| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 3482676 = | 119 (0.470) | 76 (0.330) | 53/130 | 3.6 | 47.7% | coding (992/2706 nt) | malT | HTH‑type transcriptional regulator MalT |
| ? | NC_012967 | = 3482700 | 58 (0.250) | coding (1016/2706 nt) | malT | HTH‑type transcriptional regulator MalT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TTTACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAGG > NC_012967/3482605‑3482747 | tttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcg < 1:1704405/72‑1 (MQ=255)tttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcg > 1:7781044/1‑72 (MQ=255) ttACGGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 1:3330458/72‑1 (MQ=255) ttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 2:3730100/72‑1 (MQ=255) ttACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAgcgc < 2:2830395/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGGTGGTACCTGCCAAGCGGTCCGCTATAACCCGCTGTTGTGGGACTGCCTGCGCCCGCGCt > 2:1248470/1‑72 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 1:1570573/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 1:5263664/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCt < 2:4019102/72‑1 (MQ=255) tACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCCGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAccgcc > 2:9165281/1‑71 (MQ=255) aCAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCTCTg > 1:23580/1‑72 (MQ=255) cAGCGGGTGGGTGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc < 2:2164023/72‑1 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTCTCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc > 2:8555940/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc > 2:371651/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc > 1:5230402/1‑72 (MQ=255) cAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGc < 2:7694412/72‑1 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAGCTTCCTGCGCCAGCGCTGcc > 1:5185082/1‑72 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCgccgcc > 1:4582267/1‑72 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc > 1:8844090/1‑72 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc < 1:8508844/72‑1 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc < 2:6424576/72‑1 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc > 1:2594552/1‑72 (MQ=255) aGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGcc > 1:4208599/1‑72 (MQ=255) gNGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGNCAGCGCTGCCa < 1:886554/72‑1 (MQ=255) gCGGATGGATGGTACCGCCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCa < 2:2328384/72‑1 (MQ=255) gCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCa < 1:8822736/72‑1 (MQ=255) gCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCa < 2:322081/72‑1 (MQ=255) cGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAg > 2:6404418/1‑72 (MQ=255) cGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAg < 1:54455/72‑1 (MQ=255) cGGATGGATAATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAg > 1:392118/1‑72 (MQ=255) ggatggatGATACCNNNGAGTGGTTCTGCTATCANCAGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt < 1:6534822/72‑1 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCTGt < 2:816502/72‑1 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAgc > 2:5294902/1‑71 (MQ=255) ggatggatGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGt < 1:7953137/72‑1 (MQ=255) gatggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTg < 1:5417290/72‑1 (MQ=255) gatggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGACCGCGCTGTCAGTg > 1:2018867/1‑72 (MQ=255) gtggatcGTACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg < 2:5822003/71‑1 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGGTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg > 1:1851194/1‑72 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCCGCGCTGCCCGTgg > 2:6714786/1‑72 (MQ=255) atggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTgg < 2:2898469/72‑1 (MQ=255) tggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTggg > 1:2963846/1‑72 (MQ=255) tggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTggg > 2:2115126/1‑72 (MQ=255) ggatgATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGa < 2:5962360/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCTCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGGGCTGCCAGTGGGaa < 2:6608196/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa < 2:7959408/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa < 2:4454154/72‑1 (MQ=255) gatgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTAGTGCCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGaa < 1:3180216/72‑1 (MQ=255) atgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAAc > 1:6273736/1‑72 (MQ=255) atgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAAc > 1:5662530/1‑72 (MQ=255) tgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACt > 1:2201320/1‑72 (MQ=255) tgatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACt > 1:7166101/1‑72 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCCGCGCCGCCAGTGGGAAcgg > 1:8236651/1‑70 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGCACTg > 1:5966242/1‑72 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 2:2420554/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 2:5096068/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 1:9102038/72‑1 (MQ=255) gatACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg > 1:2097758/1‑72 (MQ=255) gatACCGGCGAGGGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTg < 2:6660291/72‑1 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTTCGCCCGCGCCTCCCGTTGGGACTgg > 1:1033891/1‑72 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg > 1:4759831/1‑72 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg < 1:6794092/72‑1 (MQ=255) atACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTgg > 1:8190955/1‑72 (MQ=255) tACCGGCGAGTGTTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggc < 2:7754994/72‑1 (MQ=255) aCCGGCGCGTGGTTCTGCTATCACCCGCGGTTTGGTAACTGCCGGCGCCGGCGCTGCCAGTGGGAACTggcg < 2:3041282/72‑1 (MQ=255) aCCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcg < 1:6275102/72‑1 (MQ=255) aCCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcg > 1:7721147/1‑72 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTtgtggc > 1:1138602/1‑72 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggg > 2:5503983/1‑71 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc < 2:1762934/72‑1 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc < 2:3719942/72‑1 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc > 2:9142855/1‑72 (MQ=255) cGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTggcggc < 2:46170/72‑1 (MQ=255) cGAGTGTTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAGCTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGa < 1:2601440/72‑1 (MQ=255) cGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGcggcggg > 2:5498382/1‑71 (MQ=255) cGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGa > 1:8601699/1‑72 (MQ=255) cGAGTGGTTCTCCTATCACCCGCTGTTTGTTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGa < 2:3410201/72‑1 (MQ=255) gAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGcggcgggg > 1:920194/1‑70 (MQ=255) gAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAg > 2:4747893/1‑72 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTTGCGGCGGacc > 1:2742513/1‑70 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAgg > 1:2898419/1‑71 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGc > 2:4999640/1‑72 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGc < 1:671170/72‑1 (MQ=255) aGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGc > 2:7445024/1‑72 (MQ=255) ggTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTNCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGccga > 1:617914/1‑69 (MQ=255) ggTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCCGCCAGTGGGAACTGGCGGCCGAGCTgt > 1:1251698/1‑71 (MQ=255) ggTTCGCCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTCCCTGCGCCGGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGc < 2:2680738/72‑1 (MQ=255) gTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcc > 1:3856993/1‑72 (MQ=255) ttCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGGGGCGGAGCTGcca < 2:6273733/72‑2 (MQ=255) ttCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGcca > 2:2444130/1‑71 (MQ=255) cTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGccagt < 1:7509784/72‑4 (MQ=255) cTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAATGGGAACTGGCGGCGGAGCTGccagt > 1:4526681/1‑69 (MQ=255) ggagcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGGAATACACCGTGGCGCCGGCGAAAAGCGGACGGccc > 2:5447321/4‑72 (MQ=255) ggagcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGGTGGccc > 1:5334962/4‑72 (MQ=255) ggagcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGgcc > 2:4773003/4‑72 (MQ=255) ggagcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGccc > 1:7277461/4‑72 (MQ=255) gagcTGCAAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCa < 1:6547169/70‑1 (MQ=255) agcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCNGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAg > 1:5927980/2‑72 (MQ=255) agcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAg < 1:6981777/71‑1 (MQ=255) gcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGCAAGCTGGATGGGCCAgg > 1:4321979/1‑72 (MQ=255) gcTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAgg > 1:4759592/1‑72 (MQ=255) | TTTACAGCGGATGGATGATACCGGCGAGTGGTTCTGCTATCACCCGCTGTTTGGTAACTTCCTGCGCCAGCGCTGCCAGTGGGAACTGGCGGCGGAGCTGCCGGAAATCCACCGTGCCGCCGCAGAAAGCTGGATGGCCCAGG > NC_012967/3482605‑3482747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |