| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP009974 | = 3844204 | 269 (0.820) | 146 (0.770) +ATTCCGCTTAGCAGCCAAGGCTGATAAGCAAGATCGGGTCCAGCAAACCGGTCTTGAAGGTAA |
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| ? | CP009974 | 3844237 = | 277 (0.840) | intergenic (+34/‑9) | RPPX_17125/RPPX_17130 | tRNA‑Ala/tRNA‑Glu | |||||
Only 100 of 458 total aligned reads displayed.
CACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCTACATTGCGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTGTTTTTTC > CP009974/3844093‑3844387 | ccagtcagCGATGCCGTCCAGCGCTACATTGCGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACg < 2:3031142/151‑1 (MQ=18) agagcgcctgcatggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAg > 1:5324121‑M2/121‑151 (MQ=255) cTACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAgg < 1:4684013/151‑1 (MQ=255) tttgtttcGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGa > 2:2613562/8‑151 (MQ=21) tttgtttcGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGa > 2:5932831/8‑151 (MQ=18) tttgtttcGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGa > 2:3091367/8‑151 (MQ=21) gcgcctgcatggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGac < 2:5324949‑M2/34‑1 (MQ=255) cgcctgcatggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGaca < 1:1270248‑M2/35‑1 (MQ=255) cgccgggatggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGaca < 2:2283451‑M2/35‑1 (MQ=255) tgtttcGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGaca < 1:2897717/146‑1 (MQ=18) aaatccGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTCCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGaca < 1:2454436/146‑1 (MQ=255) ctgcatggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcacacccgtcttgaaggtaaGAAGGCT‑CGCCCCCTTCCTCTAGTGGCCCAGGACaccc > 2:5979155‑M2/114‑150 (MQ=255) ttcGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCg < 1:4947343/149‑1 (MQ=21) catggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGccc < 2:5560711‑M2/41‑1 (MQ=255) ggggCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGccc > 2:580032/1‑151 (MQ=21) atggcatgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGc > 2:3686235‑M2/110‑136 (MQ=255) ggCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCtt < 1:2250292/151‑1 (MQ=21) ggCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCtt < 2:247662/151‑1 (MQ=21) ggCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCCGCGGCTCGCGTTGCCGGAACGGCACGAAGGGTCCGGCACCTTCGTCTAGAGGCCTAGGACAACGccccc > 2:2361639/1‑149 (MQ=21) gCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCttt < 2:518230/151‑1 (MQ=255) cTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTc > 2:2777120/1‑151 (MQ=21) cTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTc > 2:4910090/1‑151 (MQ=255) tataGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCa > 1:6448385/1‑151 (MQ=255) tgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCAcg > 1:1213793‑M2/104‑151 (MQ=255) ataGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCAc > 1:6246801/1‑151 (MQ=21) taGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCAcg < 1:2361639/151‑1 (MQ=255) caggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCAcggc > 1:3551275‑M2/102‑151 (MQ=255) aggaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCAcggcg < 2:5663967‑M2/51‑1 (MQ=255) tCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCa < 1:5151623/145‑1 (MQ=255) gaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGt < 1:2055376‑M2/53‑1 (MQ=255) gaggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTCTCACGGCGGt > 1:6007676‑M2/99‑151 (MQ=255) ggtcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTaa > 1:866127‑M2/97‑151 (MQ=255) tcagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACa < 1:4161222‑M2/57‑1 (MQ=255) cagcggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAg < 2:5069542‑M2/58‑1 (MQ=255) gagaGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAggg < 1:5596481/151‑1 (MQ=255) cggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgagggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAgggg < 1:2799710‑M2/61‑1 (MQ=255) ggttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGt > 1:1771460‑M2/90‑151 (MQ=255) agagCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAgggg > 1:4761552/1‑151 (MQ=255) gttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGtt < 2:1859363‑M2/63‑1 (MQ=255) ggttgcCTGCGTGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCAACAATTTTGCCGCGGTGCGAGTTAGCGGAGCGGCACGGAGGTTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGt < 2:866127/147‑1 (MQ=37) ttcgatcccgcttagctccaccaaattccgcttagcagccaaggctgataagcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTc > 1:2986895‑M2/88‑151 (MQ=255) agCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCATTTCTGCCAGGGTTCACGCAAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGtt > 1:3861037/1‑151 (MQ=21) gcgcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGttn < 1:2692107/151‑2 (MQ=255) 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gATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTAccc < 1:1947204/147‑1 (MQ=255) gCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGt > 2:3340249/1‑116 (MQ=255) cTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACtttt < 1:436808/136‑1 (MQ=255) agcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCAC‑TTTTCCTGCGTTTTGC‑AGGGCTTTa < 1:1146215‑M2/110‑1 (MQ=255) agcaagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCAC‑TTTTCCTGCGTTTTGC‑AGGGCTTTa > 2:1146215‑M2/38‑147 (MQ=255) ccaATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCAC‑TTTTCCTGCGTTTTGC‑AGGGCTTTaaaag < 1:3231679/151‑3 (MQ=21) aagatcgggtccagcaaaccggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCAC‑TTTTCCTGCGTTTTGC‑AGGgctttaaaaggct > 2:4697520‑M2/35‑146 (MQ=255) ctgccagggTTCACGCTAGTGGATCTTCGCGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCAt < 2:4104102/144‑1 (MQ=21) gcgGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGttt < 2:2984321/125‑1 (MQ=255) gcgGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTA‑CCGCGGTTTGCAGGGATTTAAAAGGCTcgtcggtt > 1:2560611/1‑144 (MQ=21) cgGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACt > 1:3662906/1‑133 (MQ=255) gcgTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGa > 1:5657477/1‑98 (MQ=255) ggtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAgggg < 2:5442147‑M2/61‑1 (MQ=255) gtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCcacttttcct < 2:4234396‑M2/92‑4 (MQ=255) gtcttgaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCcacttttcct > 1:4234396‑M2/14‑102 (MQ=255) gaaggtaaGAAGGTT‑CGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTg > 1:309806‑M2/9‑151 (MQ=255) atcttcgcGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCtttt > 1:583403/8‑151 (MQ=255) aTCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTCC‑GGGCCTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGTCTGCGCCtttt > 2:742402/1‑151 (MQ=255) tccgcGATGGATACGTCCGCTTCTGCGATTTGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTGtt < 1:6533921/147‑1 (MQ=25) gCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACAcc > 2:1979695/1‑42 (MQ=255) cgcGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTGtttt < 1:5271116/149‑1 (MQ=255) gcGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTGttttt > 2:4632092/2‑151 (MQ=255) | CACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCTACATTGCGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAATTTTGCCGCGGTTCGCGTTAGCGGATCGGCACGAAGGTTACGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAGTCCCCTAGGGGACGCCACGTTTACCCGCGTTTTGC‑GGGACTTTAAAGGCTCATTCGCTTATTGAATGGGCCTTTTGTTTTTTC > CP009974/3844093‑3844387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |