 2:5909275/151‑1 CATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAG > 2:4790286/1‑151 gagtgagGGCGAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCGATGGTACGTCGTACTGGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGT < 2:898079/144‑1 GATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGCGCGGCCGGGGCGAGCTCGATCAGGAAGGTGCCG > 2:6529420/1‑151 GATGCCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGCGCGGCCGGGGCCAGATCGATCCGCCAGGTGCCG > 2:5377795/1‑151 ATGGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTAAACTGCTCGCCTGGCGGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGT > 2:4074172/1‑151 GGCCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTG < 1:2701939/151‑1 CCAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGC < 1:5940329/151‑1 CAGATTGCTCGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCA < 1:419281/151‑1 GCTGGGGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACC < 2:3378848/151‑1 cgtGCTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAca < 2:3547283/148‑3 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCGATGGCGACCACGTCCAGCAGCTCGCCGTTGGCCTGAGGCGGGTCGAGGGTGACGGTGAAGCTGCCGTCGGGGCCAGCCACCACACTGCCAATCAGCGTGCCGTTGGCGTCATGCACTTCCACACGGGTGCCGGCCGGCGCGGTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1155003‑1154854‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAAT > CP009974/1155783‑1155928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |