Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | U00096 | 1,618,868 | IS2 (–) +5 bp | coding (37‑41/666 nt) | marC ← | inner membrane protein MarC |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | U00096 | 1618868 = | 1 (0.010) | 121 (1.170) | 90/292 | 0.1 | 99.2% | coding (41/666 nt) | marC | inner membrane protein MarC |
? | U00096 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
* | ? | U00096 | = 1618872 | 1 (0.010) | 77 (0.750) | 63/292 | 1.0 | 98.7% | coding (37/666 nt) | marC | inner membrane protein MarC |
? | U00096 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
GGCGTAATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > U00096/1618726‑1618872 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < U00096/1651548‑1651401 GGCGTAATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTG > 2:1112758/1‑149 CGTAATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGG < 1:549838/148‑1 GTAATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGTCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACCGCACTGGAT > 1:549837/1‑149 AATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACTATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTT < 1:549839/149‑1 AATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTT < 2:549840/149‑1 CACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTA > 1:1112753/1‑149 ACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTAT < 2:549841/149‑1 ACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTAT > 1:562278/1‑149 ATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATT < 2:549842/149‑1 ATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 2:549843/149‑1 GCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:549844/147‑1 CAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 2:549845/149‑1 AAATACGTACACCGAGGCCATAAAAGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCATGCCAATAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT < 1:549846/149‑1 ATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGATCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 2:549847/149‑1 TACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:549848/145‑1 ACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTA > 2:1112665/1‑149 CACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 2:549849/149‑1 ACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:549850/149‑1 ACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 1:1112718/1‑148 CCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 1:549852/149‑1 GCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 2:1608483/1‑149 CATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAATGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 2:1608449/1‑149 AACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 2:549853/149‑1 AACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA < 1:549854/149‑1 CGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC < 2:549855/149‑1 CTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 2:1112726/1‑149 TGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 2:1112727/1‑149 TGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC < 2:549856/149‑1 ACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT < 1:549857/148‑1 TTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATA < 2:549858/149‑1 GCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCC < 2:549859/149‑1 CACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTCACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATAGTCCC > 2:562245/1‑149 TCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCG > 1:1112784/1‑149 TCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGC > 1:1608440/1‑148 CATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGA < 2:1112781/149‑1 TGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGC < 1:1112779/149‑1 TTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGA < 2:1112777/149‑1 TGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:1112778/1‑149 GCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA < 2:1112776/149‑1 GCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCC > 2:1608431/1‑149 AGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGC < 2:1112770/149‑1 GGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCG > 1:1112772/1‑149 GGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCAAGCG > 1:1112771/1‑149 CAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 2:1608460/1‑149 AGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < 1:1112768/149‑1 AAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATG > 2:1112765/1‑149 AATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATATGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < 2:1112764/149‑1 ACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCTACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAT < 2:1112760/149‑1 ACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAT > 2:1112762/1‑149 CAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATT > 2:1112761/1‑149 AGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTC > 2:1112759/1‑149 AGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTC < 1:1112758/149‑1 TTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT > 2:1112757/1‑149 gGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGTATTTGCTCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCTCTTAACCCATTACAAGACCGCTGCCGCTGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCATCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT < 2:549825/148‑1 TTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTAT > 2:1112754/1‑149 TTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTAT < 2:1112753/149‑1 AATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA > 2:1608437/1‑149 AATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA > 2:1112752/1‑149 AATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA < 2:1112750/149‑1 gcGTTAGCTAACGGCAGCAACACCACGGGATTTGCCCCTATAATTCCAGACATCTGTTATCACTTCACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGACAACCCCGCGCACTATGCGGATGCCATGCGTTATAATGC < 2:549837/147‑1 CTAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC < 1:1112763/127‑1 TAACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 1:1112743/1‑148 AACGGCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 2:1112741/1‑149 actttacACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT < 1:1662608/142‑1 GCAGCAACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT < 1:1112739/148‑1 AACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG > 2:1112734/1‑149 ACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 2:1112732/1‑149 ACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 1:1112733/1‑149 ACACCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAATCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGT > 1:1112731/1‑149 CCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT > 1:1112728/1‑149 CCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT < 1:1112727/149‑1 CCACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT < 1:1112726/149‑1 CACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCT > 1:1112729/1‑148 ACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > 2:1112725/1‑149 ACTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA‑TACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 2:1112723/1‑149 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 2:1112724/1‑149 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT < 1:708553/148‑1 GGCGTAATACGCCACCATCATGATGGCAAATACGTACACCGAGGCCATCAACGACTGACGATTACGTTCGGCACTGTTCATGTTGCCTGCCAGGCCAAGAAATAACGCGACAGTTGTTAATGGGTTAGCTAACGGCAGCAACACCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > U00096/1618726‑1618872 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < U00096/1651548‑1651401 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |