| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009974 | = 1901506 | 2 (0.010) | 337 (1.070) | 189/286 | 0.1 | 99.7% | coding (409/426 nt) | RPPX_08485 | hypothetical protein |
| ? | CP009974 | 1904110 = | 0 (0.000) | intergenic (+113/‑1737) | RPPX_08495/RPPX_08505 | ATPase AAA/hemolysin secretion protein D | |||||
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTATTC > CP009974/1901356‑1901656 | aTGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCG > 2:139618‑M1/1‑151 (MQ=255) gctgctgctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcg < 1:4926448‑M1/151‑3 (MQ=255) ctgctgctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgc < 1:5108801‑M1/151‑4 (MQ=255) tgctgctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgca > 1:2592874‑M1/1‑147 (MQ=255) tgctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagcc < 2:3814607‑M1/151‑8 (MQ=255) tgctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagcc < 1:957088‑M1/151‑8 (MQ=255) ctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgc > 1:3105387‑M1/1‑142 (MQ=255) ctCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgc < 2:3927054‑M1/151‑10 (MQ=255) tCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgca < 2:2651697‑M1/151‑11 (MQ=255) tCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgca > 1:424703‑M1/1‑141 (MQ=255) ggaggGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcac > 1:1552239‑M1/1‑137 (MQ=255) aggGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaa > 1:3784555‑M1/1‑135 (MQ=255) cAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgat < 2:1285626‑M1/151‑24 (MQ=255) cAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgat < 1:3410636‑M1/151‑24 (MQ=255) gggcgtcCGGGTCGGCGGGGGGGAGGATGGCGCGGCGCGCCTGGTACTCGGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtc < 2:6194418‑M1/148‑27 (MQ=255) cGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaac > 2:284874‑M1/1‑122 (MQ=255) gTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaacc < 1:2411989‑M1/151‑31 (MQ=255) ccTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccat > 1:5261649‑M1/1‑119 (MQ=255) cTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatg < 2:5574346‑M1/151‑34 (MQ=255) tCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaa > 1:113061‑M1/1‑114 (MQ=255) gCTGGGAGAACGATGACACCGCCCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacct > 2:5802752‑M1/1‑111 (MQ=255) cTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctc < 1:3613368‑M1/151‑42 (MQ=255) ggAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatc < 1:5044658‑M1/151‑45 (MQ=255) gagaACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcc < 1:5522904‑M1/151‑46 (MQ=255) agaACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatccc < 2:4956658‑M1/151‑47 (MQ=255) gaACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccagggcaacctcatcccc > 2:294042‑M1/1‑104 (MQ=255) aCGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacg > 2:638376‑M1/1‑102 (MQ=255) aCGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacg < 1:5792550‑M1/151‑50 (MQ=255) cGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacga > 2:6103489‑M1/1‑101 (MQ=255) gATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgag > 1:2157884‑M1/1‑100 (MQ=255) gATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgag > 1:1383491‑M1/1‑100 (MQ=255) tGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcg < 1:4332145‑M1/151‑54 (MQ=255) gACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcga > 1:1688607‑M1/1‑97 (MQ=255) acCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagt < 1:2995196‑M1/151‑58 (MQ=255) ccGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtc > 1:3167116‑M1/1‑93 (MQ=255) gcgcgcCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgt < 1:3483969‑M1/151‑61 (MQ=255) cgcgcCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtg < 2:3652491‑M1/151‑62 (MQ=255) gcgcCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtgg > 2:1221888‑M1/1‑89 (MQ=255) cTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcg > 2:3372106‑M1/1‑82 (MQ=255) cTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcg > 1:3934384‑M1/1‑82 (MQ=255) tACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcga > 2:4375379‑M1/1‑81 (MQ=255) cTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgaca < 1:766478‑M1/151‑73 (MQ=255) tCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacac < 2:4634609‑M1/151‑74 (MQ=255) aGCGAGAGCGACGGTGGCCAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaaccccatcccacgccccaagtccttcttctgccacaccc > 2:1596253‑M1/1‑76 (MQ=255) gCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccct < 1:5079967‑M1/151‑77 (MQ=255) gagCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctg < 1:5820167‑M1/151‑81 (MQ=255) agCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGAGTGCAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgc < 2:1728495‑M1/151‑82 (MQ=255) gCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcg < 2:4885867‑M1/151‑83 (MQ=255) gCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcg < 1:4887242‑M1/151‑83 (MQ=255) gACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgca < 1:5987772‑M1/151‑85 (MQ=255) aCGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcag > 2:2823378‑M1/1‑66 (MQ=255) gAGGTGCGTGTCAGCCGCGAGGCACGGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggt < 2:5689963‑M1/151‑94 (MQ=255) gAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggt > 1:104931‑M1/1‑58 (MQ=255) 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ccGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgcc > 2:450687‑M1/1‑44 (MQ=255) cgcgAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgcca > 2:3153024‑M1/1‑43 (MQ=255) aGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgcc > 1:2738176‑M1/1‑38 (MQ=255) aGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgcc < 2:575165‑M1/151‑114 (MQ=255) cACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgc < 1:1217793‑M1/151‑116 (MQ=255) aCTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgcc < 2:4158487‑M1/151‑117 (MQ=255) cTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgcca > 2:1096162‑M1/1‑34 (MQ=255) gcgaagcgACTACAGCGGCCNCGTGTTCGTCAcgcagccgcagcacaagttcgatggcaaccatggcaacctcagcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagc < 2:6493340‑M1/148‑120 (MQ=255) gCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagc > 1:4974180‑M1/1‑32 (MQ=255) cTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcc < 2:881178‑M1/151‑121 (MQ=255) tAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcct < 1:233978‑M1/151‑122 (MQ=255) tAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcct > 1:2832161‑M1/1‑30 (MQ=255) aaGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCCTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctg < 2:4783806‑M1/151‑123 (MQ=255) gACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtga > 2:4679361‑M1/1‑25 (MQ=255) aCTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgat < 2:240614‑M1/151‑128 (MQ=255) cTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatc > 2:3964323‑M1/1‑23 (MQ=255) gCGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacct > 2:5422107‑M1/1‑18 (MQ=255) cGGCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctg > 2:2294250‑M1/1‑17 (MQ=255) ggCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctga > 1:4062111‑M1/1‑16 (MQ=255) ggCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctga > 1:4296767‑M1/1‑16 (MQ=255) gCCGCGTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgat < 2:3180317‑M1/151‑137 (MQ=255) gCCGCGGGTGCGTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcagcctcatcccacgagggaagtcgtgcttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgat < 2:6525141‑M1/151‑137 (MQ=255) cgcgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcg > 1:1249046‑M1/1‑13 (MQ=255) cgTGTTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcc < 1:670001‑M1/151‑141 (MQ=255) gtgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctggtcgcct > 1:2307377‑M1/1‑10 (MQ=255) gtgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcct < 2:1856911‑M1/151‑142 (MQ=255) tgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcctt < 2:424703‑M1/151‑143 (MQ=255) tgtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgcctt < 1:1829400‑M1/151‑143 (MQ=255) gtTCTTCGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttg < 2:5065062‑M1/151‑144 (MQ=255) cttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggcc < 1:450687‑M1/151‑147 (MQ=255) cttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggcc > 1:627414‑M1/1‑5 (MQ=255) ttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccg < 2:525316‑M1/151‑148 (MQ=255) ttcGcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccg > 2:199286‑M1/1‑4 (MQ=255) tcGggcagccgcagcacaaggtcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgc < 2:5037071‑M1/151‑149 (MQ=255) cgcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgatcaacctgatcgccttggccgcg < 2:2538810‑M1/151‑150 (MQ=255) cGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTAtt > 2:1452226/1‑151 (MQ=11) gcgcagccgcagcacaagttcgatgtcaaccatggcaacctcatcccacgagcgaagtcgtggttccgcgacaccctgctgcgcagcaagtggttgtatatcgacgccatcgccgccagcctggtgattaacctgatcgccttggccgcgc > 1:2091850‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGCTGCTGCTCAAGGAGGGCCGCAGCGCCGTCCTGCTCGGCTGGGAGAACGATGACACCGCGCGCCTGCTACTCAGCGAGAGCGACGGTGGCGAGGTGCATGTCAGCCGCGAAGCACTGCTAAGCGACTACAGCGGCCGCGTGTTCTTCGTGCGGATTCCACGCTGACTCGGACACCCATTCCACGCGCATCCGGACAGTGATTCCACGCTGATCCGGACACTCATTCCACGAGCATCCGGACACCGACTCCACGGTCATCCGGACACTTTTCTGGCAGGCAGCCACGCAGGATTTATTC > CP009974/1901356‑1901656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |