New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009974 | 1296410 = | 343 (1.040) | 58 (0.970) +ACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCG |
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? | CP009974 | = 1296432 | 344 (1.050) | intergenic (+120/+112) | RPPX_05720/RPPX_05725 | chromosome partitioning protein ParA/CreA |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
TCTTGGTAGGAGC‑GGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCACCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1296509‑1296410 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGG < CP009974/1296432‑1296395 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| cgcccGTAGGCGCGGGTTTACACGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCCCGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCG < 2:1003956/146‑1 ccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCAACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAG < 2:26645/149‑1 AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGC > 1:1502327/1‑151 agcgGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGCGCGGG > 2:1267444/5‑151 gcgGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACACCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCCGGT > 1:6195429/4‑151 cgGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTT < 1:3812339/149‑1 gGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTT > 1:5992373/2‑151 gGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTT > 1:1746602/2‑151 GGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACCTCCGGGGTTGGCCACAGGACACCGTAGGAACGGGTATA > 1:2589874/1‑151 GTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTCGGCGCGGGTTTAC > 1:3259483/1‑151 tttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACC < 1:5724557/148‑1 tttACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACC < 1:2810027/148‑1 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> 1:4918510/5‑151 aGGCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCA < 1:1884311/150‑1 GCCGGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGC < 1:2329720/151‑1 GGCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCT < 1:6540818/151‑1 GCCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTG < 2:1690697/151‑1 CCCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGC > 1:2162705/1‑151 CCTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCT > 1:2320859/1‑151 CTGCTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGCGGCGGTCACCAATCTGCGGTTGGACCCTGGCCACCGTAGGCGCGGGTGTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTG > 1:3705930/1‑151 gTGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCCCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCC < 2:4217412/150‑1 gGGCTAATTTCCTCCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCA < 1:3154055/150‑1 TGGCTAATTTCCACCCGCTGTTCACCGTTGCCACCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCA < 2:3818626/151‑1 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< 1:4567178/151‑1 TCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGa < 1:2642737/151‑2 TCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGa > 1:6212004/1‑150 TCGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGATTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGa > 1:3036969/1‑150 CGCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGag > 1:3547027/1‑149 GCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGagt > 1:496932/1‑148 GCGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGT > 1:5761342/1‑151 CGGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTA > 2:4859474/1‑151 GGGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACGGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAA < 2:2836779/151‑1 GGTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAA > 2:447598/1‑151 GTAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAAC > 1:842808/1‑151 GTAAACCCACGCCTACCCCGGTGCTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAAC < 1:1339427/151‑1 TAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACC > 1:2770555/1‑151 TAAACCCACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACC < 1:3630420/151‑1 ccCGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCGGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCC < 1:3400704/149‑1 CACGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCC > 1:2023921/1‑151 CGCCTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTA > 1:1209103/1‑151 gcttggCCCGGGGGTGGCCGGACATCTGGGGTGGGACACAGGCCACGATAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTAC < 2:4640124/145‑1 CTACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTACAC > 1:6390029/1‑151 TACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCCCCCTATTCGCCAGTCAACCCGCTCCTACACc > 2:3089996/1‑150 TACCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTACACa < 1:4661326/151‑2 CCCCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGACACAGGCCACCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTACACacc > 2:6490754/1‑148 CCGGTGGTGGACACACATCTGGGGTTGGTCACTGGCCTCCGTATGCGCGGGTCTACCCGCGAAGAGCCCAGCCCTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGCTAAACCCGCTCCTACACaccgg < 2:5821783/151‑6 ATTTCCACCCGCCCTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAA > 1:3884769/1‑49 TCCACCCGCCGTTCACCGTTGACGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCG < 1:2627511/51‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TCTTGGTAGGAGC‑GGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCACCACCACCGTATTCGCGGGTAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009974/1296509‑1296410 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGG < CP009974/1296432‑1296395 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |