New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP002094 | = 518215 | 104 (1.040) | 9 (0.090) +TA |
7/192 | 11.4 | 7.4% | intergenic (+2/‑9) | LLNZ_t13313/LLNZ_t13315 | tRNA‑Phe/tRNA‑Gly |
? | CP002094 | = 2500912 | 127 (1.270) | intergenic (‑1/+35) | LLNZ_t13375/LLNZ_t13377 | tRNA‑Tyr/tRNA‑Val | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AATCCAGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAACA > CP002094/518118‑518313 | aaTCCAGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTc < 2:541132/99‑1 (MQ=255) aaTCCAGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTc < 2:426673/99‑1 (MQ=255) tCCAGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCt‑t < 2:1313168/99‑1 (MQ=255) cAGCAAGATACATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTg < 2:361644/99‑1 (MQ=255) aGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGt < 1:476893/99‑1 (MQ=255) aGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGt < 1:586439/99‑1 (MQ=255) gCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGGAGCTCCGTTGGTAGAGCAATGGGTTGAAGCTCCATGTGTCCGCGGTTTGATTCCGTCCCCC‑GCCAGTCt‑ttttt > 2:921240/1‑99 (MQ=17) tCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGa < 1:1608358/99‑1 (MQ=255) tCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGa < 2:396487/99‑1 (MQ=255) tatCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTa > 2:436097/1‑99 (MQ=255) tatCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTa < 2:1170124/99‑1 (MQ=255) atCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAg < 1:798183/99‑1 (MQ=255) tCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGt < 1:401102/99‑1 (MQ=255) tttGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGttt < 1:693044/99‑1 (MQ=255) tttGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGttt > 2:1618527/1‑99 (MQ=255) tGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTaa < 2:543657/99‑1 (MQ=255) tGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTaa < 1:140419/99‑1 (MQ=255) cTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATgg < 2:879712/99‑1 (MQ=255) tCGGTAGCTCAGTTTGTAGAAAAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGt < 2:834452/99‑1 (MQ=255) tCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGt > 2:508218/1‑99 (MQ=255) cGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTa < 2:329024/99‑1 (MQ=255) ggTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTTGATTCCGTCTCGC‑GCCCTTCT‑TTTTTTGCGGGTGGTGTTTTATTGTAg > 1:1003431/1‑99 (MQ=11) ggTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAg < 1:663545/99‑1 (MQ=255) ggTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAg < 1:1225840/99‑1 (MQ=255) gTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCACTCT‑TTGTTAGCGGGTGTAGTTTATTGGgaga > 1:341823/1‑99 (MQ=14) tAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGaa < 1:1122066/99‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAcc < 2:79620/99‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAcc < 2:1427598/99‑1 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAccc < 2:1456736/99‑1 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAccc > 2:831709/1‑99 (MQ=255) cTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGATAGAAccc > 2:1513068/1‑99 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAcccc < 1:379349/99‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAcccc < 2:1158071/99‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAcccc < 2:421344/99‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGTCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCCTTCT‑TTGTTTGCGGGTGTTGTTTTATGGTGGAACCCCAGc > 1:273284/1‑99 (MQ=14) gTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGc < 2:1493221/99‑1 (MQ=255) ttGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTTCGTTTCCCGGCCATCTT‑TTTTTACGGGGGGGGGTTTAATGGGGGAACCCCacc > 1:1598621/1‑97 (MQ=0) ttGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGcc < 2:818019/99‑1 (MQ=255) tGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCTGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCt < 1:311045/99‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGG‑GCCATTCT‑TTGGTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCtt > 2:1566634/1‑99 (MQ=255) ggTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCtt < 1:1142715/99‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCtt < 1:65411/99‑1 (MQ=255) ggTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCtt > 2:799327/1‑99 (MQ=255) gTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTc < 1:1583764/99‑1 (MQ=255) tAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAAACCCCGCCTTcc > 1:358384/1‑99 (MQ=255) tAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGCTCCCTTCCCTCCCGG‑CCCCTTCTCTTTTTGGCGGATGTTCTTTTATGGTGGAACCCAACCCtcc > 1:466636/1‑97 (MQ=0) gagCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCaa < 2:733777/99‑1 (MQ=255) agCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAg < 2:601505/99‑1 (MQ=255) cAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTTTTAGCGGGTGTAGTTTTATTGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCt > 1:530081/1‑99 (MQ=11) aTGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTgg < 2:1137447/99‑1 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTa < 2:1225077/99‑1 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTa < 2:1058547/99‑1 (MQ=255) gATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTa < 2:1403217/99‑1 (MQ=255) gATTGAAGCACCATGGGTGTGCGGTTCGATGCCGGCTCGC‑GCCATTGT‑TTGTTGGCGGCTGGAGTTCAATGGAAGAGCCCCATACTTCCAAGCTGGCTa < 2:301998/99‑1 (MQ=9) aTTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTAc > 2:547169/1‑99 (MQ=255) aaGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGGCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTACAACCCCAACCTTCCAAGCTGGCTACGCGa > 2:516331/1‑99 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCCTTCT‑TTGTTTGCGGGTGTAGTTTAATGGGAGAAACCCCGCCCTCCAAGCTGGCTTCGCGAggt > 1:606402/1‑97 (MQ=14) cTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGtt < 2:1298497/99‑1 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGtt < 1:1221073/99‑1 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGtt < 1:844735/99‑1 (MQ=255) cTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGtt < 1:888287/99‑1 (MQ=255) tgtgGCGGCGGTTCGAGTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTTGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGAtt < 2:1002072/99‑1 (MQ=255) tgtCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTTTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCCAGCTGGCCACGCGAGTTCGAAtct > 2:461506/1‑99 (MQ=11) tgtCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATtct < 1:273080/99‑1 (MQ=255) tgtCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATtct < 2:619921/99‑1 (MQ=255) gtCGGCGGTTCGCTTCCGTCTCGC‑GCCCTTCT‑TTGTTTTCGGATGTAGTTTAATGGGAGAACCCCAACCTTCCAAAGTGGATACGCGAGTTCGATtttc > 2:11390/1‑99 (MQ=14) tCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCg < 2:565647/99‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTAAGCGAGTTCGGTTCTCg > 2:68888/1‑99 (MQ=255) cggcggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGt < 1:90724/99‑1 (MQ=255) gcggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCa < 2:153620/99‑1 (MQ=255) gcggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCa < 1:1658632/99‑1 (MQ=255) gcggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGGTCGATTCTCGTCa > 1:1230880/1‑99 (MQ=255) gcggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGGTCGATTCTCGTCa > 1:341159/1‑99 (MQ=255) cggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCAt < 2:468260/99‑1 (MQ=255) cggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCAt < 1:1279375/99‑1 (MQ=255) ggTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATc < 2:895678/99‑1 (MQ=255) gTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATcc > 1:873056/1‑99 (MQ=255) tCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGc < 2:1355427/99‑1 (MQ=255) gATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCtt > 2:1555868/1‑99 (MQ=255) aTTCCTTCTCGC‑TCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTa < 1:596171/99‑1 (MQ=255) aTTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGGGGTCGATTCTCGTCCTCCGCTTa > 1:103975/1‑99 (MQ=255) aTTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTa > 2:567991/1‑99 (MQ=255) ttCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAg > 2:498766/1‑99 (MQ=255) ttCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAg < 1:690046/99‑1 (MQ=255) ccGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGtt > 2:619675/1‑99 (MQ=255) cGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGttt < 2:670494/99‑1 (MQ=255) gTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGtttt > 2:726625/1‑99 (MQ=255) tctcGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTc > 2:1207621/1‑99 (MQ=255) ctcGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCa > 2:1226351/1‑99 (MQ=255) tcGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCAt < 1:659961/99‑1 (MQ=255) tcGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCAt < 2:205494/99‑1 (MQ=255) cgc‑gCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCAtt < 2:878366/99‑1 (MQ=255) c‑gcCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTg > 2:196580/1‑99 (MQ=255) ccATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGaa > 2:1231731/1‑99 (MQ=255) cATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGaaa < 2:1492668/99‑1 (MQ=255) ttCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAAc < 2:1078584/99‑1 (MQ=255) ttCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAAc > 2:536047/1‑99 (MQ=255) ttCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAAc > 2:1084239/1‑99 (MQ=255) tCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAACa > 2:165837/1‑99 (MQ=255) tCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAACa > 1:1102831/1‑99 (MQ=255) | AATCCAGCAAGATCCATATCTTTGGCTCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAATGGATTGAAGCTCCATGTGTCGGCGGTTCGATTCCGTCTCGC‑GCCATTCT‑TTGTTAGCGGATGTAGTTTAATGGTAGAACCCCAGCCTTCCAAGCTGGCTACGCGAGTTCGATTCTCGTCATCCGCTTAGTTTTCATTTGAAAACA > CP002094/518118‑518313 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |