| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | = 1592280 | 90 (0.310) | 6 (0.020) | 6/134 | 18.2 | 8.0% | intergenic (‑17/‑259) | ydeI/ydeJ | YdeI family stress tolerance OB fold protein/2‑oxo‑tetronate isomerase |
| ? | NC_012967 | = 1592499 | 54 (0.200) | intergenic (‑236/‑40) | ydeI/ydeJ | YdeI family stress tolerance OB fold protein/2‑oxo‑tetronate isomerase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCAACGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTA > NC_012967/1592209‑1592349 | ccAACGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGc < 2:4686681/72‑1 (MQ=255)ccAACGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGc < 2:2911069/72‑1 (MQ=255) cAACGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGNCTCCTTAATTGCg < 1:3154081/72‑1 (MQ=255) aaCGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgt < 1:249155/72‑1 (MQ=255) aaCGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgt < 2:8392121/72‑1 (MQ=255) aCGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtt < 1:3988741/72‑1 (MQ=255) aCGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtt < 1:5444615/72‑1 (MQ=255) cGCATAGGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgttt < 1:4067266/72‑1 (MQ=255) cGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgttt < 1:7194276/72‑1 (MQ=255) cGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgttt < 1:2023291/72‑1 (MQ=255) cATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttgg < 2:7522506/72‑1 (MQ=255) aTAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttggt < 1:9273360/72‑1 (MQ=255) tAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttggtt < 1:5099561/72‑1 (MQ=255) tAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttggtt < 2:8912282/72‑1 (MQ=255) aaGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttggttt < 1:3973140/72‑1 (MQ=255) aGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCgtttggtttg < 2:2629698/72‑1 (MQ=255) ggCATGACAAGAAAACTTTCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGa < 1:4999630/72‑1 (MQ=255) ggCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGa < 1:7878764/72‑1 (MQ=255) gCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGAc < 2:5776896/72‑1 (MQ=255) gCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGAc < 2:1524329/72‑1 (MQ=255) aTGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACtt < 1:3679830/72‑1 (MQ=255) tGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACtta < 2:5889318/72‑1 (MQ=255) gACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttat < 2:2414966/72‑1 (MQ=255) aCAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatt < 1:4508252/72‑1 (MQ=255) aCAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatt < 2:8729206/72‑1 (MQ=255) aCAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatt > 1:4238370/1‑72 (MQ=255) cAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatta < 1:1814920/72‑1 (MQ=255) cAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatta < 1:8948391/72‑1 (MQ=255) cAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCATGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatta < 1:7948081/72‑1 (MQ=255) cAAGAAAACTTGCTAATACAACGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACttatta < 2:583832/72‑1 (MQ=255) aaGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTaa < 2:2429673/72‑1 (MQ=255) aaGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTaa < 2:2050479/72‑1 (MQ=255) aGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAg < 2:5533263/72‑1 (MQ=255) gAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGt > 1:1531232/1‑72 (MQ=255) gAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGt < 1:7832426/72‑1 (MQ=255) aacaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTc < 1:1117840/69‑1 (MQ=255) aaaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCt < 1:5111533/72‑1 (MQ=255) aaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTg < 2:9540358/72‑1 (MQ=255) aaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTg < 1:3651842/72‑1 (MQ=255) aaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGNTTGACTTATTAAGTCTg < 1:884810/72‑1 (MQ=255) aaCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTCCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTg < 2:5975404/72‑1 (MQ=255) aCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTgg < 1:4854322/72‑1 (MQ=255) aCTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTgg < 2:5911177/72‑1 (MQ=255) cTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGt < 1:8709882/72‑1 (MQ=255) cTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGt < 1:5290361/72‑1 (MQ=255) cTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGt < 2:7923356/72‑1 (MQ=255) ttGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGtt < 2:6088934/72‑1 (MQ=255) tGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTg > 2:9311761/1‑72 (MQ=255) cTAATACAATGGCCTGAANTTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCt < 1:3798945/72‑1 (MQ=255) cTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCt < 1:7405805/72‑1 (MQ=255) cTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCt < 1:3050263/72‑1 (MQ=255) cTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCt > 1:8595002/1‑72 (MQ=255) aTACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAtt < 1:1240620/72‑1 (MQ=255) aTACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAtt < 1:1514454/72‑1 (MQ=255) tACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAttt < 1:7016614/72‑1 (MQ=255) tACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAttt > 1:3461898/1‑72 (MQ=255) aCAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAtttt < 2:9582779/72‑1 (MQ=255) aCAATCGCCTGAAACTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAtttt < 2:7084397/72‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTAttttt < 1:1680195/72‑1 (MQ=255) aTGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTtat > 1:1789588/1‑72 (MQ=255) aTGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTtat > 1:2779072/1‑72 (MQ=255) ggCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTTCTATTTTTATaa < 1:2072666/72‑1 (MQ=255) ccTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAAtt > 2:9044594/1‑72 (MQ=255) cTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTg < 1:1476910/72‑1 (MQ=255) cTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGNTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTg < 2:611993/72‑1 (MQ=255) tGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGc < 1:3118755/72‑1 (MQ=255) gAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGcc < 1:5600154/72‑1 (MQ=255) aaTTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTTGTTTGACTTATTAAGTCTTGTTGCTATTTTTATAATTTCCaa > 1:6099111/1‑72 (MQ=255) aTTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCaaa < 1:7668897/72‑1 (MQ=255) tttCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAAt < 1:3218291/72‑1 (MQ=255) ttCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATa > 1:4367667/1‑72 (MQ=255) tCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATaa > 1:9078703/1‑72 (MQ=255) aTACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGa > 1:2917716/1‑72 (MQ=255) aTACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGa < 2:7642916/72‑1 (MQ=255) tACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGaa > 1:5835257/1‑72 (MQ=255) aCTGACTCCTTACTTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAat > 2:5698302/1‑72 (MQ=255) cTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAata > 1:1823115/1‑72 (MQ=255) tGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAatat > 2:1660298/1‑72 (MQ=255) gACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATAtt > 1:2775721/1‑72 (MQ=255) aCTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAAGTGCCAAATAAGAATATTg > 1:3829478/1‑72 (MQ=255) cTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGc > 1:87008/1‑72 (MQ=255) cTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGc < 1:5381720/72‑1 (MQ=255) tCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGcc > 1:5622277/1‑72 (MQ=255) tCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGcc > 2:7961590/1‑72 (MQ=255) tCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGcc < 2:48589/72‑1 (MQ=255) ccTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCa > 1:1957300/1‑72 (MQ=255) tAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAAtt < 2:6903560/72‑1 (MQ=255) tAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAAtt < 1:610951/72‑1 (MQ=255) ttGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGtt < 2:2727249/72‑1 (MQ=255) ttGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGtt < 2:1250286/72‑1 (MQ=255) ttGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGtt < 1:6111832/72‑1 (MQ=255) tGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTta < 1:2797862/72‑1 (MQ=255) | CCAACGCATAAGGCATGACAAGAAAACTTGCTAATACAATGGCCTGAAATTTCATACTGACTCCTTAATTGCGTTTGGTTTGACTTATTAAGTCTGGTTGCTATTTTTATAATTGCCAAATAAGAATATTGCCAATTGTTA > NC_012967/1592209‑1592349 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |