| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 880528 = | 147 (0.780) | 24 (0.160) | 22/114 | 6.1 | 20.4% | intergenic (+17/+163) | rcdA/ECB_RS04335 | DNA‑binding transcriptional regulator RcdA/hypothetical protein |
| ? | NC_012967 | = 904682 | 70 (0.460) | intergenic (+77/+159) | ECB_RS04500/ybjL | ogr/Delta‑like zinc finger family protein/aspartate:alanine antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 | tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 2:4818104/72‑1 (MQ=255)tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 1:3336245/72‑1 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGGGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGGAGATAAGTTTTAGATaa > 2:1892705/1‑72 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa < 1:4226924/72‑1 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGGTGCAGGGTAGTAGGTAAGTTTTAGATaa > 1:4795794/1‑72 (MQ=255) aGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAAc < 2:102081/72‑1 (MQ=255) gCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACa < 1:5763371/72‑1 (MQ=255) gCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACa < 2:3436052/72‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 1:1657290/1‑72 (MQ=255) cGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaa < 1:3102679/72‑1 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa > 2:1097866/1‑72 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa < 1:3164953/72‑1 (MQ=255) tCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAcc < 2:5670210/72‑1 (MQ=255) cgcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTGTAGATAACAAAAAAccc < 1:1685648/72‑1 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa > 2:653825/1‑72 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGCGGCAGGGTAGTAGATACGTTTTAGATAACAAAAAAccaa > 2:3930878/1‑70 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt > 2:1567014/1‑72 (MQ=255) gcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAtt < 2:5668919/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt < 1:1298398/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt < 2:3235327/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt < 2:1735461/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt < 2:5544220/72‑1 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa > 1:3654516/1‑72 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa < 2:1765698/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGTGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 2:6089102/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 2:2219196/1‑72 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 1:5607037/72‑1 (MQ=255) gagaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGt > 2:3517135/1‑72 (MQ=255) gaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaa > 2:4775704/1‑72 (MQ=255) gaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaa > 2:5635673/1‑72 (MQ=255) gaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaa > 1:1722157/1‑72 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTGGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa < 1:8844/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 1:4650696/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 2:6047032/72‑1 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg > 1:4958723/1‑72 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg > 2:5734403/1‑72 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt > 1:4872864/1‑72 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt < 2:3149881/72‑1 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa > 2:5199175/1‑72 (MQ=255) gATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTaa < 1:5465077/72‑1 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt < 1:2699231/72‑1 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt < 1:2974908/72‑1 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt > 1:3987609/1‑72 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:2167204/72‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:4082979/72‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:1459023/72‑1 (MQ=255) tgTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGa > 2:1946586/2‑72 (MQ=255) ggTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGa > 2:4741367/1‑72 (MQ=255) gTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaa > 2:1868160/1‑72 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc > 2:3377509/1‑72 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc > 1:4428120/1‑72 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc > 1:6289385/1‑72 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa > 2:5403188/1‑72 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa > 1:6002786/1‑72 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa > 2:4663084/1‑72 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa > 1:1187170/1‑72 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa > 1:280619/1‑72 (MQ=255) agGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt > 1:5726797/1‑72 (MQ=255) agGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt < 1:1464691/72‑1 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa > 2:4415759/1‑72 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa < 1:3514490/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 2:4694591/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 2:5907689/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 2:5473778/72‑1 (MQ=255) gtggCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg < 2:2026753/69‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATNACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt < 2:714793/72‑1 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 2:3561210/1‑72 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata > 1:6202637/1‑72 (MQ=255) gggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg < 1:2528493/72‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa > 2:6323025/1‑72 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 2:1960493/1‑72 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaa < 1:4194691/72‑1 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaa > 1:4590710/1‑72 (MQ=255) tagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa > 1:4515578/1‑72 (MQ=255) tagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGATCATGGAAACAATAAGTTATAGTaacaa > 1:5519774/1‑72 (MQ=255) tagATAAGTTTGAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 2:1987619/72‑1 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc > 2:4501074/1‑72 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 1:1757042/72‑1 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 1:1939830/72‑1 (MQ=255) aTAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACaa > 2:4345587/1‑72 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAAt > 2:2609179/1‑72 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAAC‑AAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa > 2:2609189/1‑72 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa < 1:5370283/72‑1 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa < 2:1461209/72‑1 (MQ=255) ttttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgt < 2:112541/72‑1 (MQ=255) ttttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgt < 2:1610344/72‑1 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg > 2:3570831/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg > 2:23942/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg < 1:1085613/72‑1 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 2:5788877/72‑1 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 2:1822452/72‑1 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 1:1401716/72‑1 (MQ=255) gATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggt < 2:3136042/72‑1 (MQ=255) gATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggt > 2:6511427/1‑72 (MQ=255) gATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggt < 2:491976/72‑1 (MQ=255) aTAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggtt > 2:187043/1‑72 (MQ=255) aTAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggtt > 2:5756508/1‑72 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACACTAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 1:215497/1‑72 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg < 2:5030564/72‑1 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 2:4234699/1‑72 (MQ=255) | TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |