| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | 1277572 = | 329 (1.000) | 269 (0.950) | 142/258 | 1.2 | 48.5% | intergenic (+41/+197) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS |
| ? | CP009974 | = 1277722 | 289 (1.020) | intergenic (+191/+47) | RPPX_05635/RPPX_05640 | aldehyde dehydrogenase/mechanosensitive ion channel protein MscS | |||||
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TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAATGCCTTCATCACGCAATCGGCCAAGAATGGTGA > CP009974/1277572‑1277872 | GCGGGTAAACCCGGTCCTACAGGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGAGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTc > 2:1166072‑M1/1‑151 (MQ=255) cgGGTGAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGCGTCCAACCTCCGGTGTGTGTCCACAACCCATCTGCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTcg > 1:766751/1‑151 (MQ=11) agcccGCTCCTACACGACGGCCTGCGTCCAACCTCCGGTGTGTGTCCACAACCCATCTGCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTa < 1:5955498/149‑1 (MQ=11) aaCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGAGGCGGCAACCGTGCACGTCAGGTGGAATTAGGCCAGCAGAGCCCGCCCTTTCGCTGGtg > 1:2601451/1‑150 (MQ=11) aCCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaa < 1:3731373‑M2/151‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaa < 2:6496014‑M2/151‑13 (MQ=255) ccGCTCCTACACGGCGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc > 1:4160409/1‑151 (MQ=11) ccGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaac < 1:3081317‑M2/151‑14 (MQ=255) cGCTCCTACACGGCGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGTGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGCAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGGAAAcc > 2:4816058/1‑151 (MQ=11) cGCTCCTACACGGCGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 1:5399292/151‑1 (MQ=11) CTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc > 1:4298174‑M1/1‑148 (MQ=255) ccTACACGGCGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCt > 2:2465363/1‑151 (MQ=11) cTACACGGCGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGTCGTCAACAGTGTACGGCTGGTTGAAATCTGCCTGCATGGCCGGCCCTTTCGCGGGTCAATCCGCtt > 2:258474/1‑150 (MQ=11) CTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:5839855‑M1/1‑151 (MQ=255) acacGACGGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcct < 1:6102559‑M2/151‑22 (MQ=255) ggcgtcgGCCGGGGTCCAACACTCGAGGTGGGTCCGCCTCCAAGCTGCGTAGGAGCGGGGTTACGCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCta < 2:4710092/146‑2 (MQ=14) acgacgGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcct < 2:1087103‑M2/149‑22 (MQ=255) cggcgGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGcc < 1:912449/148‑1 (MQ=11) cgacgGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccg < 1:4062644‑M2/143‑17 (MQ=255) cgacgGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctaca < 1:3365613‑M2/151‑25 (MQ=255) acgGCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAg > 1:5784683/1‑151 (MQ=255) acgGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTt > 2:5363038‑M2/1‑125 (MQ=255) cgGCCTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacacgg > 1:2324858/1‑145 (MQ=14) ggCCTGTGTCCAACCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgac < 1:3874358‑M2/151‑29 (MQ=255) gCCTCTGTCCCACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCGAGCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTg < 2:4405758/151‑1 (MQ=14) ccTGTGTCCAACCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTgg > 1:4783977/1‑151 (MQ=14) tgtCCAACCACAGGAGTGTGTCCACCGCCAATCGGGGTCGGAGCGGGGTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAg < 1:995515/151‑1 (MQ=14) aaCCCTCGACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccg < 1:3312390‑M2/128‑17 (MQ=255) aaCCCCAGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCAc > 2:1607029/1‑151 (MQ=255) gAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCCGCCGGCCCGCCCACCCCAtcc > 2:1347185/1‑149 (MQ=14) gACGTGTGTCCACCACCAATCTGCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaacccca < 1:4347815‑M2/151‑47 (MQ=255) cgtgtgtcCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTtt < 1:6249170‑M2/104‑3 (MQ=255) tgtCCACCACCAATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTacac > 1:1843377/1‑151 (MQ=255) tgtCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtg > 2:3874358‑M2/1‑99 (MQ=255) gtCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgt > 1:5073169‑M2/1‑98 (MQ=255) ccaATGTGTGTAGGAGGTGGCTGGCTCGCGAATCCGGTGGGGGCGGCACCCGTGCACGGCGGGTGGCACTTCGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTc < 2:5975918/151‑1 (MQ=18) ccaATCTGTGTAGGAGCGGGTTTACGCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTc < 1:1681455/151‑1 (MQ=255) caATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggt < 1:6333591‑M2/98‑10 (MQ=255) aaTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGACATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCCGCTGGACAGCCCACCCGAAGCCCACACCGACTCGTCAg > 2:1925419/1‑151 (MQ=17) aaTCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacccgctggccagtctccaccccccgagcactgtcccccacc < 2:5105006‑M2/151‑64 (MQ=255) gCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatct > 1:1219091‑M2/1‑83 (MQ=255) gCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgccggcctgtgtccaaccccacaggtgtgtccaccacccatct < 1:5639682‑M2/151‑69 (MQ=255) tgTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAgccggcc < 1:2211546/150‑1 (MQ=255) gTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgc > 1:1086608‑M2/1‑81 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCcgc < 1:240017/151‑1 (MQ=255) gatgagcGGGTTTACCCGTGAATACGGTGGTGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgcg > 2:2086970‑M2/4‑80 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCcgcg > 2:403209/1‑151 (MQ=255) aGGAGCGGGTTTACCCGCAAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgtgt < 1:2850348‑M2/151‑73 (MQ=255) ggAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCGGCAACAGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGGCAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCgcgc > 2:2123004/1‑151 (MQ=255) 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1:647717‑M2/1‑34 (MQ=255) cggcggGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGaa < 1:3143988/151‑1 (MQ=255) ggccgGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAAt < 1:3589324/151‑1 (MQ=255) cggGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCCTGCTCTGCGGCGCAGACAGTGGAATGc > 2:2634734/1‑151 (MQ=255) gggTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaac < 1:4420261‑M2/43‑14 (MQ=255) gTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaa > 1:1467277‑M2/1‑28 (MQ=255) gTGGAAACTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaa < 2:1467277‑M2/39‑12 (MQ=255) ttGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtagcggcggcaacagtgaacggcgggtggaaa < 1:5547239‑M2/151‑131 (MQ=255) tGGCCAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatct > 2:1242456‑M2/1‑20 (MQ=255) gCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAATGCCTTCATCACGCa > 2:5581885/1‑150 (MQ=255) ccAGGAGGGCGGGGCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaacccccgaggtgtgtcccccaccaatctgcgtaggagcgggtttacccgcaaatacggtagcggcggcaacagtgaacggcgggtggaaattgg > 2:283048‑M2/1‑17 (MQ=255) ccAGCAGGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccactctgtgtaggagcggggttacccgcgcatacgctagcggcggcaacactgaacggcgggtggaactcgg < 2:6110701‑M2/151‑135 (MQ=255) cagcagGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgtgtaggagcgggtttacccgcgaatacggtagcggcggcaacagtgaacggcgggtggaaattggc < 2:2211546‑M2/151‑136 (MQ=255) gcagGGCCGGCCCTttcgcgggtaaacccgctcctacacggcggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtcc > 1:2100317‑M2/1‑14 (MQ=255) 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ggccggccCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgcgtaggagcgggtttacccgcaaatacggtagcggcggcaacagtgaacggcgggtggaaattgg < 2:5879018‑M2/144‑135 (MQ=255) ggccCTttcgcgggtaaacccgctcctacacgacggcctgtgtccaaccccagaggtgtgtccaccaccaatctgcgtaggagcgggtttacccgcaaatacggtagcggcggcaacagtgaacggcgggtggaaattggccagcagggcc < 1:4959779‑M2/151‑146 (MQ=255) ggccCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCTTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAATGCCTTCATCACGCAATCGGCCAAGAAt < 2:6275114/151‑1 (MQ=255) tttCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAATGCCTTCATCACGCAATCGGCCAAGAATGGTGa < 1:265141/151‑1 (MQ=255) | TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGACGGCCTGTGTCCAACCCCCGAGGTGTGTCCACCACCAATCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCCAGCTGGACAGCCCACCCGATGCCTACACCGACTCGTCAGCCGGCCGCGCCCCCTCCTGCACCAGCACCATGCTCTGCGGCGAAGACAGTGGAATGCCTTCATCACGCAATCGGCCAAGAATGGTGA > CP009974/1277572‑1277872 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |