New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AP012306 | 1097204 = | 329 (1.060) | 8 (0.030) | 8/290 | 18.0 | 2.5% | coding (320/909 nt) | galU | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
? | AP012306 | 1097223 = | 310 (1.030) | coding (339/909 nt) | galU | glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
TCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAACGGG > AP012306/1097074‑1097372 | cTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAg < 1:2247398/150‑1 (MQ=255) aaaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGcc > 1:653069/1‑150 (MQ=255) aaaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCt < 2:1524651/150‑1 (MQ=255) aaCTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTg > 1:1069190/1‑150 (MQ=255) ctctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTggg < 1:1683334/150‑1 (MQ=255) tctATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGa > 1:253874/1‑150 (MQ=255) aTTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGacac > 2:3902896/1‑150 (MQ=255) tGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACAcgc > 1:2962610/1‑150 (MQ=255) tGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACAcgc > 1:737919/1‑150 (MQ=255) aCCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTAt > 1:2791065/1‑150 (MQ=255) aCTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgt > 1:3816605/1‑150 (MQ=255) cTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgtg > 1:2164804/1‑150 (MQ=255) cTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgtg > 2:4153166/1‑150 (MQ=255) ttGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATtgtgtg > 1:1977121/1‑150 (MQ=255) tGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGc > 1:2494568/1‑150 (MQ=255) tGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGc < 2:1748597/150‑1 (MQ=255) gATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCt > 2:2492832/1‑150 (MQ=255) gATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCt < 1:3501071/150‑1 (MQ=255) 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aaCTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTgg < 1:4225380/150‑1 (MQ=255) tGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGtg > 2:2867272/1‑150 (MQ=255) cAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAAc < 2:1774647/150‑1 (MQ=255) aaTGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAAcc < 1:31489/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCg < 2:336082/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCg < 1:231850/150‑1 (MQ=255) tGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCgg > 2:1498328/1‑150 (MQ=255) tGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCgg < 1:3674447/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGt > 1:1562841/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTa < 2:2069141/150‑1 (MQ=255) tGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAg > 2:1620328/1‑150 (MQ=255) gAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCt < 1:986668/150‑1 (MQ=255) gAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCt > 1:3445248/1‑150 (MQ=255) aaCGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTa < 1:2606116/150‑1 (MQ=255) gtgtAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTAttt < 2:514542/150‑1 (MQ=255) 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gTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAAc < 1:1634965/150‑1 (MQ=255) aCTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTg < 2:1967096/150‑1 (MQ=255) aCTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTg < 2:1086717/150‑1 (MQ=255) aCTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTg < 1:2400242/150‑1 (MQ=255) tattatGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGc > 2:3040211/1‑150 (MQ=255) tattatGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGc < 2:1789700/150‑1 (MQ=255) atGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCagag > 2:676379/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAgaga < 2:2119921/150‑1 (MQ=255) tGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAgaga > 1:2868255/1‑150 (MQ=255) cAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAgatg > 1:2803546/1‑150 (MQ=255) cAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAgatg < 1:2046119/150‑1 (MQ=255) aaGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAgatga < 1:3412269/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATc < 1:1512026/150‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATccg < 2:1021905/150‑1 (MQ=255) cGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATccgc > 2:2656057/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCttt < 1:3055498/150‑1 (MQ=255) cGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGaaa < 2:786527/150‑1 (MQ=255) gAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAAc < 2:280229/150‑1 (MQ=255) gAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAAc < 2:2351957/150‑1 (MQ=255) aaaGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAACg > 1:3658769/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGAAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAACgg > 1:503866/1‑150 (MQ=255) aGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAACggg > 2:1903040/1‑150 (MQ=255) | TCTAAAAACTCTATTGAAAACCACTTTGATACCAGTTTTGAACTGGAAGCAATGCTGGAAAAACGTGTAAAACGTCAACTGCTTGATGAAGTGCAGTCTATTTGTCCACCGCACGTGACTATTATGCAAGTTCGTCAGGGTCTGGCGAAAGGCCTGGGACACGCGGTATTGTGTGCTCACCCGGTAGTGGGTGATGAACCGGTAGCTGTTATTTTGCCTGATGTTATTCTGGATGAATATGAATCCGATTTGTCACAGGATAACCTGGCAGAGATGATCCGCCGCTTTGATGAAACGGG > AP012306/1097074‑1097372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |