| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277572 = | 329 (1.000) | 269 (0.950) | 142/258 | 1.2 | 48.5% | intergenic (+41/+197) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | = 1277722 | 289 (1.020) | intergenic (+191/+47) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS | |||||
Only 100 of 404 total aligned reads displayed.
GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277742‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTA > 1:4282654/1‑151 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAG < 2:4298174/148‑1 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG < 1:2408392/151‑1 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT < 1:6525779/151‑1 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGT < 1:3715756/151‑1 CGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACC > 2:4994967/1‑151 GCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCC < 1:3291317/151‑1 GAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACTCACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCCTGTAGGACCGGGTTTACCCGC > 2:1166072/1‑151 aacGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCG < 2:219222/148‑1 AGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > 1:3143745/1‑151 AGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA > 1:6380132/1‑151 GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCC < 1:4959779/151‑1 GGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCC > 2:1672987/1‑151 TGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCC > 1:6151660/1‑151 GCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCT < 1:1324286/151‑1 GCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCT < 2:1326497/151‑1 GCTGGCCAATTGCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCT < 1:5975918/151‑1 CCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCC < 2:5879018/144‑1 CCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCC > 1:5879018/1‑144 ATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCA < 1:2805049/151‑1 TTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGGGGGGTTACTCGCGGAAGGGGCGGCCCTGCTGGCCAAa > 2:3699055/1‑150 CACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTC > 2:490706/1‑151 CGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACC > 2:5654630/1‑151 GTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGTTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCCCTGCTCGCCAACGTCCACCCGCC > 1:2977175/1‑151 TTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCG > 1:647717/1‑151 GTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGGGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACt < 1:1445164/151‑2 CCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTG < 1:274671/151‑1 GCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCC > 1:2999731/1‑151 CCGCTACCGTATGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCG < 1:5723654/151‑1 CGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGC > 1:3083350/1‑151 CGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGC > 1:4575478/1‑151 CGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGCCCGGCCCCGCTGGCCACTTTCCACCCCCCGTGCACCGTAGCCGC > 2:1215043/1‑151 CGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGC > 1:4617063/1‑151 ctACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCGCCTACGCAGATGGGTGGTGGCCACACCTCTGGGGCTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCCCCGTTCACCGTTGCCGCCG > 1:3046933/3‑151 GTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACC > 1:2569976/1‑151 GTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCCGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACC > 2:3031695/1‑151 tttGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGGTCACCGTTGCCGCCACCACCGga > 1:4707066/4‑149 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTA > 1:1999390/1‑151 GGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC > 1:6278923/1‑151 GTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGGCCACCGCTGCCGCCACCACCGTATTCGCGG > 2:4794482/1‑151 TAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGG > 1:746016/1‑151 CCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAAC > 1:3938002/1‑151 tcgTACACACATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGC < 1:2606952/148‑1 TCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGC > 1:1005269/1‑151 TACACAGATTGGTGGTGGCCACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCC < 1:4008517/151‑1 gagAGATGGTTGGGGGACACAGCTCTGGTGTGGGACACAGGCCGCCGTGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 2:2151794/148‑1 CGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTA > 2:4644943/1‑151 CGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCACGGGTAAACCCGCTCatc > 2:2086970/1‑148 GCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGCTCAACCCCCTCCTAC > 2:4195003/1‑151 GCACATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGCTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:6442576/151‑1 cggatcGGTGGTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACG > 1:440866/7‑151 AGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTGACCGCGCCCCTACGC > 2:5265918/1‑151 AGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGC > 1:1219091/1‑151 GATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCA < 1:1058610/151‑1 TTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCTCCACCGTATTCGCGGGTAAAACCGCCCCCACCCAGA > 1:1109196/1‑151 TGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGAT > 1:5343991/1‑151 GGTGGGGGACAGTGCTCGGGGGGTGGAGACTGGCCAGCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATT < 2:5105006/151‑1 GTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCG < 1:2863235/69‑1 GGTGGACACACCTCTGGGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGT < 1:5791428/151‑1 GGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGC > 1:2100317/1‑71 gacggACCTCGGGGCTGGGACACTGGCCGCCGGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTG < 2:6375010/146‑1 GACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCCACGCATAGTGGTAGTG > 2:2843207/1‑151 cagagCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGGCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGA < 1:2226964/146‑1 CACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACA > 2:3874358/1‑151 ctGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACgt > 2:5475642/3‑149 tGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCGCAGATTGGTGGTGGACACACGTC < 1:4347815/150‑1 CACAGGCCGTCGTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGA < 1:1672987/151‑1 GTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCC < 1:3874358/151‑1 GTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGCTGGACACACGTCGAGGGTTGAACACAGGCC > 2:3297679/1‑151 cggGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTCGGGTTGGACACAGGCCGT > 1:4891123/4‑151 TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCG > 1:562020/1‑151 TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCG < 1:3365613/151‑1 GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGT > 2:2739733/1‑151 TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTG > 1:415766/1‑151 TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGCGGGTTGGACACACGCCCTCGTG > 2:5972613/1‑151 gggGCGGCTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACCCCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTA < 2:2498133/148‑1 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACCGGCCGTCGTCTAG > 2:3167405/1‑151 GAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAG > 1:1516154/1‑151 AGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGG < 2:2919297/151‑1 CGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCG > 2:4062644/1‑143 ggtTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGC < 2:5307738/148‑1 GGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGT < 2:6076008/106‑1 GGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGC > 2:1013354/1‑151 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCG > 1:3600776/1‑151 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGG < 1:957415/107‑1 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCG < 1:920269/48‑1 GGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCG > 2:920269/1‑48 GTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCC > 2:4420261/1‑43 TTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGG < 2:6496014/151‑1 TTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAGTTTCCAC < 2:1467277/39‑1 TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT < 1:5527918/151‑1 TACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCTAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTT > 1:5018889/1‑151 CCGCGAACGCGCCGGCCCTGCTGGCAAATTTCAATCCGACGTTCACCGTCGCCGCCTCCACCCTTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTAC < 2:154459/151‑1 CGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACC > 1:3805235/1‑151 CGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACC > 1:2361278/1‑151 CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG > 1:1912310/1‑142 CGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGG < 2:1912310/142‑1 GAAAGGGCCGGCTGTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACGTCGAGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGC < 1:5170136/151‑1 AAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACg > 2:6249170/1‑104 AAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACg < 1:6249170/105‑2 GGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1277742‑1277572‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggagcgggtttacccgcgaaAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCAGATTGGTGGTGGACACACCTCGGGGGTTGGACACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGA < CP009974/1277722‑1277573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |