New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP002094 | = 25978 | 132 (1.320) | 9 (0.090) +TA |
7/192 | 11.4 | 6.6% | intergenic (+2/‑10) | LLNZ_t13263/LLNZ_t13265 | tRNA‑Phe/tRNA‑Gly |
? | CP002094 | = 2500912 | 127 (1.270) | intergenic (‑1/+35) | LLNZ_t13375/LLNZ_t13377 | tRNA‑Tyr/tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TCAAATCCTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAATATTTTGG > CP002094/25880‑26074 | aaaTCCTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑Tcc < 2:1032653/99‑1 (MQ=255) aaaTCCTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑Tcc < 1:1470820/99‑1 (MQ=255) aaTCCTAATCGCGCAATTAAAGGCTCGGTAGAGCAGGTGGTGGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCt < 1:365366/99‑1 (MQ=17) aTCCTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCtt < 1:1014526/99‑1 (MQ=255) ccTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCCGATGGTAGAGTAATGGATTGAAGCCCCATGTGACGGC‑GGATCGCTTTCGTGTCGGGCCGT‑Tccgtca > 2:555446/1‑95 (MQ=255) ccTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTAt < 1:1060350/99‑1 (MQ=255) ccTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTAt < 1:102033/99‑1 (MQ=255) cTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTAtt < 2:798155/99‑1 (MQ=255) cTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTAtt < 2:1222987/99‑1 (MQ=255) tATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTTCGTCTCGCGCCAT‑TCCtttttt > 2:828500/1‑99 (MQ=255) tATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTAttt < 2:1150807/99‑1 (MQ=255) aTTCGCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGTTAGAGCAATAGATTTAAGCACCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTa < 2:842557/99‑1 (MQ=17) cGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGa < 1:1662022/99‑1 (MQ=255) aaTTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGt > 2:509021/1‑99 (MQ=255) aTTAACGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTa < 2:1454052/99‑1 (MQ=255) ttAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAg < 1:1402499/99‑1 (MQ=255) aaaGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGtt < 2:74525/99‑1 (MQ=255) aaaGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGtt < 1:440682/99‑1 (MQ=255) aaGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGGTTTGTTTCGTCCTCGCGCCCT‑CCTTTTTTTATCGGGGGTAGtt > 1:81778/1‑99 (MQ=2) aaGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGttt < 2:379354/99‑1 (MQ=255) aaGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGgtt > 2:1333079/1‑99 (MQ=255) aGGCTCGGTGGCTCAGTTGGTAGAGCGATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTa < 1:740428/99‑1 (MQ=255) aGGCTCGGTATCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTa < 2:30390/99‑1 (MQ=255) ggCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCTTGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTaa < 1:1653563/99‑1 (MQ=255) ggCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTTGCGGATGTAGTTTaa > 2:150274/1‑99 (MQ=255) gCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAAt < 2:964586/99‑1 (MQ=255) gCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAAt > 2:1580173/1‑99 (MQ=255) gCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAAt < 2:317959/99‑1 (MQ=255) gCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGGTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGGAGTTTAAt > 2:1245712/1‑99 (MQ=255) cgcGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GTTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATg < 1:1157587/97‑1 (MQ=255) tCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATgg < 2:1390005/99‑1 (MQ=255) cGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGt < 1:858655/99‑1 (MQ=255) ggTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGGTGTAGTTTAATGGTa > 1:637515/1‑99 (MQ=255) ggTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTa < 2:241846/99‑1 (MQ=255) gTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCCT‑TCCTTATTTAGCGGGTGTAGTTTAATGGGAg > 2:1149474/1‑99 (MQ=255) gTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAg > 2:589440/1‑99 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AAc < 2:309885/99‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCCCGCCCT‑TCCTTATTTTGCGGGTGTAGTTTTATGGTAG‑aaa > 1:1577612/1‑98 (MQ=14) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTTATGGTAG‑AAcc < 2:1260966/99‑1 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AAcc < 2:241256/99‑1 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AAcc < 1:126142/99‑1 (MQ=255) aGTCGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCCCGCGCCCTATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AAccac > 2:648279/1‑97 (MQ=2) gTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCaa > 2:1282791/1‑98 (MQ=255) ggTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGCCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCt < 2:582800/99‑1 (MQ=255) gTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCtt < 2:424558/99‑1 (MQ=255) gTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCtt < 1:548859/99‑1 (MQ=255) gTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCCCGCGCCATATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AACCACAGCCt > 2:777661/1‑99 (MQ=11) tAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTc < 2:38400/99‑1 (MQ=255) tAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCCCGCGCCATATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AACCACAGCCtt < 2:898368/99‑1 (MQ=2) agagCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTcc < 2:1075907/99‑1 (MQ=255) gagCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCCGTTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTTGAGGGTGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCCGCGTTCCa > 1:900798/1‑99 (MQ=14) agCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCaa > 2:67828/1‑99 (MQ=255) ggATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGc < 2:56876/99‑1 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCt > 2:1397533/1‑99 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCt > 2:234825/1‑99 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCCCGCGCCATATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AACCACAGCCTTCCAAGCTgtt > 2:1243207/1‑97 (MQ=2) aTTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTa < 1:106196/99‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTa < 2:861772/99‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTCAGCGGATGTCGTTTAATGGTAG‑AACCCCCGCCTTCCAAGCTGGCTa > 2:180287/1‑99 (MQ=255) ttGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑GACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTAc > 2:1118586/1‑99 (MQ=255) ttGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGGTCGATTCCCTCTCGCGCCGT‑TCCTTAATTATCCGAGGTAGTTTGACTGGAG‑ACACCCCGCCTTCCAAGCTTGCTaa > 2:46355/1‑98 (MQ=9) aaGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTAcgcg > 2:1484749/1‑99 (MQ=255) aaGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTAcgcg > 2:1395117/1‑99 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCCGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGGGt > 2:437788/1‑99 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGt < 2:933353/99‑1 (MQ=255) tCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGtt < 1:1527729/99‑1 (MQ=255) ccATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTc < 2:628426/99‑1 (MQ=255) aTGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGa < 2:1527585/99‑1 (MQ=255) tgtgTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTTGCGGGTGTAGTTTTATGGTAG‑AAACCCAGCCTTTCCAGCTGGCTACGCGGGGTCggt > 1:669616/1‑97 (MQ=14) tgtgTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGGTGTAGGTTTATTGTAGAAACCCCACCCTTCC‑AGCCGGCTACCCGAGGTCggt > 1:934644/1‑97 (MQ=14) tgtgTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGAt > 1:640114/1‑99 (MQ=255) gtgtCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGAtt < 1:216711/99‑1 (MQ=255) tgtCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATtc > 2:1485634/1‑99 (MQ=255) gtCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATtct < 2:828875/99‑1 (MQ=255) gtCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATtct < 1:831421/99‑1 (MQ=255) gcc‑ggTTCGATTCCGTCCCGCGCCATATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AACCACAGCCTTCCAAGCTGTTGTCGCGAGTCCGATTCTCg < 1:1210393/97‑1 (MQ=2) gc‑ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGa < 1:43868/40‑1 (MQ=255) gc‑ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGa > 2:43868/1‑40 (MQ=255) c‑ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCa < 2:1322080/99‑1 (MQ=255) c‑ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCa > 2:539237/1‑99 (MQ=255) ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCAt < 1:1018269/99‑1 (MQ=255) ggTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCAt < 1:1018897/99‑1 (MQ=255) ggTTCGATTCCGTCCCGCGCCATATCTGTATTCTGCGGGTATAGTTTAGTGGTAA‑AACCACAGCCTTCCAAGCTGTTGTCGCGAGTCCGATTCTCGtta < 2:697587/99‑3 (MQ=2) gTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AGCCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATc < 2:936028/99‑1 (MQ=255) gTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATc > 2:1567876/1‑99 (MQ=255) gTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATc > 2:902296/1‑99 (MQ=255) gTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATc < 2:1186830/99‑1 (MQ=255) tCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑ACCCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCg < 1:979566/99‑1 (MQ=255) cGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGc < 2:1177678/99‑1 (MQ=255) taTTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGTGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGct < 2:1029145/98‑1 (MQ=255) gATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGct < 1:221940/99‑1 (MQ=255) ccGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGcttaac < 2:776316/99‑1 (MQ=255) ccGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGcttaac < 1:663018/99‑1 (MQ=255) ccGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGcttaac < 1:353614/99‑1 (MQ=255) ctcGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGcttaacttaa < 1:35339/99‑1 (MQ=255) ggctccAT‑TCCTTATTTAGCGGATGGAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAata < 1:1189957/95‑1 (MQ=255) cgcgCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAata < 1:161380/99‑1 (MQ=255) gcgcCAT‑GCCTTATTTAGCGGGTGTAGTTTATTGGTAG‑ACCCTTAGCCTTCTAAGCTGGCTACGCGGGGTCCATTCTCGTCACCCGCTTAACTTAatat < 2:1525608/99‑1 (MQ=17) aT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAATATTTTgg < 1:489386/99‑1 (MQ=255) aT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAATATTTTgg > 2:670987/1‑99 (MQ=255) | TCAAATCCTATTCCCGCAATTAAAGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGC‑GGTTCGATTCCGTCTCGCGCCAT‑TCCTTATTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAG‑AACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAACTTAATATTTTGG > CP002094/25880‑26074 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |