| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 880528 = | 203 (0.810) | 51 (0.250) | 38/114 | 5.7 | 25.7% | intergenic (+17/+163) | rcdA/ECB_RS04335 | DNA‑binding transcriptional regulator RcdA/hypothetical protein |
| ? | NC_012967 | = 904682 | 133 (0.660) | intergenic (+77/+159) | ECB_RS04500/ybjL | ogr/Delta‑like zinc finger family protein/aspartate:alanine antiporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 | tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 2:8551256/72‑1 (MQ=255)tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 2:7711288/72‑1 (MQ=255)tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa > 2:7242207/1‑72 (MQ=255)tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 2:3182/72‑1 (MQ=255) aaGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa > 1:4674098/1‑72 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa < 2:6099085/72‑1 (MQ=255) cGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaga < 1:2909319/72‑3 (MQ=255) gCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaa < 1:8196133/72‑1 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGANAGGGTTNCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa > 1:501845/1‑72 (MQ=255) aTCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAc < 2:4509261/72‑1 (MQ=255) tCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAcc < 1:8337826/72‑1 (MQ=255) cgcgcgAGGAGATTTTGAGGAAGGTTGAGAGGCTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc > 2:3462141/1‑72 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa < 2:6172511/72‑1 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt < 1:699059/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt > 1:1769304/1‑72 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAttt < 1:6979838/72‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAatt < 1:7403079/72‑1 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa < 1:7014847/72‑1 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa > 1:5824822/1‑72 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa > 2:1245642/1‑72 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt > 1:3446944/1‑72 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 2:3594513/72‑1 (MQ=255) gagaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGt > 2:6842965/1‑72 (MQ=255) gagaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGt < 2:2679356/72‑1 (MQ=255) gagaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGATTGCTGAGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGt < 1:679910/72‑1 (MQ=255) agaTTTTGATGATGGTTGAGAGGGTTGTAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTa > 1:3298561/1‑72 (MQ=255) agaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGGAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTa > 1:6865879/1‑72 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa > 2:8375625/1‑72 (MQ=255) ttttGACGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAc < 2:4920339/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg > 2:1479973/1‑72 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 1:3927888/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 2:3642993/72‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 2:6349125/72‑1 (MQ=255) tctGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 1:897599/70‑1 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAAgggg < 1:4041005/72‑1 (MQ=255) tGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg < 2:8741093/72‑1 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt < 2:1949261/72‑1 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt < 1:2056930/72‑1 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTATATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa < 2:5994309/72‑1 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa < 2:5857760/72‑1 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa > 2:8136675/1‑72 (MQ=255) ggATGGTTGAGAGGGCTGCAGGGTAGCAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATCTCTGTAACCGGGTTa > 1:2553679/1‑72 (MQ=255) gATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTaa < 2:6545337/72‑1 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt > 1:636369/1‑72 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:2304192/72‑1 (MQ=255) ggTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGa < 2:1882506/72‑1 (MQ=255) ggNTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGa < 2:718472/72‑1 (MQ=255) gTTGAGAGGGTTGCAGGTTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAGCCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaa > 1:3235075/1‑72 (MQ=255) gTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaa < 1:4900227/72‑1 (MQ=255) tGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa < 1:8434852/72‑1 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc < 1:1753356/72‑1 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc > 2:7569566/1‑72 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc < 1:3062231/72‑1 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACa > 2:2792436/1‑72 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa < 2:7594083/72‑1 (MQ=255) gagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa < 1:1455258/72‑1 (MQ=255) gggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa < 1:8022456/72‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 1:7973088/72‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg < 1:1315942/72‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg < 1:6724388/72‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAg > 2:4821423/1‑72 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt < 2:3891385/72‑1 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt > 1:7898288/1‑72 (MQ=255) ttGCAGGGTACTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt > 1:4751277/1‑72 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGtt > 2:7022005/1‑72 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 2:4170730/1‑72 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAAGAAAACAATAAGTtat < 1:919024/72‑1 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata > 1:5665061/1‑72 (MQ=255) ggTAGTAGATAAGTNNNAGATAACAAAAAACCCANTGATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 1:6232131/72‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACACATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa > 2:3249244/1‑72 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa < 1:2365644/72‑1 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa < 1:6483761/72‑1 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 1:4473529/1‑72 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaa > 1:7755109/1‑72 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaa > 1:5497893/1‑72 (MQ=255) tagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa > 2:3547480/1‑72 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc < 1:8513469/72‑1 (MQ=255) tAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAAt < 1:8214827/72‑1 (MQ=255) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa > 2:2504980/1‑72 (MQ=255) aGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAANCAATAAGTTATAGTAAAAACAATaa < 1:985544/72‑1 (MQ=255) gTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg < 1:2977994/72‑1 (MQ=255) ttttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgt < 1:5726443/72‑1 (MQ=255) ttttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgt > 1:4831650/1‑72 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt > 1:111850/1‑72 (MQ=255) tttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt < 1:3661728/72‑1 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg > 1:5563563/1‑72 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg > 1:6104901/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg > 1:4978720/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg > 2:5542954/1‑72 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgg > 1:4323684/1‑72 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTNATGAAANCAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 1:507766/72‑1 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg > 1:5923850/1‑72 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg < 2:847696/72‑1 (MQ=255) aGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggc < 1:3731159/72‑2 (MQ=255) gATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgtgt > 1:7287028/1‑69 (MQ=255) gATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggt < 2:7960599/72‑1 (MQ=255) aTAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggtt < 1:1921755/72‑1 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 2:6441111/1‑72 (MQ=255) caaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg < 2:2941125/71‑1 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttgg > 2:1824956/1‑72 (MQ=255) | TAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGG > NC_012967/880457‑880599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |