New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | 1097204 = | 329 (1.060) | 8 (0.030) | 8/290 | 18.0 | 2.5% | coding (320/909 nt) | galU | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
? | AP012306 | 1097223 = | 310 (1.030) | coding (339/909 nt) | galU | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
TGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCC > AP012306/1097055‑1097353 | tgtgCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACGAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGATGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGt < 1:550617/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGtt > 1:977587/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGACGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGtt < 2:876715/150‑1 (MQ=255) tgCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTc < 2:29730/150‑1 (MQ=255) tgCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTc < 2:3386027/150‑1 (MQ=255) cTGGGTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGt > 2:3154128/1‑150 (MQ=255) atGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGTAAAAACGCGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTcct > 2:1978414/2‑148 (MQ=255) ggTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCa > 2:505568/1‑150 (MQ=255) ttACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAgg > 1:130610/1‑150 (MQ=255) acacacTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGt > 1:2430319/1‑150 (MQ=255) cacacTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTc < 2:171706/150‑1 (MQ=255) acacTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCt > 2:2374509/1‑150 (MQ=255) cacTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACAGCTTGATGAAGAGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTg > 1:2602802/1‑150 (MQ=255) cTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGc < 1:197838/150‑1 (MQ=255) tCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCg > 2:2411558/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGc < 2:268643/150‑1 (MQ=255) aaaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGcc > 1:3229371/1‑150 (MQ=255) aaaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGcc > 2:2236457/1‑150 (MQ=255) aaaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGcc > 1:653069/1‑150 (MQ=255) aaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCt > 2:3359671/1‑150 (MQ=255) aaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTg > 1:1069190/1‑150 (MQ=255) ctctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTggg > 2:3806626/1‑150 (MQ=255) ctctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTggg > 1:2725489/1‑150 (MQ=255) tctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGa < 1:1663380/150‑1 (MQ=255) ctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGac > 1:2180125/1‑150 (MQ=255) ctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGac > 2:2811311/1‑150 (MQ=255) ctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGac > 2:1165265/1‑150 (MQ=255) tATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGaca > 2:3548103/1‑150 (MQ=255) aTTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGacac < 1:1379804/150‑1 (MQ=255) tGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACAcgc > 1:2962610/1‑150 (MQ=255) cACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtg < 1:2841993/150‑1 (MQ=255) aCTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgt > 1:3816605/1‑150 (MQ=255) aCTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgt > 1:3151049/1‑150 (MQ=255) cTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgtg > 2:4153166/1‑150 (MQ=255) tttGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgtgt < 2:3516106/150‑1 (MQ=255) tGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGc > 1:2494568/1‑150 (MQ=255) gATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCt > 2:2188310/1‑150 (MQ=255) cAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCAccc > 1:2636714/1‑150 (MQ=255) 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tATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGa < 1:844107/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGAt < 2:1337901/150‑1 (MQ=255) gTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGt > 1:995216/1‑150 (MQ=255) gTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGt < 1:4040757/150‑1 (MQ=255) tCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTc < 1:871288/150‑1 (MQ=255) tCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGGGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTc > 2:53557/1‑150 (MQ=255) ccACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTca < 2:3991124/150‑1 (MQ=255) cACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTcac > 1:781498/1‑150 (MQ=255) ccGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAg < 1:3290985/150‑1 (MQ=255) aCGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATa > 1:1188861/1‑150 (MQ=255) cGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATaa < 1:15477/150‑1 (MQ=255) tGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAAcc < 2:2489649/150‑1 (MQ=255) tGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAAcc < 1:18026/150‑1 (MQ=255) aCTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTg < 2:1967096/150‑1 (MQ=255) cTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTgg < 1:3415362/150‑1 (MQ=255) cTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGCATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTgg < 1:2529671/150‑1 (MQ=255) tattatGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGc > 2:3040211/1‑150 (MQ=255) attatGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCa < 2:720284/150‑1 (MQ=255) tatGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCaga < 1:1862325/150‑1 (MQ=255) cAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAgatg < 1:2046119/150‑1 (MQ=255) aGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAgatgat < 2:723408/150‑1 (MQ=255) ttCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATcc < 2:2874720/150‑1 (MQ=255) | TGTGCTGGTTACACACTCATCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCC > AP012306/1097055‑1097353 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |