New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP009974 | 1154854 = | 312 (0.950) | 296 (1.260) +GTGAGGGTGGTGCCATCAGGATCGATGGCCAGATTGCTCGGGC |
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? | CP009974 | 1155783 = | 7 (0.020) | coding (2483/2580 nt) | RPPX_05115 | hypothetical protein |
Only 100 of 445 total aligned reads displayed.
GTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCTGGT > CP009974/1155633‑1155933 | ggtcgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggct > 2:2795341‑M2/151‑151 (MQ=255) gtcgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTg > 1:3624152‑M2/150‑151 (MQ=255) cgagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTc > 2:3051556‑M2/148‑151 (MQ=255) gagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCg > 2:4245315‑M2/147‑151 (MQ=255) gagggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCg > 1:2880045‑M2/147‑151 (MQ=255) agggtgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCgg > 2:1198753‑M2/146‑151 (MQ=255) tgacggtgaagctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGgcgc > 1:5824745‑M2/142‑151 (MQ=255) gtgaagcggccggcggggcctgccaccacactgccaatcggcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacggctgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCggtgg < 2:6150725‑M2/15‑1 (MQ=255) agctgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCaa > 2:2479014‑M2/133‑151 (MQ=255) ccgccggcggggagtgccaccacactgccgattagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgacggccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccaggttgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATg < 2:2906091‑M2/21‑1 (MQ=255) tgccgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATgg > 1:3146174‑M2/130‑151 (MQ=255) cgtcggggcctgccaccacactgccaatcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgagggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAc > 1:1145395‑M2/127‑151 (MQ=255) gtcggggcctgccaccacactgccactcagcgtgccgttggcgtcatgcacttcaacacgactgccagccggcgcggtaccggtgggggtggtgccatcaggatcgatggccagattgctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTAcg < 2:2126437‑M2/26‑1 (MQ=255) 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gctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAcc < 2:2724519‑M2/143‑1 (MQ=255) gctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAcc < 1:625209‑M2/143‑1 (MQ=255) gctcgggcTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTGCCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGAcc > 2:1504184‑M2/9‑151 (MQ=255) gggcTGTCGGTCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGaccacac < 2:5890558‑M2/147‑4 (MQ=255) gATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGc < 2:2257125/51‑1 (MQ=255) cTGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCAccgaccacacccg > 1:4047091‑M2/2‑145 (MQ=255) tGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCacacccgt > 2:4975982/1‑144 (MQ=255) | GTCGCGGCGAGCCCGGCTGGGATACGTTGCCGGCGGCATCCACCAGACGCACATCGAGTGCTTCACCATTGGCCTGGGCAGGCGACAGGGTGAGGCTGAACAGGCCGTCGGCATTGATCACCAGCTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGGTCAATGGTACGTCGTACTCGGTAGCCACCGAAGCATTACCGCTTGGGTCGGTCTGCACCAGGCTCAACTGCTCGCCTGGCTGAGCGGCCGGGGCGAGATCGATCAGGAAGGTGCCGTTGGCACCGACCAATCTGGT > CP009974/1155633‑1155933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |