| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP002094 | 1041791 = | 5 (0.050) | 93 (0.940) | 77/194 | 0.1 | 95.0% | coding (124/570 nt) | LLNZ_05610 | hypothetical protein |
| ? | CP002094 | 1204449 = | NA (NA) | intergenic (+84/+53) | LLNZ_06340/LLNZ_06345 | transposase/transposase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AAGCGAAGCAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTA > CP002094/1204351‑1204535 | aagcgaagcAAGTAAAAGGATTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTg > 2:959798/1‑99 (MQ=9) agcgaagcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGa > 2:808045/1‑99 (MQ=32) cgaagcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACg < 2:374635/99‑1 (MQ=34) aagcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGtt > 1:871128/1‑99 (MQ=37) aagcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGtt > 2:908321/1‑99 (MQ=37) agcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACTTTa > 1:570491/1‑99 (MQ=21) agcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTa < 2:1587612/99‑1 (MQ=38) agcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTa > 2:589313/1‑99 (MQ=38) agcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTa > 1:1400263/1‑99 (MQ=38) gcAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTaa > 1:1434842/1‑99 (MQ=39) aaGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGt < 2:1209587/99‑1 (MQ=255) aaGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGt > 2:1295011/1‑99 (MQ=255) aaGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGt < 2:737971/99‑1 (MQ=255) aaGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGt < 2:656934/99‑1 (MQ=255) aGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTc > 1:197312/1‑99 (MQ=255) tAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCaa > 1:514662/1‑99 (MQ=255) aaaaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAg < 2:288211/99‑1 (MQ=255) aaaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCaatt > 1:1372367/1‑97 (MQ=255) aaaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGt > 2:460015/1‑99 (MQ=255) aaaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGt > 1:264188/1‑99 (MQ=255) aaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGtt > 1:1606360/1‑99 (MQ=255) aaCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGtt > 2:1153024/1‑99 (MQ=255) aCGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGttt > 1:420898/1‑99 (MQ=255) ttttGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTa > 2:1257556/1‑99 (MQ=255) tttGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTag > 2:786039/1‑99 (MQ=255) ttGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTaga < 1:564132/99‑1 (MQ=255) ttGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTaga < 1:240163/99‑1 (MQ=255) tGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTagag > 1:370972/1‑99 (MQ=255) aaTTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTa > 1:1604116/1‑99 (MQ=255) aTTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTaa > 2:672039/1‑99 (MQ=255) aTTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTaa < 2:762236/99‑1 (MQ=255) tttCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAAc < 2:1252296/99‑1 (MQ=255) ctctTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACaaa < 1:1483657/99‑1 (MQ=255) ctctTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACaaa < 2:320025/99‑1 (MQ=255) ctctTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGATCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACaaa < 1:1145984/99‑1 (MQ=255) tctTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAAc < 1:1166948/99‑1 (MQ=255) ttGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGt < 2:148731/99‑1 (MQ=255) ttGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGt < 2:983097/99‑1 (MQ=255) gAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAg < 2:263137/99‑1 (MQ=255) aaaCATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGa < 1:518939/99‑1 (MQ=255) aaCATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGaa < 1:25322/99‑1 (MQ=255) aCATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAACAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAt < 1:1517683/99‑1 (MQ=255) aCATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAt > 1:398138/1‑99 (MQ=255) aCATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAt < 2:1439528/99‑1 (MQ=255) atcatGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAttt < 1:637794/99‑1 (MQ=255) tcatGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAtttt > 1:191819/1‑99 (MQ=255) tGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAAt > 1:128558/1‑99 (MQ=255) gggAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATc > 2:275434/1‑99 (MQ=255) ggAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCt > 1:676250/1‑99 (MQ=255) gAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCta < 1:1209225/99‑1 (MQ=255) aGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtatt < 1:1003440/99‑1 (MQ=255) gATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtattt > 1:1304122/1‑99 (MQ=255) aTAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtattta > 1:1288041/1‑99 (MQ=255) tAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtatttat < 1:316558/99‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtatttatt < 1:1046409/99‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCtatttatt < 1:1293190/99‑1 (MQ=255) aaaaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTatttattt < 1:802420/99‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAtttt < 1:506685/85‑1 (MQ=255) aaaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAAtttt > 2:506685/1‑85 (MQ=255) aaTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTa > 2:73760/1‑99 (MQ=255) aTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTaa < 1:1381384/99‑1 (MQ=255) aTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTaa > 1:1391985/1‑99 (MQ=255) aTTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTGTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTaa < 1:912652/99‑1 (MQ=255) ttAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAg > 2:61607/1‑99 (MQ=255) aaGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCa < 2:1206172/99‑1 (MQ=255) aaGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCa < 1:1365155/99‑1 (MQ=255) aGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCAc < 1:1040731/99‑1 (MQ=255) aGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCAc > 1:1288130/1‑99 (MQ=255) tGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTAc > 1:1491070/1‑99 (MQ=255) gCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTAcc < 1:159677/99‑1 (MQ=255) gCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTAcc < 1:372144/99‑1 (MQ=255) gCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTAcc < 1:1400645/99‑1 (MQ=255) aGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtt < 2:1418767/99‑1 (MQ=255) gTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCttt > 2:1550650/1‑99 (MQ=255) gTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCttt > 2:1616310/1‑99 (MQ=255) gTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCttt > 1:1164311/1‑99 (MQ=255) tAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt > 1:1529355/1‑99 (MQ=255) tAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCtttt < 1:1352884/99‑1 (MQ=255) aaaGTTCTTAAGGTTTCTTGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCa > 2:468874/1‑99 (MQ=255) aaaGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCa > 2:786833/1‑99 (MQ=255) aaGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaa > 2:1001443/1‑99 (MQ=255) aGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTATCAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa < 1:345909/99‑1 (MQ=255) aGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa > 1:923432/1‑99 (MQ=255) aGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCaaa < 1:1277424/99‑1 (MQ=255) gTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt < 2:510247/99‑1 (MQ=255) gTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt > 2:1248279/1‑99 (MQ=255) gTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAt > 2:1402003/1‑99 (MQ=255) ttCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAtt > 1:355083/1‑99 (MQ=255) ttCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAAtt > 1:1545471/1‑99 (MQ=255) cTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGa > 2:814943/1‑99 (MQ=255) ttAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGAt > 2:630799/1‑99 (MQ=255) ggTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAgg > 1:744670/1‑99 (MQ=255) gTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt > 2:975558/1‑99 (MQ=255) gTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt < 1:591138/99‑1 (MQ=255) gTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgt < 2:1357322/99‑1 (MQ=255) tttCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtg > 1:536548/1‑99 (MQ=255) tttCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtg > 2:1210426/1‑99 (MQ=255) tttCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtg > 2:588380/1‑99 (MQ=255) ttCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGgtgt > 1:1317224/1‑99 (MQ=255) tctcGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTa < 1:808045/99‑1 (MQ=255) | AAGCGAAGCAAGTAAAACGTTTTGAATTTCTCTTGAAACATCATGGGAAGATAAAAATTAAGCATGCAGTAAAAGTTCTTAAGGTTTCTCGCTCAGGTGACGTTAAGTCAAGTTTTTAGAGTAACAAACGTAGAATTTTAATCTATTTATTTTAAGCACTTACCTTTTCAAATTGATTAGGTGTA > CP002094/1204351‑1204535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |