| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 880528 = | 188 (0.740) | 17 (0.080) | 17/114 | 9.1 | 12.5% | intergenic (+17/+163) | rcdA/ECB_RS04335 | DNA‑binding transcriptional regulator RcdA/hypothetical protein |
| ? | NC_012967 | = 904682 | 87 (0.430) | intergenic (+77/+159) | ECB_RS04500/ybjL | ogr/Delta‑like zinc finger family protein/aspartate:alanine antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 | tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 1:9105179/72‑1 (MQ=255) aGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAAc < 1:2684554/72‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 1:6819917/1‑72 (MQ=255) cGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaa > 1:5054036/1‑72 (MQ=255) gCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaa > 2:8831403/1‑72 (MQ=255) gCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaa > 1:312236/1‑72 (MQ=255) cTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaa > 1:4873097/1‑72 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa > 1:8789373/1‑72 (MQ=255) aTCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAc > 1:3007085/1‑72 (MQ=255) tCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAcc > 2:5172176/1‑72 (MQ=255) tCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAcc < 1:6726458/72‑1 (MQ=255) cgcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc < 2:2609981/72‑1 (MQ=255) cgcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc < 2:5366404/72‑1 (MQ=255) cgcgcgAGGAGATTTTGACGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc > 2:4751830/1‑72 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa < 1:2402465/72‑1 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa < 1:8368273/72‑1 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa > 2:5644915/1‑72 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa > 2:5068277/1‑72 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa > 2:9058945/1‑72 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 2:4166097/1‑72 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 2:3171111/72‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 1:6273165/72‑1 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg > 1:8079453/1‑72 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 1:7853303/72‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa < 2:4411950/72‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGANGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 1:3548454/72‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 1:2820980/72‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 1:4303254/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTGAACg < 1:343062/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 1:7981376/72‑1 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg > 2:4219950/1‑72 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt < 1:6091758/72‑1 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt > 2:6400769/1‑72 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt < 2:256193/72‑1 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa > 1:3667520/1‑72 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGNAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa > 1:5906610/1‑72 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt > 1:4801034/1‑72 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 1:1615263/72‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg > 1:1294761/1‑72 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 1:3143643/72‑1 (MQ=255) gTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaa < 2:7637213/72‑1 (MQ=255) ggagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa < 1:946180/71‑1 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACag > 2:2912510/1‑71 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa < 1:1116861/72‑1 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa < 1:8673530/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 2:5338415/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa > 2:7894157/1‑72 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg > 1:7721620/1‑72 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt < 1:5588335/72‑1 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt > 1:8521275/1‑72 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt < 2:855238/72‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt < 2:6505125/72‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt < 1:5767232/72‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt > 2:2073250/1‑72 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAANCCATTTNTGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat < 1:521511/72‑1 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat < 2:1579319/72‑1 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat > 1:7803702/1‑72 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtat < 2:9035015/72‑1 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata < 1:6511071/72‑1 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata > 2:6261485/1‑72 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata > 2:8401690/1‑72 (MQ=255) gggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg > 2:6224179/1‑72 (MQ=255) gggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg > 1:3987045/1‑72 (MQ=255) ggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 2:8629687/72‑1 (MQ=255) ggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 1:4813294/72‑1 (MQ=255) ggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 2:7370604/72‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa < 2:5957735/72‑1 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa < 1:1109528/72‑1 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 2:8110805/1‑72 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 1:389956/1‑72 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaa > 2:5775284/1‑72 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa > 1:6588022/1‑72 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa < 1:7257328/72‑1 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa > 2:7469198/1‑72 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa < 2:1084705/72‑1 (MQ=255) tagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa > 1:8012903/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa > 1:3414301/1‑70 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa < 2:3414300/70‑1 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTNAAAAc > 2:796712/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc < 1:698115/72‑1 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc < 1:1490211/72‑1 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 1:7119920/72‑1 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa > 2:3807057/1‑72 (MQ=255) gATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 2:3769730/72‑1 (MQ=255) aTAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACaa > 2:4341215/1‑72 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAaataat < 2:7525377/72‑1 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAAt < 2:5799583/72‑1 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGG‑TAATGAAAACAATAAGTTACACTAAAATCAATa > 2:5800900/1‑72 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATCTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAAt > 1:6449970/1‑72 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa > 1:8951707/1‑72 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg < 2:6590823/72‑1 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt < 1:7475079/72‑1 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt > 2:1903456/1‑72 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg < 2:6873712/72‑1 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg > 1:5788881/1‑72 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg > 1:5304874/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg < 1:1906577/72‑1 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg < 1:3000891/72‑1 (MQ=255) caaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttaggttg < 2:4861947/71‑1 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 2:5498000/1‑72 (MQ=255) | TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |